MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 1464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	ACC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836022
2	NC_016972	GCC	2	6	93	98	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836022
3	NC_016972	TGC	2	6	173	178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
4	NC_016972	TCC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
5	NC_016972	TGG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
6	NC_016972	GAC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
7	NC_016972	GGC	2	6	386	391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
8	NC_016972	GGC	2	6	398	403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
9	NC_016972	CGG	2	6	411	416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
10	NC_016972	GTG	2	6	423	428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
11	NC_016972	CTC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
12	NC_016972	GCG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
13	NC_016972	GGT	2	6	455	460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
14	NC_016972	TCG	3	9	514	522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
15	NC_016972	CGG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
16	NC_016972	CGG	2	6	549	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
17	NC_016972	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
18	NC_016972	CCG	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836022
19	NC_016972	ACC	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836022
20	NC_016972	GCC	2	6	648	653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836022
21	NC_016972	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836022
22	NC_016972	GGC	2	6	714	719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
23	NC_016972	GGT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
24	NC_016972	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
25	NC_016972	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
26	NC_016972	TGG	2	6	975	980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
27	NC_016972	TGA	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836022
28	NC_016972	TCG	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
29	NC_016972	GCG	3	9	1064	1072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
30	NC_016972	CGG	2	6	1079	1084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
31	NC_016972	ACG	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
32	NC_016972	GCA	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
33	NC_016972	CGG	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
34	NC_016972	CCT	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
35	NC_016972	CCT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
36	NC_016972	GAG	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836022
37	NC_016972	GCT	2	6	1641	1646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016972	TCC	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016972	TAC	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016972	GCT	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016972	TGC	2	6	1813	1818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016972	CGT	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016972	TGG	2	6	2033	2038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016972	CTG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016972	CGG	2	6	2351	2356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016972	TGG	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016972	CAG	2	6	2415	2420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016972	GGA	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016972	GCT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836023
50	NC_016972	CCG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836023
51	NC_016972	CCT	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836023
52	NC_016972	GAC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836023
53	NC_016972	GGC	2	6	3103	3108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836023
54	NC_016972	CGG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836023
55	NC_016972	CGT	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836023
56	NC_016972	GCA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836023
57	NC_016972	CAG	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
58	NC_016972	TTC	2	6	3527	3532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836024
59	NC_016972	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836024
60	NC_016972	CTG	3	9	3710	3718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836024
61	NC_016972	GCC	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
62	NC_016972	TTC	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836024
63	NC_016972	CCT	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
64	NC_016972	TCC	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
65	NC_016972	CCG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
66	NC_016972	CCT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
67	NC_016972	CCA	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836024
68	NC_016972	CGT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836024
69	NC_016972	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
70	NC_016972	CGG	2	6	4108	4113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836024
71	NC_016972	TCC	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
72	NC_016972	GCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
73	NC_016972	CAG	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
74	NC_016972	ACG	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
75	NC_016972	GGT	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836024
76	NC_016972	CCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
77	NC_016972	GTC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836024
78	NC_016972	GCC	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
79	NC_016972	ATG	2	6	4686	4691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016972	GGA	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016972	CCT	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016972	TCC	2	6	5111	5116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016972	GTG	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016972	GGT	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836025
85	NC_016972	TGA	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836025
86	NC_016972	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836025
87	NC_016972	ATC	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836025
88	NC_016972	GCC	2	6	5402	5407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016972	GCC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016972	ACC	2	6	5518	5523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016972	GCT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016972	TCC	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016972	GAG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016972	GCT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836026
95	NC_016972	CAC	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836026
96	NC_016972	GAG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836026
97	NC_016972	GGC	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836026
98	NC_016972	GCG	2	6	6155	6160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836026
99	NC_016972	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836026
100	NC_016972	CAG	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836026
