MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-64 chromosome

Total Repeats: 4759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016948	ACCAC	2	10	1417	1426	40 %	0 %	0 %	60 %	379759438
2	NC_016948	CGCAA	2	10	1438	1447	40 %	0 %	20 %	40 %	379759438
3	NC_016948	GGCCG	2	10	3016	3025	0 %	0 %	60 %	40 %	379759439
4	NC_016948	CCGGG	2	10	3197	3206	0 %	0 %	60 %	40 %	379759439
5	NC_016948	CTCGA	2	10	4261	4270	20 %	20 %	20 %	40 %	379759440
6	NC_016948	GCGCC	2	10	4275	4284	0 %	0 %	40 %	60 %	379759440
7	NC_016948	GCACC	2	10	5994	6003	20 %	0 %	20 %	60 %	379759442
8	NC_016948	GAAGT	2	10	6388	6397	40 %	20 %	40 %	0 %	379759442
9	NC_016948	GCAGC	2	10	6972	6981	20 %	0 %	40 %	40 %	379759442
10	NC_016948	GCAGC	2	10	7407	7416	20 %	0 %	40 %	40 %	379759443
11	NC_016948	GGGCA	2	10	7669	7678	20 %	0 %	60 %	20 %	379759443
12	NC_016948	CAAGC	2	10	8626	8635	40 %	0 %	20 %	40 %	379759443
13	NC_016948	CGGGC	2	10	9847	9856	0 %	0 %	60 %	40 %	379759443
14	NC_016948	CGCGG	2	10	11152	11161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016948	CGAGG	2	10	11489	11498	20 %	0 %	60 %	20 %	379759444
16	NC_016948	CCGCA	2	10	11649	11658	20 %	0 %	20 %	60 %	379759444
17	NC_016948	GCATC	2	10	13397	13406	20 %	20 %	20 %	40 %	379759446
18	NC_016948	CGCTC	2	10	13526	13535	0 %	20 %	20 %	60 %	379759446
19	NC_016948	CCGCG	2	10	14315	14324	0 %	0 %	40 %	60 %	379759446
20	NC_016948	TCCCG	2	10	18165	18174	0 %	20 %	20 %	60 %	379759453
21	NC_016948	CCAGC	2	10	18271	18280	20 %	0 %	20 %	60 %	379759453
22	NC_016948	GTTGC	2	10	18487	18496	0 %	40 %	40 %	20 %	379759453
23	NC_016948	GCCGG	2	10	20294	20303	0 %	0 %	60 %	40 %	379759454
24	NC_016948	GGCCC	2	10	20412	20421	0 %	0 %	40 %	60 %	379759454
25	NC_016948	GGCGG	2	10	20441	20450	0 %	0 %	80 %	20 %	379759454
26	NC_016948	CGGCG	2	10	21329	21338	0 %	0 %	60 %	40 %	379759455
27	NC_016948	TTAGC	2	10	21562	21571	20 %	40 %	20 %	20 %	379759455
28	NC_016948	CGGCG	2	10	22019	22028	0 %	0 %	60 %	40 %	379759455
29	NC_016948	GGGGC	2	10	23500	23509	0 %	0 %	80 %	20 %	379759456
30	NC_016948	AGACC	2	10	23706	23715	40 %	0 %	20 %	40 %	379759456
31	NC_016948	GCTGA	2	10	23848	23857	20 %	20 %	40 %	20 %	379759456
32	NC_016948	TGGGG	2	10	24196	24205	0 %	20 %	80 %	0 %	379759457
33	NC_016948	CCAAT	2	10	25340	25349	40 %	20 %	0 %	40 %	379759457
34	NC_016948	CTGCG	2	10	25419	25428	0 %	20 %	40 %	40 %	379759457
35	NC_016948	AGGGC	2	10	28119	28128	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016948	ATCGC	2	10	28430	28439	20 %	20 %	20 %	40 %	379759460
37	NC_016948	CAGCG	2	10	29335	29344	20 %	0 %	40 %	40 %	379759462
38	NC_016948	GCGAT	2	10	30277	30286	20 %	20 %	40 %	20 %	379759464
39	NC_016948	TCGGC	2	10	32325	32334	0 %	20 %	40 %	40 %	379759465
40	NC_016948	AGGCG	2	10	33506	33515	20 %	0 %	60 %	20 %	379759466
41	NC_016948	CAGAA	2	10	33979	33988	60 %	0 %	20 %	20 %	379759466
42	NC_016948	CTTTC	2	10	35406	35415	0 %	60 %	0 %	40 %	379759468
43	NC_016948	CAGCG	2	10	37449	37458	20 %	0 %	40 %	40 %	379759469
44	NC_016948	CCAAA	2	10	38298	38307	60 %	0 %	0 %	40 %	379759470
45	NC_016948	CGGCG	2	10	38751	38760	0 %	0 %	60 %	40 %	379759471
46	NC_016948	ACCGG	2	10	38762	38771	20 %	0 %	40 %	40 %	379759471
