MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-02 chromosome

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016947	ACCAC	2	10	1417	1426	40 %	0 %	0 %	60 %	379752014
2	NC_016947	CGCAA	2	10	1438	1447	40 %	0 %	20 %	40 %	379752014
3	NC_016947	GGCCG	2	10	3016	3025	0 %	0 %	60 %	40 %	379752015
4	NC_016947	CCGGG	2	10	3197	3206	0 %	0 %	60 %	40 %	379752015
5	NC_016947	GCGCC	2	10	4275	4284	0 %	0 %	40 %	60 %	379752016
6	NC_016947	GCACC	2	10	5992	6001	20 %	0 %	20 %	60 %	379752018
7	NC_016947	GAAGT	2	10	6386	6395	40 %	20 %	40 %	0 %	379752018
8	NC_016947	GCAGC	2	10	6970	6979	20 %	0 %	40 %	40 %	379752018
9	NC_016947	GCAGC	2	10	7405	7414	20 %	0 %	40 %	40 %	379752019
10	NC_016947	GGGCA	2	10	7667	7676	20 %	0 %	60 %	20 %	379752019
11	NC_016947	CGGGC	2	10	9845	9854	0 %	0 %	60 %	40 %	379752019
12	NC_016947	CGCGG	2	10	11150	11159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016947	CGAGG	2	10	11487	11496	20 %	0 %	60 %	20 %	379752020
14	NC_016947	CCGCA	2	10	11647	11656	20 %	0 %	20 %	60 %	379752020
15	NC_016947	CGCTC	2	10	13524	13533	0 %	20 %	20 %	60 %	379752022
16	NC_016947	CCGCG	2	10	14313	14322	0 %	0 %	40 %	60 %	379752022
17	NC_016947	TCCCG	2	10	18163	18172	0 %	20 %	20 %	60 %	379752029
18	NC_016947	CCAGC	2	10	18269	18278	20 %	0 %	20 %	60 %	379752029
19	NC_016947	TCACC	2	10	18415	18424	20 %	20 %	0 %	60 %	379752029
20	NC_016947	GTTGC	2	10	18485	18494	0 %	40 %	40 %	20 %	379752029
21	NC_016947	GCCGG	2	10	20292	20301	0 %	0 %	60 %	40 %	379752030
22	NC_016947	GGCCC	2	10	20410	20419	0 %	0 %	40 %	60 %	379752030
23	NC_016947	GGCGG	2	10	20439	20448	0 %	0 %	80 %	20 %	379752030
24	NC_016947	CGGCG	2	10	21327	21336	0 %	0 %	60 %	40 %	379752031
25	NC_016947	TTAGC	2	10	21560	21569	20 %	40 %	20 %	20 %	379752031
26	NC_016947	CGGCG	2	10	22017	22026	0 %	0 %	60 %	40 %	379752031
27	NC_016947	GGGGC	2	10	23498	23507	0 %	0 %	80 %	20 %	379752032
28	NC_016947	AGACC	2	10	23704	23713	40 %	0 %	20 %	40 %	379752032
29	NC_016947	GCTGA	2	10	23846	23855	20 %	20 %	40 %	20 %	379752032
30	NC_016947	CCAAT	2	10	25338	25347	40 %	20 %	0 %	40 %	379752033
31	NC_016947	CTGCG	2	10	25417	25426	0 %	20 %	40 %	40 %	379752033
32	NC_016947	AGGGC	2	10	28117	28126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016947	ATCGC	2	10	28429	28438	20 %	20 %	20 %	40 %	379752036
34	NC_016947	CAGCG	2	10	29333	29342	20 %	0 %	40 %	40 %	379752038
35	NC_016947	GCGAT	2	10	30276	30285	20 %	20 %	40 %	20 %	379752040
36	NC_016947	TCGGC	2	10	32324	32333	0 %	20 %	40 %	40 %	379752041
37	NC_016947	AGGCG	2	10	33505	33514	20 %	0 %	60 %	20 %	379752042
38	NC_016947	CAGAA	2	10	33978	33987	60 %	0 %	20 %	20 %	379752042
39	NC_016947	AAGAT	2	10	34425	34434	60 %	20 %	20 %	0 %	379752042
