MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-02 chromosome

Total Repeats: 3319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016947	CGCTGC	2	12	906046	906057	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379752935
502	NC_016947	TCGACC	2	12	908647	908658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379752938
503	NC_016947	AAGGCA	2	12	911055	911066	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379752939
504	NC_016947	AGGCCG	2	12	912252	912263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379752939
505	NC_016947	TCTTGG	2	12	914712	914723	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379752942
506	NC_016947	AGACGA	2	12	915810	915821	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379752943
507	NC_016947	CATCGG	2	12	918742	918753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379752946
508	NC_016947	TCGCCG	2	12	920541	920552	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379752948
509	NC_016947	TCGAAG	2	12	927607	927618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379752954
510	NC_016947	TCACCG	2	12	930873	930884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379752958
511	NC_016947	CCGGTG	2	12	931175	931186	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379752958
512	NC_016947	CCTCGG	2	12	931759	931770	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379752959
513	NC_016947	GACGCG	2	12	936848	936859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379752963
514	NC_016947	CCGCGG	2	12	937569	937580	0 %	0 %	50 %	50 %	379752963
515	NC_016947	GCTCGA	2	12	939209	939220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379752965
516	NC_016947	CGACGG	2	12	940030	940041	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379752966
517	NC_016947	CCGAGA	2	12	941207	941218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752966
518	NC_016947	CGCTGG	2	12	941453	941464	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379752966
519	NC_016947	CCCGGG	2	12	943955	943966	0 %	0 %	50 %	50 %	379752969
520	NC_016947	GCCCAG	2	12	947312	947323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379752971
521	NC_016947	TCGCGG	2	12	949362	949373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379752973
522	NC_016947	GTCGGC	2	12	950809	950820	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379752974
523	NC_016947	GCCCAG	2	12	951481	951492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379752974
524	NC_016947	TCGACC	2	12	952299	952310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379752976
525	NC_016947	CGGGGT	2	12	953680	953691	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379752978
526	NC_016947	TCGACG	2	12	954189	954200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379752978
527	NC_016947	CGCGGC	2	12	955393	955404	0 %	0 %	50 %	50 %	379752980
528	NC_016947	ACGAGC	2	12	956907	956918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379752982
529	NC_016947	CCCCCG	2	12	958896	958907	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	379752986
530	NC_016947	GCACCA	2	12	958946	958957	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379752986
531	NC_016947	CAGCGG	2	12	959061	959072	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379752986
532	NC_016947	TCGGCG	2	12	960565	960576	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379752988
533	NC_016947	GTCATC	2	12	961164	961175	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379752988
534	NC_016947	CGCCGG	2	12	963162	963173	0 %	0 %	50 %	50 %	379752990
535	NC_016947	TGATGG	2	12	963235	963246	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379752990
536	NC_016947	GGCGCG	2	12	963407	963418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379752990
537	NC_016947	CATCGT	2	12	964606	964617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379752992
538	NC_016947	GCCAGC	2	12	964781	964792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379752992
539	NC_016947	GGCGTG	2	12	970273	970284	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379752999
540	NC_016947	CCAACG	2	12	970601	970612	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379753000
541	NC_016947	TCGGAC	2	12	972508	972519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753001
542	NC_016947	TCGAGC	2	12	974007	974018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753002
543	NC_016947	CCGGCA	2	12	975400	975411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753004
544	NC_016947	GCGACA	2	12	975469	975480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379753004
545	NC_016947	GCTCGC	2	12	977590	977601	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753007
546	NC_016947	CGCGGG	2	12	978999	979010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379753008
547	NC_016947	AACCCG	2	12	979752	979763	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379753008
548	NC_016947	TGCTGT	2	12	980950	980961	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379753010
549	NC_016947	GACACG	2	12	981582	981593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379753010
550	NC_016947	CGCTGG	2	12	981793	981804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753010
551	NC_016947	GTCGCG	2	12	985463	985474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753013
552	NC_016947	CGGGGT	2	12	985540	985551	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379753013
553	NC_016947	GTAGTC	2	12	987608	987619	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379753015
554	NC_016947	GATGTC	2	12	987806	987817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379753015
555	NC_016947	TGGCCC	2	12	989858	989869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753016
556	NC_016947	CTCGGC	2	12	989928	989939	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753016
557	NC_016947	CGGATC	2	12	990297	990308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753017
558	NC_016947	GATGCC	2	12	991903	991914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753017
559	NC_016947	GCGCTC	2	12	995821	995832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753020
