MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	A	6	6	359	364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017020	A	6	6	733	738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017020	T	6	6	771	776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017020	A	7	7	1228	1234	100 %	0 %	0 %	0 %	383327250
5	NC_017020	A	6	6	1420	1425	100 %	0 %	0 %	0 %	383327250
6	NC_017020	A	6	6	1978	1983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017020	T	6	6	2803	2808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017020	T	6	6	3768	3773	0 %	100 %	0 %	0 %	383327252
9	NC_017020	T	6	6	4066	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	383327252
10	NC_017020	T	8	8	4117	4124	0 %	100 %	0 %	0 %	383327252
11	NC_017020	A	6	6	4145	4150	100 %	0 %	0 %	0 %	383327252
12	NC_017020	T	6	6	6060	6065	0 %	100 %	0 %	0 %	383327254
13	NC_017020	T	6	6	6284	6289	0 %	100 %	0 %	0 %	383327255
14	NC_017020	A	6	6	6785	6790	100 %	0 %	0 %	0 %	383327255
15	NC_017020	T	8	8	8480	8487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017020	A	6	6	8545	8550	100 %	0 %	0 %	0 %	383327260
17	NC_017020	T	7	7	8968	8974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017020	A	6	6	9075	9080	100 %	0 %	0 %	0 %	383327261
19	NC_017020	A	7	7	9267	9273	100 %	0 %	0 %	0 %	383327261
20	NC_017020	A	6	6	9309	9314	100 %	0 %	0 %	0 %	383327261
21	NC_017020	A	6	6	9335	9340	100 %	0 %	0 %	0 %	383327261
22	NC_017020	T	6	6	9488	9493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017020	T	6	6	9554	9559	0 %	100 %	0 %	0 %	383327262
24	NC_017020	T	8	8	9692	9699	0 %	100 %	0 %	0 %	383327262
25	NC_017020	T	7	7	9787	9793	0 %	100 %	0 %	0 %	383327262
26	NC_017020	A	6	6	10040	10045	100 %	0 %	0 %	0 %	383327263
27	NC_017020	T	6	6	10142	10147	0 %	100 %	0 %	0 %	383327263
28	NC_017020	T	9	9	10292	10300	0 %	100 %	0 %	0 %	383327263
29	NC_017020	T	6	6	10360	10365	0 %	100 %	0 %	0 %	383327263
30	NC_017020	A	7	7	11043	11049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017020	A	6	6	11618	11623	100 %	0 %	0 %	0 %	383327265
32	NC_017020	A	6	6	12280	12285	100 %	0 %	0 %	0 %	383327265
33	NC_017020	A	7	7	13137	13143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017020	A	7	7	15332	15338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017020	A	6	6	15444	15449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017020	T	6	6	15582	15587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017020	A	7	7	15724	15730	100 %	0 %	0 %	0 %	383327270
38	NC_017020	A	8	8	15818	15825	100 %	0 %	0 %	0 %	383327270
39	NC_017020	A	6	6	15958	15963	100 %	0 %	0 %	0 %	383327270
40	NC_017020	A	6	6	16024	16029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017020	T	6	6	16177	16182	0 %	100 %	0 %	0 %	383327271
42	NC_017020	T	6	6	16203	16208	0 %	100 %	0 %	0 %	383327271
43	NC_017020	T	7	7	16244	16250	0 %	100 %	0 %	0 %	383327271
44	NC_017020	T	6	6	16437	16442	0 %	100 %	0 %	0 %	383327271
45	NC_017020	A	7	7	16543	16549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017020	A	7	7	16586	16592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017020	A	7	7	17212	17218	100 %	0 %	0 %	0 %	383327272
48	NC_017020	A	8	8	17585	17592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017020	A	6	6	17694	17699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017020	T	6	6	17837	17842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017020	A	6	6	18227	18232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017020	T	6	6	18343	18348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017020	T	6	6	18405	18410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017020	A	6	6	18730	18735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017020	A	6	6	18741	18746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017020	T	6	6	20614	20619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017020	A	7	7	20783	20789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017020	A	6	6	20860	20865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017020	A	6	6	21033	21038	100 %	0 %	0 %	0 %	383327275
60	NC_017020	T	8	8	21554	21561	0 %	100 %	0 %	0 %	383327276
61	NC_017020	A	6	6	22592	22597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017020	T	6	6	23115	23120	0 %	100 %	0 %	0 %	383327278
63	NC_017020	T	6	6	23441	23446	0 %	100 %	0 %	0 %	383327278
64	NC_017020	T	6	6	26343	26348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017020	C	6	6	26806	26811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_017020	T	6	6	28717	28722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017020	T	6	6	29123	29128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017020	A	7	7	29271	29277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017020	A	6	6	30269	30274	100 %	0 %	0 %	0 %	383327282
70	NC_017020	A	6	6	31610	31615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017020	A	7	7	31719	31725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.