MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	AT	3	6	824	829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017020	AT	3	6	983	988	50 %	50 %	0 %	0 %	383327250
3	NC_017020	GT	3	6	1300	1305	0 %	50 %	50 %	0 %	383327250
4	NC_017020	CT	3	6	1504	1509	0 %	50 %	0 %	50 %	383327250
5	NC_017020	TA	3	6	5257	5262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017020	AT	4	8	6032	6039	50 %	50 %	0 %	0 %	383327254
7	NC_017020	CT	3	6	6330	6335	0 %	50 %	0 %	50 %	383327255
8	NC_017020	AC	3	6	6638	6643	50 %	0 %	0 %	50 %	383327255
9	NC_017020	AT	3	6	6715	6720	50 %	50 %	0 %	0 %	383327255
10	NC_017020	TA	3	6	6862	6867	50 %	50 %	0 %	0 %	383327255
11	NC_017020	TC	3	6	7049	7054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017020	AT	3	6	7649	7654	50 %	50 %	0 %	0 %	383327258
13	NC_017020	TA	3	6	7748	7753	50 %	50 %	0 %	0 %	383327258
14	NC_017020	CT	3	6	8135	8140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017020	AT	3	6	8769	8774	50 %	50 %	0 %	0 %	383327260
16	NC_017020	AT	3	6	8926	8931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017020	AT	3	6	9396	9401	50 %	50 %	0 %	0 %	383327261
18	NC_017020	TA	3	6	9507	9512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017020	TA	3	6	9516	9521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017020	TA	3	6	9529	9534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017020	TA	3	6	9540	9545	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
22	NC_017020	AT	3	6	9564	9569	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
23	NC_017020	TA	3	6	9682	9687	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
24	NC_017020	AT	3	6	9795	9800	50 %	50 %	0 %	0 %	383327262
25	NC_017020	AT	3	6	9804	9809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017020	TA	3	6	9824	9829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017020	AT	3	6	9847	9852	50 %	50 %	0 %	0 %	383327263
28	NC_017020	TA	3	6	10096	10101	50 %	50 %	0 %	0 %	383327263
29	NC_017020	TA	3	6	10572	10577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017020	AT	3	6	10582	10587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017020	AT	3	6	10684	10689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017020	AT	3	6	11025	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017020	AT	3	6	11204	11209	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
34	NC_017020	AC	4	8	12043	12050	50 %	0 %	0 %	50 %	383327265
35	NC_017020	TA	3	6	12152	12157	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
36	NC_017020	TA	3	6	12199	12204	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
37	NC_017020	AT	3	6	12413	12418	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
38	NC_017020	AG	3	6	12571	12576	50 %	0 %	50 %	0 %	383327265
39	NC_017020	TA	3	6	12614	12619	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
40	NC_017020	TA	3	6	13979	13984	50 %	50 %	0 %	0 %	383327267
41	NC_017020	TA	3	6	14225	14230	50 %	50 %	0 %	0 %	383327268
42	NC_017020	AC	3	6	14279	14284	50 %	0 %	0 %	50 %	383327268
43	NC_017020	TA	3	6	14486	14491	50 %	50 %	0 %	0 %	383327268
44	NC_017020	AC	3	6	14839	14844	50 %	0 %	0 %	50 %	383327268
45	NC_017020	GA	3	6	15433	15438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017020	AT	3	6	15665	15670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017020	TA	3	6	15688	15693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017020	AT	3	6	15708	15713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017020	TA	3	6	15716	15721	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
50	NC_017020	AT	3	6	15829	15834	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
51	NC_017020	AT	3	6	15948	15953	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
52	NC_017020	TA	3	6	15972	15977	50 %	50 %	0 %	0 %	383327270
53	NC_017020	TA	3	6	15983	15988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017020	TA	3	6	15996	16001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017020	AT	3	6	16004	16009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017020	AT	3	6	16116	16121	50 %	50 %	0 %	0 %	383327271
57	NC_017020	AT	3	6	16759	16764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017020	AG	3	6	17019	17024	50 %	0 %	50 %	0 %	383327272
59	NC_017020	TA	3	6	17689	17694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017020	TA	3	6	18009	18014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017020	AT	3	6	19339	19344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017020	AT	3	6	19468	19473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017020	AT	3	6	19651	19656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017020	AG	3	6	19723	19728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017020	AT	3	6	21293	21298	50 %	50 %	0 %	0 %	383327276
66	NC_017020	AT	3	6	22310	22315	50 %	50 %	0 %	0 %	383327277
67	NC_017020	TA	3	6	23009	23014	50 %	50 %	0 %	0 %	383327278
68	NC_017020	TA	3	6	24158	24163	50 %	50 %	0 %	0 %	383327278
69	NC_017020	TC	3	6	24567	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	383327278
70	NC_017020	CT	3	6	25256	25261	0 %	50 %	0 %	50 %	383327279
71	NC_017020	AT	3	6	25584	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017020	CT	3	6	26080	26085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017020	CT	3	6	26335	26340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017020	AT	4	8	26476	26483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017020	CT	3	6	26830	26835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017020	TC	3	6	26867	26872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017020	TA	3	6	27052	27057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017020	TC	3	6	27119	27124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017020	TC	3	6	27562	27567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017020	AT	3	6	28244	28249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017020	CT	3	6	28751	28756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017020	CT	3	6	29072	29077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017020	CT	3	6	29742	29747	0 %	50 %	0 %	50 %	383327280
84	NC_017020	AT	3	6	29783	29788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017020	TA	3	6	30158	30163	50 %	50 %	0 %	0 %	383327282
86	NC_017020	AT	3	6	30777	30782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017020	AT	3	6	31480	31485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017020	AT	3	6	31910	31915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.