MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	ATT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017020	AGC	2	6	102	107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017020	ATT	3	9	118	126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017020	AAT	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017020	TAA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017020	AAT	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017020	ATG	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017020	GGT	2	6	322	327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017020	AAT	2	6	445	450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017020	TTA	2	6	485	490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017020	ATA	2	6	491	496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017020	CTA	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017020	CAG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017020	TAA	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017020	ATG	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017020	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017020	ATA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017020	GAA	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017020	ATG	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017020	TCT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017020	CTA	2	6	1846	1851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017020	AGT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017020	TTA	2	6	1876	1881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017020	ATA	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017020	CAC	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017020	TGC	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017020	CAA	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017020	ATG	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017020	CAT	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017020	CAA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017020	TCT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017020	TTA	2	6	2515	2520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017020	AGT	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017020	CAA	2	6	2669	2674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017020	CCA	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017020	TCC	2	6	2779	2784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017020	TAT	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017020	TGA	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017020	CAT	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017020	CTT	2	6	3372	3377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017020	ATA	3	9	3389	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017020	GAA	2	6	3476	3481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017020	GCT	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017020	ATA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017020	TTA	2	6	5272	5277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017020	CCA	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017020	ACA	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017020	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017020	ATC	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017020	TGC	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017020	TGT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017020	CTT	2	6	7056	7061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017020	GAA	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017020	ATA	2	6	7284	7289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017020	GTA	2	6	7305	7310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017020	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017020	TGA	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017020	GAA	2	6	8186	8191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017020	TAC	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017020	TCT	2	6	8304	8309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017020	TCA	3	9	8521	8529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017020	TAT	2	6	8886	8891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017020	AAT	2	6	9815	9820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017020	AAT	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017020	TAA	2	6	10611	10616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017020	ATT	2	6	10640	10645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017020	AAT	2	6	11037	11042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017020	ATA	2	6	13059	13064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017020	TCC	2	6	13170	13175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017020	TAA	2	6	13183	13188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017020	AGC	2	6	13289	13294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017020	TCT	2	6	13851	13856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017020	TGC	2	6	13943	13948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017020	CCT	2	6	14936	14941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017020	AGA	2	6	14947	14952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017020	AAC	2	6	14990	14995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017020	ACA	2	6	15012	15017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017020	TAG	2	6	15055	15060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017020	GGT	2	6	15063	15068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017020	CAA	2	6	15350	15355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017020	AGT	2	6	15358	15363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017020	AAT	2	6	15671	15676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017020	TTA	2	6	15684	15689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017020	ATT	2	6	15697	15702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017020	AAT	2	6	15704	15709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017020	TAA	2	6	16020	16025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017020	GCA	2	6	16654	16659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017020	AGG	2	6	16713	16718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017020	GTG	2	6	16812	16817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017020	AGA	2	6	17460	17465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017020	GCT	2	6	17472	17477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017020	GCA	2	6	17507	17512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017020	TAG	2	6	17533	17538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017020	AGA	3	9	17545	17553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017020	CTA	2	6	17565	17570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017020	TAA	2	6	17593	17598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017020	AAT	2	6	17640	17645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017020	TAA	2	6	17654	17659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017020	GTT	2	6	17742	17747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017020	TTA	2	6	17768	17773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017020	ATT	2	6	17790	17795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017020	AAG	2	6	17797	17802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017020	GCA	2	6	17870	17875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017020	ACA	2	6	17954	17959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017020	AGG	2	6	17986	17991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017020	TTA	2	6	18015	18020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017020	AAT	2	6	18123	18128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017020	TAT	2	6	18165	18170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017020	TCA	2	6	18289	18294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017020	AGA	2	6	18313	18318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017020	GAC	2	6	18381	18386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017020	AGC	2	6	18387	18392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017020	TAT	2	6	18487	18492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017020	ATT	2	6	18499	18504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017020	TAT	2	6	18845	18850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017020	GGT	2	6	18915	18920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017020	GAT	2	6	18987	18992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017020	TTA	2	6	19061	19066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017020	ATT	2	6	19275	19280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017020	AAG	2	6	19328	19333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017020	TGC	2	6	19394	19399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017020	TGG	2	6	19526	19531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017020	GAT	2	6	19547	19552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017020	ATC	2	6	19563	19568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017020	AGT	2	6	19743	19748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017020	TAG	2	6	19822	19827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017020	ATA	2	6	19884	19889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017020	TAG	2	6	19897	19902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017020	ATT	2	6	19959	19964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017020	TTA	2	6	19995	20000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017020	TTA	2	6	20087	20092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017020	AGC	2	6	20131	20136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017020	GTA	2	6	20139	20144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017020	TGC	3	9	20152	20160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017020	TGT	2	6	20201	20206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017020	TAG	2	6	20268	20273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017020	AGC	2	6	20300	20305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017020	CAA	2	6	20333	20338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017020	TAA	2	6	20682	20687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017020	ATC	2	6	20757	20762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017020	AGA	2	6	21060	21065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017020	AGT	2	6	22772	22777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.