MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	CCCGC	2	10	275	284	0 %	0 %	20 %	80 %	386836022
2	NC_016972	CTCGG	2	10	946	955	0 %	20 %	40 %	40 %	386836022
3	NC_016972	GCCGC	2	10	3808	3817	0 %	0 %	40 %	60 %	386836024
4	NC_016972	TCCAC	2	10	4033	4042	20 %	20 %	0 %	60 %	386836024
5	NC_016972	CACTC	2	10	4117	4126	20 %	20 %	0 %	60 %	386836024
6	NC_016972	GGGCA	2	10	6351	6360	20 %	0 %	60 %	20 %	386836026
7	NC_016972	CCGGG	2	10	7226	7235	0 %	0 %	60 %	40 %	386836027
8	NC_016972	GGCCG	2	10	9234	9243	0 %	0 %	60 %	40 %	386836028
9	NC_016972	CCGGT	2	10	9986	9995	0 %	20 %	40 %	40 %	386836029
10	NC_016972	CCGGC	2	10	11655	11664	0 %	0 %	40 %	60 %	386836032
11	NC_016972	CCCGG	2	10	11734	11743	0 %	0 %	40 %	60 %	386836032
12	NC_016972	CTGCG	2	10	11916	11925	0 %	20 %	40 %	40 %	386836032
13	NC_016972	GCCTG	2	10	12897	12906	0 %	20 %	40 %	40 %	386836033
14	NC_016972	TCTGT	2	10	12908	12917	0 %	60 %	20 %	20 %	386836033
15	NC_016972	CGCGC	2	10	14994	15003	0 %	0 %	40 %	60 %	386836035
16	NC_016972	CCGGT	2	10	17313	17322	0 %	20 %	40 %	40 %	386836037
17	NC_016972	GCCGG	2	10	20545	20554	0 %	0 %	60 %	40 %	386836041
18	NC_016972	CGGTG	2	10	21067	21076	0 %	20 %	60 %	20 %	386836042
19	NC_016972	CTGTC	2	10	22302	22311	0 %	40 %	20 %	40 %	386836043
20	NC_016972	GTGAG	2	10	23433	23442	20 %	20 %	60 %	0 %	386836045
21	NC_016972	GCGAG	2	10	27355	27364	20 %	0 %	60 %	20 %	386836052
22	NC_016972	TCGAC	2	10	29379	29388	20 %	20 %	20 %	40 %	386836053
23	NC_016972	CGCCC	2	10	29926	29935	0 %	0 %	20 %	80 %	386836053
24	NC_016972	GCGCC	2	10	30163	30172	0 %	0 %	40 %	60 %	386836053
25	NC_016972	GCCCG	2	10	31399	31408	0 %	0 %	40 %	60 %	386836053
26	NC_016972	GCGCT	2	10	33450	33459	0 %	20 %	40 %	40 %	386836055
27	NC_016972	GGCGG	2	10	34602	34611	0 %	0 %	80 %	20 %	386836057
28	NC_016972	GCTCG	2	10	34853	34862	0 %	20 %	40 %	40 %	386836058
29	NC_016972	GGCGC	2	10	38427	38436	0 %	0 %	60 %	40 %	386836058
30	NC_016972	CCAGC	2	10	38811	38820	20 %	0 %	20 %	60 %	386836058
31	NC_016972	GCAGC	2	10	39251	39260	20 %	0 %	40 %	40 %	386836058
32	NC_016972	GCCCG	2	10	40831	40840	0 %	0 %	40 %	60 %	386836059
33	NC_016972	GCCGC	2	10	41139	41148	0 %	0 %	40 %	60 %	386836059
34	NC_016972	CGGGG	2	10	41471	41480	0 %	0 %	80 %	20 %	386836060
35	NC_016972	CGCGC	2	10	42843	42852	0 %	0 %	40 %	60 %	386836063
36	NC_016972	TGCGC	2	10	42912	42921	0 %	20 %	40 %	40 %	386836063
37	NC_016972	CGGGC	2	10	43807	43816	0 %	0 %	60 %	40 %	386836064
38	NC_016972	TGGTC	2	10	44392	44401	0 %	40 %	40 %	20 %	386836066
39	NC_016972	GCCCG	2	10	46279	46288	0 %	0 %	40 %	60 %	386836068
40	NC_016972	CGGCC	2	10	46915	46924	0 %	0 %	40 %	60 %	386836069
41	NC_016972	TCGCG	2	10	48307	48316	0 %	20 %	40 %	40 %	386836070
42	NC_016972	CGGTC	2	10	48338	48347	0 %	20 %	40 %	40 %	386836070
43	NC_016972	AGCTC	2	10	51186	51195	20 %	20 %	20 %	40 %	386836074
44	NC_016972	CTGCG	2	10	54660	54669	0 %	20 %	40 %	40 %	386836076
45	NC_016972	GCGGT	2	10	54819	54828	0 %	20 %	60 %	20 %	386836076
46	NC_016972	GTCGT	2	10	56359	56368	0 %	40 %	40 %	20 %	386836078
47	NC_016972	GTGCC	2	10	57901	57910	0 %	20 %	40 %	40 %	386836079
48	NC_016972	CGTCC	2	10	58149	58158	0 %	20 %	20 %	60 %	386836079
49	NC_016972	GGGCG	2	10	58761	58770	0 %	0 %	80 %	20 %	386836080
50	NC_016972	CTGCG	2	10	58805	58814	0 %	20 %	40 %	40 %	386836080
51	NC_016972	CGGCC	2	10	59101	59110	0 %	0 %	40 %	60 %	386836080
52	NC_016972	GGTCG	2	10	63306	63315	0 %	20 %	60 %	20 %	386836085
53	NC_016972	CAGGG	2	10	64605	64614	20 %	0 %	60 %	20 %	386836087
54	NC_016972	CGCTG	2	10	69066	69075	0 %	20 %	40 %	40 %	386836092
55	NC_016972	CCGGG	2	10	72770	72779	0 %	0 %	60 %	40 %	386836096

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.