47	NC_016948	CAGCG	2	10	40260	40269	20 %	0 %	40 %	40 %	379759473
48	NC_016948	CCGTC	2	10	42221	42230	0 %	20 %	20 %	60 %	379759475
49	NC_016948	GGCCG	2	10	43791	43800	0 %	0 %	60 %	40 %	379759478
50	NC_016948	AGCCA	2	10	44476	44485	40 %	0 %	20 %	40 %	379759478
51	NC_016948	CTGCG	2	10	45080	45089	0 %	20 %	40 %	40 %	379759479
52	NC_016948	GTCGG	2	10	45942	45951	0 %	20 %	60 %	20 %	379759480
53	NC_016948	TTGTC	2	10	48129	48138	0 %	60 %	20 %	20 %	379759482
54	NC_016948	GCCGG	2	10	48792	48801	0 %	0 %	60 %	40 %	379759484
55	NC_016948	GGGTG	2	10	52999	53008	0 %	20 %	80 %	0 %	379759486
56	NC_016948	CGGTG	2	10	54697	54706	0 %	20 %	60 %	20 %	379759488
57	NC_016948	TCGCC	2	10	56897	56906	0 %	20 %	20 %	60 %	379759490
58	NC_016948	GGGGT	2	10	57301	57310	0 %	20 %	80 %	0 %	379759490
59	NC_016948	GCGAC	2	10	59120	59129	20 %	0 %	40 %	40 %	379759492
60	NC_016948	CGGCG	2	10	59139	59148	0 %	0 %	60 %	40 %	379759492
61	NC_016948	TCGGC	2	10	60874	60883	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016948	CGGTG	2	10	61663	61672	0 %	20 %	60 %	20 %	379759494
63	NC_016948	GCGCG	2	10	62085	62094	0 %	0 %	60 %	40 %	379759494
64	NC_016948	CAGCG	2	10	62104	62113	20 %	0 %	40 %	40 %	379759494
65	NC_016948	CAGGT	2	10	63969	63978	20 %	20 %	40 %	20 %	379759496
66	NC_016948	GGCCC	2	10	67022	67031	0 %	0 %	40 %	60 %	379759499
67	NC_016948	ATCGT	2	10	68554	68563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016948	GCGCC	2	10	70573	70582	0 %	0 %	40 %	60 %	379759504
69	NC_016948	GCGCG	2	10	71077	71086	0 %	0 %	60 %	40 %	379759504
70	NC_016948	CTGGC	2	10	73285	73294	0 %	20 %	40 %	40 %	379759505
71	NC_016948	ACGCG	2	10	73669	73678	20 %	0 %	40 %	40 %	379759505
72	NC_016948	CATGA	2	10	74321	74330	40 %	20 %	20 %	20 %	379759505
73	NC_016948	GCGTC	2	10	76214	76223	0 %	20 %	40 %	40 %	379759509
74	NC_016948	GACGG	2	10	78196	78205	20 %	0 %	60 %	20 %	379759511
75	NC_016948	TGCCG	2	10	81321	81330	0 %	20 %	40 %	40 %	379759513
76	NC_016948	CGGCG	2	10	84334	84343	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016948	TCATA	2	10	84843	84852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016948	GGGCC	2	10	87575	87584	0 %	0 %	60 %	40 %	379759520
79	NC_016948	GCAGC	2	10	93102	93111	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016948	GCTGC	2	10	94028	94037	0 %	20 %	40 %	40 %	379759528
81	NC_016948	TCTGC	2	10	95425	95434	0 %	40 %	20 %	40 %	379759529
82	NC_016948	CGACG	2	10	95710	95719	20 %	0 %	40 %	40 %	379759529
83	NC_016948	CGGCA	2	10	96130	96139	20 %	0 %	40 %	40 %	379759529
84	NC_016948	GCATG	2	10	96423	96432	20 %	20 %	40 %	20 %	379759530
85	NC_016948	CGCAA	2	10	97523	97532	40 %	0 %	20 %	40 %	379759532
86	NC_016948	ACGGC	2	10	97718	97727	20 %	0 %	40 %	40 %	379759532
87	NC_016948	CGCGA	2	10	100162	100171	20 %	0 %	40 %	40 %	379759534
88	NC_016948	GCGTC	2	10	103474	103483	0 %	20 %	40 %	40 %	379759539
89	NC_016948	CTCGC	2	10	103792	103801	0 %	20 %	20 %	60 %	379759540
90	NC_016948	CCGTG	2	10	104671	104680	0 %	20 %	40 %	40 %	379759541
91	NC_016948	CATGC	2	10	105323	105332	20 %	20 %	20 %	40 %	379759541
92	NC_016948	CGGTC	2	10	108991	109000	0 %	20 %	40 %	40 %	379759544
93	NC_016948	CGGCC	2	10	110909	110918	0 %	0 %	40 %	60 %	379759546