40	NC_016947	CGTGG	2	10	34858	34867	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016947	CTTTC	2	10	35480	35489	0 %	60 %	0 %	40 %	379752044
42	NC_016947	CAGCG	2	10	37523	37532	20 %	0 %	40 %	40 %	379752045
43	NC_016947	CCAAA	2	10	38372	38381	60 %	0 %	0 %	40 %	379752046
44	NC_016947	CGGCG	2	10	38825	38834	0 %	0 %	60 %	40 %	379752047
45	NC_016947	ACCGG	2	10	38836	38845	20 %	0 %	40 %	40 %	379752047
46	NC_016947	GCGCG	2	10	39452	39461	0 %	0 %	60 %	40 %	379752048
47	NC_016947	CAGCG	2	10	40334	40343	20 %	0 %	40 %	40 %	379752049
48	NC_016947	CCGTC	2	10	42295	42304	0 %	20 %	20 %	60 %	379752051
49	NC_016947	GGCCG	2	10	43865	43874	0 %	0 %	60 %	40 %	379752054
50	NC_016947	AGCCA	2	10	44550	44559	40 %	0 %	20 %	40 %	379752054
51	NC_016947	CTGCG	2	10	45154	45163	0 %	20 %	40 %	40 %	379752055
52	NC_016947	GTCGG	2	10	46016	46025	0 %	20 %	60 %	20 %	379752056
53	NC_016947	TTGTC	2	10	48203	48212	0 %	60 %	20 %	20 %	379752058
54	NC_016947	GCCGG	2	10	48863	48872	0 %	0 %	60 %	40 %	379752060
55	NC_016947	TCGGG	2	10	49484	49493	0 %	20 %	60 %	20 %	379752060
56	NC_016947	TGGGC	2	10	50574	50583	0 %	20 %	60 %	20 %	379752061
57	NC_016947	GGGTG	2	10	53079	53088	0 %	20 %	80 %	0 %	379752062
58	NC_016947	CGGTG	2	10	54777	54786	0 %	20 %	60 %	20 %	379752064
59	NC_016947	TCGCC	2	10	56977	56986	0 %	20 %	20 %	60 %	379752066
60	NC_016947	GGGGT	2	10	57381	57390	0 %	20 %	80 %	0 %	379752066
61	NC_016947	GCGAC	2	10	59200	59209	20 %	0 %	40 %	40 %	379752068
62	NC_016947	CGGCG	2	10	59219	59228	0 %	0 %	60 %	40 %	379752068
63	NC_016947	TCGGC	2	10	60954	60963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016947	CAGCG	2	10	62184	62193	20 %	0 %	40 %	40 %	379752070
65	NC_016947	CAGGT	2	10	64049	64058	20 %	20 %	40 %	20 %	379752072
66	NC_016947	TGTCA	2	10	64366	64375	20 %	40 %	20 %	20 %	379752072
67	NC_016947	GGCCC	2	10	67079	67088	0 %	0 %	40 %	60 %	379752075
68	NC_016947	ATCGT	2	10	68611	68620	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016947	GCGCC	2	10	70632	70641	0 %	0 %	40 %	60 %	379752079
70	NC_016947	GCGCG	2	10	71136	71145	0 %	0 %	60 %	40 %	379752079
71	NC_016947	CTGGC	2	10	73344	73353	0 %	20 %	40 %	40 %	379752080
72	NC_016947	ACGCG	2	10	73728	73737	20 %	0 %	40 %	40 %	379752080
73	NC_016947	CATGA	2	10	74380	74389	40 %	20 %	20 %	20 %	379752080
74	NC_016947	GCGTC	2	10	76273	76282	0 %	20 %	40 %	40 %	379752084
75	NC_016947	GACGG	2	10	78255	78264	20 %	0 %	60 %	20 %	379752086
76	NC_016947	TGCCG	2	10	81380	81389	0 %	20 %	40 %	40 %	379752088
77	NC_016947	CGGCG	2	10	84393	84402	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016947	TCATA	2	10	84902	84911	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016947	GGGCC	2	10	87634	87643	0 %	0 %	60 %	40 %	379752095
