MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-6

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017017	TAAA	2	8	393	400	75 %	25 %	0 %	0 %	381280266
2	NC_017017	TTTG	2	8	685	692	0 %	75 %	25 %	0 %	381280267
3	NC_017017	CTGC	2	8	856	863	0 %	25 %	25 %	50 %	381280267
4	NC_017017	TTAG	2	8	1182	1189	25 %	50 %	25 %	0 %	381280267
5	NC_017017	TTGC	2	8	1693	1700	0 %	50 %	25 %	25 %	381280267
6	NC_017017	TTTC	2	8	1939	1946	0 %	75 %	0 %	25 %	381280267
7	NC_017017	ACCG	2	8	2517	2524	25 %	0 %	25 %	50 %	381280267
8	NC_017017	CGTT	2	8	3740	3747	0 %	50 %	25 %	25 %	381280270
9	NC_017017	TCAA	2	8	3827	3834	50 %	25 %	0 %	25 %	381280270
10	NC_017017	TATC	2	8	4095	4102	25 %	50 %	0 %	25 %	381280270
11	NC_017017	AGCT	2	8	5802	5809	25 %	25 %	25 %	25 %	381280273
12	NC_017017	TAGA	2	8	6756	6763	50 %	25 %	25 %	0 %	381280274
13	NC_017017	GAAT	2	8	7302	7309	50 %	25 %	25 %	0 %	381280276
14	NC_017017	GATT	2	8	7670	7677	25 %	50 %	25 %	0 %	381280276
15	NC_017017	TCAA	2	8	7832	7839	50 %	25 %	0 %	25 %	381280276
16	NC_017017	AAAG	2	8	7859	7866	75 %	0 %	25 %	0 %	381280276
17	NC_017017	TTAT	2	8	8026	8033	25 %	75 %	0 %	0 %	381280277
18	NC_017017	TGCG	2	8	8382	8389	0 %	25 %	50 %	25 %	381280277
19	NC_017017	TTCA	2	8	8434	8441	25 %	50 %	0 %	25 %	381280277
20	NC_017017	ACTC	2	8	8560	8567	25 %	25 %	0 %	50 %	381280277
21	NC_017017	TAAG	2	8	9324	9331	50 %	25 %	25 %	0 %	381280279
22	NC_017017	GTTA	2	8	9391	9398	25 %	50 %	25 %	0 %	381280279
23	NC_017017	AAAG	2	8	9499	9506	75 %	0 %	25 %	0 %	381280279
24	NC_017017	TATC	2	8	9668	9675	25 %	50 %	0 %	25 %	381280279
25	NC_017017	AATT	2	8	9822	9829	50 %	50 %	0 %	0 %	381280279
26	NC_017017	CAAT	2	8	10395	10402	50 %	25 %	0 %	25 %	381280279
27	NC_017017	AAAC	2	8	10523	10530	75 %	0 %	0 %	25 %	381280279
28	NC_017017	AAGA	2	8	10734	10741	75 %	0 %	25 %	0 %	381280279
29	NC_017017	GTAT	2	8	11238	11245	25 %	50 %	25 %	0 %	381280279
30	NC_017017	AAAT	2	8	11479	11486	75 %	25 %	0 %	0 %	381280279
31	NC_017017	GAGC	2	8	11751	11758	25 %	0 %	50 %	25 %	381280279
32	NC_017017	TTCT	2	8	11766	11773	0 %	75 %	0 %	25 %	381280279
33	NC_017017	TTTC	2	8	13211	13218	0 %	75 %	0 %	25 %	381280280
34	NC_017017	TTAA	2	8	13226	13233	50 %	50 %	0 %	0 %	381280280
35	NC_017017	GTTT	2	8	13262	13269	0 %	75 %	25 %	0 %	381280280
36	NC_017017	AAAT	2	8	13492	13499	75 %	25 %	0 %	0 %	381280280
37	NC_017017	TTCT	2	8	13610	13617	0 %	75 %	0 %	25 %	381280280
38	NC_017017	TCAA	2	8	13883	13890	50 %	25 %	0 %	25 %	381280280
39	NC_017017	GTAT	2	8	13992	13999	25 %	50 %	25 %	0 %	381280280
40	NC_017017	CAAT	2	8	14079	14086	50 %	25 %	0 %	25 %	381280280
41	NC_017017	AAAT	2	8	14116	14123	75 %	25 %	0 %	0 %	381280280
42	NC_017017	TTAA	2	8	14716	14723	50 %	50 %	0 %	0 %	381280281
43	NC_017017	CAAT	2	8	15044	15051	50 %	25 %	0 %	25 %	381280281
44	NC_017017	AAGG	2	8	15430	15437	50 %	0 %	50 %	0 %	381280281
45	NC_017017	TGTT	2	8	15627	15634	0 %	75 %	25 %	0 %	381280282
46	NC_017017	ATTA	2	8	15787	15794	50 %	50 %	0 %	0 %	381280282
47	NC_017017	TAAT	2	8	16445	16452	50 %	50 %	0 %	0 %	381280283
48	NC_017017	AAAG	2	8	16941	16948	75 %	0 %	25 %	0 %	381280283
49	NC_017017	ATTA	2	8	17268	17275	50 %	50 %	0 %	0 %	381280284
50	NC_017017	ATGG	2	8	17393	17400	25 %	25 %	50 %	0 %	381280284
51	NC_017017	AGCC	2	8	17788	17795	25 %	0 %	25 %	50 %	381280284
52	NC_017017	TAAA	2	8	18586	18593	75 %	25 %	0 %	0 %	381280285

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.