MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	GGAACC	2	12	291	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
2	NC_016972	ACCCGC	2	12	3375	3386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386836024
3	NC_016972	GCCCTG	2	12	10762	10773	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836031
4	NC_016972	TGGCCG	2	12	12702	12713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386836033
5	NC_016972	CACCGG	2	12	19599	19610	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386836039
6	NC_016972	CATCTC	2	12	21654	21665	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386836043
7	NC_016972	CCGGCC	2	12	23055	23066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836044
8	NC_016972	GGGCAG	2	12	24996	25007	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836046
9	NC_016972	GGGACG	2	12	25643	25654	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836047
10	NC_016972	CGGGAG	2	12	27093	27104	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836051
11	NC_016972	GACGCC	2	12	29561	29572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386836053
12	NC_016972	CTGAAG	2	12	29687	29698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386836053
13	NC_016972	GGTCGA	2	12	31039	31050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386836053
14	NC_016972	AGGAAG	2	12	31853	31864	50 %	0 %	50 %	0 %	386836054
15	NC_016972	AACCCG	2	12	32236	32247	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386836054
16	NC_016972	CTCCGA	2	12	33068	33079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386836055
17	NC_016972	CTCCAG	2	12	34016	34027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386836056
18	NC_016972	CTCGGC	2	12	36126	36137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836058
19	NC_016972	CTCGCG	2	12	38916	38927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836058
20	NC_016972	CGGCAC	2	12	39710	39721	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386836058
21	NC_016972	ACGGGG	2	12	41389	41400	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386836060
22	NC_016972	TCCCCG	2	12	41540	41551	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386836060
23	NC_016972	GCCTCG	2	12	42828	42839	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836063
24	NC_016972	CACGGT	2	12	44705	44716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386836066
25	NC_016972	GGCCTG	2	12	45594	45605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386836068
26	NC_016972	CCTCGG	2	12	46031	46042	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836068
27	NC_016972	GGTCGG	2	12	46253	46264	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386836068
28	NC_016972	TCGCCA	2	12	53527	53538	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386836075
29	NC_016972	GGCGCG	2	12	55551	55562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836078
30	NC_016972	CCACGG	2	12	55812	55823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386836078
31	NC_016972	TCGGCC	2	12	60022	60033	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836081
32	NC_016972	CGCTCG	2	12	61137	61148	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386836082
33	NC_016972	GCCGAC	2	12	62473	62484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386836083
34	NC_016972	GCTCGG	2	12	63401	63412	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386836085
35	NC_016972	GGAACT	2	12	63665	63676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386836085
36	NC_016972	GCGGTG	2	12	64774	64785	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386836087
37	NC_016972	TCGTGG	2	12	66376	66387	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386836088
38	NC_016972	GGCGCC	2	12	66653	66664	0 %	0 %	50 %	50 %	386836088
39	NC_016972	CAGGAG	2	12	68162	68173	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386836091
40	NC_016972	CCTCCG	2	12	68178	68189	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386836091
41	NC_016972	CGGTGA	2	12	69611	69622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386836093
42	NC_016972	CGAAGC	2	12	69857	69868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836093
43	NC_016972	CGGCAG	2	12	71278	71289	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386836095
44	NC_016972	GTGGAG	2	12	71884	71895	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386836096

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.