101	NC_016972	GCC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
102	NC_016972	GCC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
103	NC_016972	GAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836026
104	NC_016972	CCG	2	6	6486	6491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
105	NC_016972	TTC	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836026
106	NC_016972	CCG	3	9	6544	6552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
107	NC_016972	GGA	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836026
108	NC_016972	TGC	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836026
109	NC_016972	GAG	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836026
110	NC_016972	CAG	3	9	6741	6749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836026
111	NC_016972	CCA	2	6	6870	6875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016972	TGG	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016972	CGA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016972	CTG	2	6	7014	7019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016972	TCC	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016972	GGC	2	6	7112	7117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016972	GTC	2	6	7165	7170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016972	GCG	2	6	7258	7263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
119	NC_016972	TGC	2	6	7270	7275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836027
120	NC_016972	CCG	2	6	7308	7313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836027
121	NC_016972	TCC	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836027
122	NC_016972	GCG	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
123	NC_016972	GGC	2	6	7438	7443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
124	NC_016972	AGG	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836027
125	NC_016972	CAG	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836027
126	NC_016972	CAC	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836027
127	NC_016972	TGG	3	9	7603	7611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836027
128	NC_016972	CGG	2	6	7699	7704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
129	NC_016972	CCT	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836027
130	NC_016972	GCC	2	6	7746	7751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836027
131	NC_016972	CGT	2	6	7780	7785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836027
132	NC_016972	TCG	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836027
133	NC_016972	GGC	2	6	7939	7944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
134	NC_016972	GAG	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836027
135	NC_016972	TGG	2	6	8004	8009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836027
136	NC_016972	GGC	2	6	8047	8052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
137	NC_016972	GGT	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836027
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139	NC_016972	AGC	2	6	8145	8150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836027
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141	NC_016972	CAG	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016972	TCC	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836028
143	NC_016972	GGA	2	6	8372	8377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836028
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164	NC_016972	ACG	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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229	NC_016972	GTT	2	6	12496	12501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
230	NC_016972	AGT	2	6	12564	12569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
231	NC_016972	GGT	2	6	12613	12618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836033
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256	NC_016972	CCG	2	6	13828	13833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836034
257	NC_016972	GCA	2	6	13859	13864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836034
258	NC_016972	GCC	2	6	13876	13881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836034
259	NC_016972	CGG	2	6	13934	13939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836034
260	NC_016972	CCT	2	6	14030	14035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_016972	GCT	2	6	14036	14041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_016972	AGG	2	6	14069	14074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016972	ACA	2	6	14154	14159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_016972	GGC	2	6	14373	14378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836035
265	NC_016972	GGC	2	6	14394	14399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836035
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269	NC_016972	GGT	2	6	14541	14546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836035
270	NC_016972	TCA	2	6	14631	14636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836035
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294	NC_016972	GGC	2	6	16584	16589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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388	NC_016972	CGC	2	6	21380	21385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836042
389	NC_016972	GGC	2	6	21395	21400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
390	NC_016972	GCT	2	6	21445	21450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
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393	NC_016972	TGC	2	6	21667	21672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836043
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420	NC_016972	CCG	2	6	23130	23135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836044
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429	NC_016972	GGA	2	6	23614	23619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836045
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435	NC_016972	CGA	2	6	23931	23936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
436	NC_016972	CGG	2	6	24022	24027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
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438	NC_016972	CGG	2	6	24038	24043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
439	NC_016972	CGA	2	6	24201	24206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
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472	NC_016972	TGG	2	6	25477	25482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_016972	CTG	2	6	26015	26020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836048
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489	NC_016972	GGC	2	6	26093	26098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836048
490	NC_016972	CGG	2	6	26113	26118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836048
491	NC_016972	GGC	2	6	26129	26134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836048
492	NC_016972	CAG	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836050
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496	NC_016972	TGA	2	6	26373	26378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836050
497	NC_016972	GTC	2	6	26425	26430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836050
498	NC_016972	GGC	3	9	26549	26557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836049
499	NC_016972	GGA	2	6	26864	26869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836051
500	NC_016972	TGA	2	6	27004	27009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836051

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