MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	GCTCG	2	10	2133	2142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016972	CTGAG	2	10	2275	2284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016972	CTCGG	2	10	2462	2471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016972	CCTGG	2	10	2594	2603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016972	CACGA	2	10	4814	4823	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016972	GGGTC	2	10	5463	5472	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016972	TCCGC	2	10	6836	6845	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016972	GCCGC	2	10	7148	7157	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016972	AAGAC	2	10	10588	10597	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016972	GAAGG	2	10	16609	16618	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016972	CACGC	2	10	17591	17600	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_016972	GTCCC	2	10	32414	32423	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016972	CCCCA	2	10	40328	40337	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_016972	TGCGC	2	10	40349	40358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016972	CGCGG	2	10	40498	40507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016972	GCGGT	2	10	46417	46426	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016972	CATTG	2	10	47721	47730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016972	TCCCT	2	10	48485	48494	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016972	GGGAG	2	10	50092	50101	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016972	CACAC	2	10	56916	56925	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_016972	CCGGG	2	10	60902	60911	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016972	AGGGG	2	10	62155	62164	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016972	TCGTG	2	10	65250	65259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016972	GCGCG	2	10	70008	70017	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.