94	NC_016948	GGCCT	2	10	111554	111563	0 %	20 %	40 %	40 %	379759547
95	NC_016948	GCTGG	2	10	112919	112928	0 %	20 %	60 %	20 %	379759548
96	NC_016948	GCACG	2	10	113141	113150	20 %	0 %	40 %	40 %	379759548
97	NC_016948	CCGCG	2	10	113870	113879	0 %	0 %	40 %	60 %	379759549
98	NC_016948	CGACG	2	10	114500	114509	20 %	0 %	40 %	40 %	379759550
99	NC_016948	GCGTG	2	10	116907	116916	0 %	20 %	60 %	20 %	379759554
100	NC_016948	GCCAG	2	10	117261	117270	20 %	0 %	40 %	40 %	379759554
101	NC_016948	ATCCT	2	10	117909	117918	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016948	GGGCC	2	10	118731	118740	0 %	0 %	60 %	40 %	379759557
103	NC_016948	CGGGC	2	10	118892	118901	0 %	0 %	60 %	40 %	379759558
104	NC_016948	CCTGG	2	10	119048	119057	0 %	20 %	40 %	40 %	379759558
105	NC_016948	CCATG	2	10	119171	119180	20 %	20 %	20 %	40 %	379759558
106	NC_016948	GCCAG	2	10	121777	121786	20 %	0 %	40 %	40 %	379759560
107	NC_016948	TCGAC	2	10	122179	122188	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016948	ACCAA	2	10	122608	122617	60 %	0 %	0 %	40 %	379759561
109	NC_016948	GCCCG	2	10	122707	122716	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_016948	CATCG	2	10	123785	123794	20 %	20 %	20 %	40 %	379759562
111	NC_016948	GTCGA	2	10	125170	125179	20 %	20 %	40 %	20 %	379759563
112	NC_016948	GTCCG	2	10	125304	125313	0 %	20 %	40 %	40 %	379759563
113	NC_016948	GGACA	2	10	128540	128549	40 %	0 %	40 %	20 %	379759567
114	NC_016948	GCGCC	2	10	129190	129199	0 %	0 %	40 %	60 %	379759567
115	NC_016948	TGCGG	2	10	129611	129620	0 %	20 %	60 %	20 %	379759567
116	NC_016948	ACAGC	2	10	131152	131161	40 %	0 %	20 %	40 %	379759569
117	NC_016948	TCAGC	2	10	132353	132362	20 %	20 %	20 %	40 %	379759570
118	NC_016948	CGGGG	2	10	135825	135834	0 %	0 %	80 %	20 %	379759573
119	NC_016948	TCGAT	2	10	136641	136650	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016948	CGCGG	2	10	138141	138150	0 %	0 %	60 %	40 %	379759575
121	NC_016948	CCATC	2	10	138443	138452	20 %	20 %	0 %	60 %	379759576
122	NC_016948	CTCGA	2	10	139082	139091	20 %	20 %	20 %	40 %	379759578
123	NC_016948	CAGGG	2	10	139370	139379	20 %	0 %	60 %	20 %	379759578
124	NC_016948	ACCCG	2	10	140276	140285	20 %	0 %	20 %	60 %	379759579
125	NC_016948	TCACC	2	10	140810	140819	20 %	20 %	0 %	60 %	379759580
126	NC_016948	GGATT	2	10	141794	141803	20 %	40 %	40 %	0 %	379759581
127	NC_016948	CCGCG	2	10	146594	146603	0 %	0 %	40 %	60 %	379759587
128	NC_016948	GCCGC	2	10	147147	147156	0 %	0 %	40 %	60 %	379759587
129	NC_016948	CCGGC	2	10	148307	148316	0 %	0 %	40 %	60 %	379759588
130	NC_016948	TCGCG	2	10	148599	148608	0 %	20 %	40 %	40 %	379759589
131	NC_016948	GTCCC	2	10	149451	149460	0 %	20 %	20 %	60 %	379759589
132	NC_016948	TCGGC	2	10	149532	149541	0 %	20 %	40 %	40 %	379759589
133	NC_016948	GCCGC	2	10	150966	150975	0 %	0 %	40 %	60 %	379759591
134	NC_016948	CCGCG	2	10	151502	151511	0 %	0 %	40 %	60 %	379759591
135	NC_016948	CACTA	2	10	152260	152269	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016948	CCTCG	2	10	152565	152574	0 %	20 %	20 %	60 %	379759592
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256	NC_016948	GTTCC	2	10	292721	292730	0 %	40 %	20 %	40 %	379759724
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