MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-8

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017019	ATAA	2	8	266	273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017019	TGAC	2	8	388	395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017019	CATT	2	8	920	927	25 %	50 %	0 %	25 %	381280287
4	NC_017019	GCCA	2	8	972	979	25 %	0 %	25 %	50 %	381280287
5	NC_017019	GAAT	2	8	1638	1645	50 %	25 %	25 %	0 %	381280287
6	NC_017019	CCAG	2	8	1797	1804	25 %	0 %	25 %	50 %	381280287
7	NC_017019	TATG	2	8	1991	1998	25 %	50 %	25 %	0 %	381280287
8	NC_017019	TCAA	2	8	2714	2721	50 %	25 %	0 %	25 %	381280288
9	NC_017019	TTGA	2	8	2731	2738	25 %	50 %	25 %	0 %	381280288
10	NC_017019	GGAA	2	8	3102	3109	50 %	0 %	50 %	0 %	381280288
11	NC_017019	ATCA	2	8	3446	3453	50 %	25 %	0 %	25 %	381280288
12	NC_017019	AAAT	2	8	3506	3513	75 %	25 %	0 %	0 %	381280288
13	NC_017019	AAAT	2	8	3791	3798	75 %	25 %	0 %	0 %	381280289
14	NC_017019	TATT	2	8	3836	3843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017019	TATC	2	8	3859	3866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017019	CTGT	2	8	3956	3963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017019	AAAT	2	8	4310	4317	75 %	25 %	0 %	0 %	381280290
18	NC_017019	ATGA	2	8	4332	4339	50 %	25 %	25 %	0 %	381280290
19	NC_017019	TAAT	2	8	4403	4410	50 %	50 %	0 %	0 %	381280290
20	NC_017019	ATCA	2	8	4411	4418	50 %	25 %	0 %	25 %	381280290
21	NC_017019	GAAA	2	8	4807	4814	75 %	0 %	25 %	0 %	381280291
22	NC_017019	GTTT	2	8	5276	5283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017019	AATT	2	8	5286	5293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017019	CTAA	2	8	5304	5311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017019	TGAA	2	8	5344	5351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017019	GACC	2	8	6052	6059	25 %	0 %	25 %	50 %	381280292
27	NC_017019	GACG	2	8	6189	6196	25 %	0 %	50 %	25 %	381280292
28	NC_017019	CTTG	2	8	6275	6282	0 %	50 %	25 %	25 %	381280293
29	NC_017019	GTTT	2	8	6421	6428	0 %	75 %	25 %	0 %	381280293
30	NC_017019	AATC	2	8	6725	6732	50 %	25 %	0 %	25 %	381280293
31	NC_017019	AAAT	2	8	6922	6929	75 %	25 %	0 %	0 %	381280293
32	NC_017019	AAAC	2	8	7004	7011	75 %	0 %	0 %	25 %	381280293
33	NC_017019	TGAT	2	8	7229	7236	25 %	50 %	25 %	0 %	381280294
34	NC_017019	GATA	2	8	7519	7526	50 %	25 %	25 %	0 %	381280294
35	NC_017019	CGCC	2	8	7679	7686	0 %	0 %	25 %	75 %	381280294
36	NC_017019	GTTT	2	8	7786	7793	0 %	75 %	25 %	0 %	381280294
37	NC_017019	CTGC	2	8	8759	8766	0 %	25 %	25 %	50 %	381280295
38	NC_017019	GAAC	2	8	8895	8902	50 %	0 %	25 %	25 %	381280295
39	NC_017019	ATTT	2	8	9858	9865	25 %	75 %	0 %	0 %	381280295
40	NC_017019	TTGA	2	8	9994	10001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017019	TTAA	2	8	10021	10028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017019	ACCA	2	8	10106	10113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017019	CTCA	2	8	10245	10252	25 %	25 %	0 %	50 %	381280296
44	NC_017019	TGAT	2	8	10699	10706	25 %	50 %	25 %	0 %	381280296
45	NC_017019	CGGC	2	8	10723	10730	0 %	0 %	50 %	50 %	381280296
46	NC_017019	GTCA	2	8	10942	10949	25 %	25 %	25 %	25 %	381280296
47	NC_017019	TTTC	2	8	12227	12234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017019	GATT	2	8	12273	12280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017019	TAAT	2	8	12840	12847	50 %	50 %	0 %	0 %	381280297
50	NC_017019	GTTA	2	8	13471	13478	25 %	50 %	25 %	0 %	381280297
51	NC_017019	TAGT	2	8	13649	13656	25 %	50 %	25 %	0 %	381280297
52	NC_017019	AAAG	2	8	14049	14056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017019	ATCA	2	8	14694	14701	50 %	25 %	0 %	25 %	381280300