560	NC_016947	CTTGGG	2	12	997691	997702	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379753021
561	NC_016947	GGCGTC	2	12	1005053	1005064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753029
562	NC_016947	CGGGCC	2	12	1006988	1006999	0 %	0 %	50 %	50 %	379753030
563	NC_016947	GATGGC	2	12	1009661	1009672	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753032
564	NC_016947	CGACCG	2	12	1017695	1017706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753039
565	NC_016947	GCCGTG	2	12	1026237	1026248	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753048
566	NC_016947	GCCGAT	2	12	1026601	1026612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753049
567	NC_016947	ACTCGG	2	12	1027029	1027040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753050
568	NC_016947	CCTCGA	2	12	1027296	1027307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379753050
569	NC_016947	CCGGTT	2	12	1031814	1031825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379753053
570	NC_016947	GCCCTG	2	12	1032556	1032567	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753053
571	NC_016947	CCGGCG	2	12	1035610	1035621	0 %	0 %	50 %	50 %	379753056
572	NC_016947	GACGTC	2	12	1036560	1036571	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753057
573	NC_016947	GATGTC	2	12	1039249	1039260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379753059
574	NC_016947	CGGCGA	2	12	1039881	1039892	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379753060
575	NC_016947	GGCCGC	2	12	1041055	1041066	0 %	0 %	50 %	50 %	379753061
576	NC_016947	ACCAAG	2	12	1041731	1041742	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379753061
577	NC_016947	CGGCTG	2	12	1043273	1043284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753061
578	NC_016947	CGACGG	2	12	1045397	1045408	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379753063
579	NC_016947	GTCGAG	2	12	1045781	1045792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753064
580	NC_016947	TGGCGG	2	12	1046847	1046858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379753064
581	NC_016947	GCTGAC	2	12	1047290	1047301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753065
582	NC_016947	CCCGGT	2	12	1047699	1047710	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753065
583	NC_016947	CACCGC	2	12	1051482	1051493	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379753070
584	NC_016947	GCCGCT	2	12	1053143	1053154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753071
585	NC_016947	GCCGGC	2	12	1053554	1053565	0 %	0 %	50 %	50 %	379753071
586	NC_016947	CGAAGA	2	12	1055219	1055230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379753072
587	NC_016947	GCCAGC	2	12	1056126	1056137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753073
588	NC_016947	ATGGCC	2	12	1056165	1056176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753073
589	NC_016947	ATCGCG	2	12	1056330	1056341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753073
590	NC_016947	GGTGCG	2	12	1057151	1057162	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379753073
591	NC_016947	GTTGGT	2	12	1057289	1057300	0 %	50 %	50 %	0 %	379753073
592	NC_016947	ACCGCC	2	12	1057575	1057586	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379753074
593	NC_016947	CGCCTG	2	12	1060967	1060978	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753078
594	NC_016947	GCCCGC	2	12	1060988	1060999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379753078
595	NC_016947	GGCGCC	2	12	1061344	1061355	0 %	0 %	50 %	50 %	379753079
596	NC_016947	CGGCCG	2	12	1061412	1061423	0 %	0 %	50 %	50 %	379753079
597	NC_016947	GCGCCC	2	12	1061546	1061557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379753079
598	NC_016947	GTGGCG	2	12	1062290	1062301	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379753079
599	NC_016947	CCGATG	2	12	1062900	1062911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753080
600	NC_016947	CTGCGC	2	12	1063148	1063159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753080
601	NC_016947	GGCCTG	2	12	1065779	1065790	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753083
602	NC_016947	CTGGGT	2	12	1066051	1066062	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379753083
603	NC_016947	CGACAG	2	12	1066839	1066850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379753084
604	NC_016947	CACCGC	2	12	1067974	1067985	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379753085
605	NC_016947	GGAGGT	2	12	1070330	1070341	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	379753086
606	NC_016947	TCGGGA	2	12	1076359	1076370	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753094
607	NC_016947	CCTCGA	2	12	1076441	1076452	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379753094
608	NC_016947	CGTCCT	2	12	1076738	1076749	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379753094
609	NC_016947	TGCGGC	2	12	1079027	1079038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753097
610	NC_016947	GCGATG	2	12	1079628	1079639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753097
611	NC_016947	GATCTC	2	12	1079926	1079937	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379753098
612	NC_016947	CCAGGT	2	12	1080696	1080707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753098
613	NC_016947	CGCCGA	2	12	1083771	1083782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753102
614	NC_016947	GCCGGT	2	12	1088351	1088362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753108
615	NC_016947	CGCGAC	2	12	1088369	1088380	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753108
616	NC_016947	TGGCCT	2	12	1089681	1089692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379753109
617	NC_016947	ATGGCG	2	12	1090668	1090679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753110
618	NC_016947	CAGGCC	2	12	1090718	1090729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753110
619	NC_016947	AACGCC	2	12	1091859	1091870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379753111
620	NC_016947	GGGCCT	2	12	1092059	1092070	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753111