54	NC_017019	TCAA	2	8	14979	14986	50 %	25 %	0 %	25 %	381280300
55	NC_017019	ATTT	2	8	15526	15533	25 %	75 %	0 %	0 %	381280300
56	NC_017019	TGAT	2	8	15577	15584	25 %	50 %	25 %	0 %	381280300
57	NC_017019	AAAG	2	8	15995	16002	75 %	0 %	25 %	0 %	381280301
58	NC_017019	TGAA	2	8	16149	16156	50 %	25 %	25 %	0 %	381280302
59	NC_017019	CATT	2	8	16923	16930	25 %	50 %	0 %	25 %	381280303
60	NC_017019	GCAA	2	8	17542	17549	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017019	TTTG	2	8	18624	18631	0 %	75 %	25 %	0 %	381280304
62	NC_017019	GAAA	2	8	19250	19257	75 %	0 %	25 %	0 %	381280304
63	NC_017019	GTCA	2	8	19346	19353	25 %	25 %	25 %	25 %	381280304
64	NC_017019	AAAT	2	8	19783	19790	75 %	25 %	0 %	0 %	381280304
65	NC_017019	AATT	2	8	20407	20414	50 %	50 %	0 %	0 %	381280304
66	NC_017019	AATT	2	8	20551	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	381280304
67	NC_017019	ATCT	2	8	21356	21363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017019	ACAA	2	8	21644	21651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017019	GGTT	2	8	21675	21682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017019	CTTA	2	8	21872	21879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017019	AAGG	2	8	22089	22096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017019	TCAG	2	8	22486	22493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017019	TAGC	2	8	22516	22523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017019	ACAT	2	8	24013	24020	50 %	25 %	0 %	25 %	381280306
75	NC_017019	AGTT	2	8	25038	25045	25 %	50 %	25 %	0 %	381280307
76	NC_017019	TTTA	2	8	25086	25093	25 %	75 %	0 %	0 %	381280307
77	NC_017019	TGGC	2	8	25138	25145	0 %	25 %	50 %	25 %	381280307
78	NC_017019	AGTT	2	8	25242	25249	25 %	50 %	25 %	0 %	381280307
79	NC_017019	TTTA	2	8	25868	25875	25 %	75 %	0 %	0 %	381280309
80	NC_017019	TGCT	2	8	25922	25929	0 %	50 %	25 %	25 %	381280309
81	NC_017019	TGAT	2	8	25935	25942	25 %	50 %	25 %	0 %	381280309
82	NC_017019	TGCT	2	8	26069	26076	0 %	50 %	25 %	25 %	381280309
83	NC_017019	TGGC	2	8	26871	26878	0 %	25 %	50 %	25 %	381280309
84	NC_017019	GTTC	2	8	27794	27801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017019	ATAA	2	8	28300	28307	75 %	25 %	0 %	0 %	381280310
86	NC_017019	TTGC	2	8	28354	28361	0 %	50 %	25 %	25 %	381280310
87	NC_017019	CGTT	2	8	28776	28783	0 %	50 %	25 %	25 %	381280310
88	NC_017019	TGTT	2	8	28805	28812	0 %	75 %	25 %	0 %	381280310
89	NC_017019	TTAA	2	8	28827	28834	50 %	50 %	0 %	0 %	381280310
90	NC_017019	TTTA	2	8	28910	28917	25 %	75 %	0 %	0 %	381280310
91	NC_017019	TTAA	2	8	29001	29008	50 %	50 %	0 %	0 %	381280310
92	NC_017019	TTTC	2	8	29232	29239	0 %	75 %	0 %	25 %	381280310
93	NC_017019	ATTG	2	8	29380	29387	25 %	50 %	25 %	0 %	381280310
94	NC_017019	GTTA	2	8	29537	29544	25 %	50 %	25 %	0 %	381280310
95	NC_017019	ACCG	2	8	29817	29824	25 %	0 %	25 %	50 %	381280310
96	NC_017019	CTTT	2	8	29966	29973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017019	CAAC	2	8	30041	30048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017019	CTTT	2	8	30838	30845	0 %	75 %	0 %	25 %	381280313
99	NC_017019	TTTC	2	8	31139	31146	0 %	75 %	0 %	25 %	381280314
100	NC_017019	TGAA	2	8	31884	31891	50 %	25 %	25 %	0 %	381280315
101	NC_017019	TTCC	2	8	31904	31911	0 %	50 %	0 %	50 %	381280315
102	NC_017019	TTAC	2	8	31969	31976	25 %	50 %	0 %	25 %	381280315
103	NC_017019	CTTG	2	8	31995	32002	0 %	50 %	25 %	25 %	381280315
104	NC_017019	CATC	2	8	32207	32214	25 %	25 %	0 %	50 %	381280315
105	NC_017019	TTTC	2	8	32502	32509	0 %	75 %	0 %	25 %	381280316
106	NC_017019	CTAC	2	8	32910	32917	25 %	25 %	0 %	50 %	381280316
107	NC_017019	TTGA	2	8	33227	33234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.