621	NC_016947	GCATCG	2	12	1092112	1092123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753111
622	NC_016947	GGCCCA	2	12	1095488	1095499	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753115
623	NC_016947	CCTTGG	2	12	1095566	1095577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379753115
624	NC_016947	GCCGTG	2	12	1097920	1097931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753117
625	NC_016947	GGCTGC	2	12	1098240	1098251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753117
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629	NC_016947	GATGAA	2	12	1108806	1108817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379753129
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633	NC_016947	GCAGCC	2	12	1110721	1110732	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753132
634	NC_016947	CTTCGA	2	12	1111498	1111509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379753132
635	NC_016947	ACGTCG	2	12	1111963	1111974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753133
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642	NC_016947	CCGGCC	2	12	1121663	1121674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379753141
643	NC_016947	CGGGGA	2	12	1126662	1126673	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	379753144
644	NC_016947	TACCGG	2	12	1127679	1127690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753144
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682	NC_016947	TCCGAC	2	12	1192273	1192284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379753206
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688	NC_016947	GCGCCA	2	12	1197016	1197027	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753211
689	NC_016947	GACGTC	2	12	1199609	1199620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753216
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694	NC_016947	CCGCGG	2	12	1204104	1204115	0 %	0 %	50 %	50 %	379753221
695	NC_016947	CGATGG	2	12	1207534	1207545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753226
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700	NC_016947	GGCCGA	2	12	1211565	1211576	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379753228
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702	NC_016947	CTGGTG	2	12	1212131	1212142	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379753229
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709	NC_016947	GGCCGA	2	12	1223553	1223564	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379753239
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712	NC_016947	GCAGGA	2	12	1229231	1229242	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379753241
713	NC_016947	TCGACG	2	12	1231216	1231227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753241
714	NC_016947	GTTGCC	2	12	1232255	1232266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379753241
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717	NC_016947	CGCGCT	2	12	1234970	1234981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753243
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719	NC_016947	GCGGTC	2	12	1239310	1239321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753247
720	NC_016947	TCAGCA	2	12	1239555	1239566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379753247
721	NC_016947	ACACGC	2	12	1240748	1240759	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379753248
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723	NC_016947	CGGGCG	2	12	1241801	1241812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379753249
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725	NC_016947	GCCGGG	2	12	1242032	1242043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379753249
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824	NC_016947	GCTTGT	2	12	1467109	1467120	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379753465
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827	NC_016947	GGCGAC	2	12	1475174	1475185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379753476
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831	NC_016947	GCCGTC	2	12	1485651	1485662	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753486
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834	NC_016947	AGTCGA	2	12	1491070	1491081	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379753491
835	NC_016947	GGCGCT	2	12	1491136	1491147	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379753491
836	NC_016947	TCATGA	2	12	1491501	1491512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379753492
837	NC_016947	CGCCGA	2	12	1492294	1492305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379753493
838	NC_016947	GCCTTC	2	12	1494508	1494519	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379753496
839	NC_016947	GTGGCG	2	12	1494547	1494558	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379753496
840	NC_016947	AACTGC	2	12	1501631	1501642	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379753504
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843	NC_016947	GCCCGT	2	12	1511951	1511962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379753514
844	NC_016947	GTGACG	2	12	1514823	1514834	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753517
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848	NC_016947	GCGATG	2	12	1523320	1523331	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379753525
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940	NC_016947	AATCAG	2	12	1668557	1668568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379753663
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942	NC_016947	GCGCGG	2	12	1671752	1671763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379753667
943	NC_016947	CGGCGA	2	12	1671798	1671809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379753667
944	NC_016947	CGAGCT	2	12	1675651	1675662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379753670
945	NC_016947	GACCAT	2	12	1676718	1676729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379753671
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