80	NC_016947	TGCGC	2	10	92548	92557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016947	GCAGC	2	10	94270	94279	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016947	GCTGC	2	10	95196	95205	0 %	20 %	40 %	40 %	379752106
83	NC_016947	TCTGC	2	10	96593	96602	0 %	40 %	20 %	40 %	379752107
84	NC_016947	CGACG	2	10	96878	96887	20 %	0 %	40 %	40 %	379752107
85	NC_016947	CGGCA	2	10	97298	97307	20 %	0 %	40 %	40 %	379752107
86	NC_016947	GCATG	2	10	97591	97600	20 %	20 %	40 %	20 %	379752108
87	NC_016947	CGCAA	2	10	98691	98700	40 %	0 %	20 %	40 %	379752110
88	NC_016947	ACGGC	2	10	98886	98895	20 %	0 %	40 %	40 %	379752110
89	NC_016947	GCGAC	2	10	100143	100152	20 %	0 %	40 %	40 %	379752111
90	NC_016947	CGCGA	2	10	101330	101339	20 %	0 %	40 %	40 %	379752112
91	NC_016947	GCGTC	2	10	104203	104212	0 %	20 %	40 %	40 %	379752116
92	NC_016947	CTCGC	2	10	104521	104530	0 %	20 %	20 %	60 %	379752117
93	NC_016947	CCGTG	2	10	105400	105409	0 %	20 %	40 %	40 %	379752118
94	NC_016947	CATGC	2	10	106052	106061	20 %	20 %	20 %	40 %	379752118
95	NC_016947	CGGTC	2	10	109720	109729	0 %	20 %	40 %	40 %	379752121
96	NC_016947	CGGCC	2	10	111638	111647	0 %	0 %	40 %	60 %	379752123
97	NC_016947	GGCCT	2	10	112283	112292	0 %	20 %	40 %	40 %	379752124
98	NC_016947	GCTGG	2	10	113648	113657	0 %	20 %	60 %	20 %	379752125
99	NC_016947	GCACG	2	10	113870	113879	20 %	0 %	40 %	40 %	379752125
100	NC_016947	CCGCG	2	10	114599	114608	0 %	0 %	40 %	60 %	379752126
101	NC_016947	CGACG	2	10	115229	115238	20 %	0 %	40 %	40 %	379752127
102	NC_016947	GCGTG	2	10	117636	117645	0 %	20 %	60 %	20 %	379752131
103	NC_016947	GCCAG	2	10	117990	117999	20 %	0 %	40 %	40 %	379752131
104	NC_016947	ATCCT	2	10	118638	118647	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016947	GGGCC	2	10	119460	119469	0 %	0 %	60 %	40 %	379752134
106	NC_016947	CGGGC	2	10	119621	119630	0 %	0 %	60 %	40 %	379752135
107	NC_016947	CCTGG	2	10	119777	119786	0 %	20 %	40 %	40 %	379752135
108	NC_016947	CCATG	2	10	119900	119909	20 %	20 %	20 %	40 %	379752135
109	NC_016947	GCCAG	2	10	122506	122515	20 %	0 %	40 %	40 %	379752137
110	NC_016947	TCGAC	2	10	122908	122917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016947	ACCAA	2	10	123337	123346	60 %	0 %	0 %	40 %	379752138
112	NC_016947	GCCCG	2	10	123436	123445	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_016947	CATCG	2	10	124514	124523	20 %	20 %	20 %	40 %	379752139
114	NC_016947	GTCGA	2	10	125899	125908	20 %	20 %	40 %	20 %	379752140
115	NC_016947	GGTCC	2	10	126032	126041	0 %	20 %	40 %	40 %	379752140
116	NC_016947	GGACA	2	10	129269	129278	40 %	0 %	40 %	20 %	379752144
117	NC_016947	CAGCG	2	10	129917	129926	20 %	0 %	40 %	40 %	379752144
118	NC_016947	CGGCC	2	10	130621	130630	0 %	0 %	40 %	60 %	379752144
119	NC_016947	ACAGC	2	10	131878	131887	40 %	0 %	20 %	40 %	379752146
120	NC_016947	TCAGC	2	10	133079	133088	20 %	20 %	20 %	40 %	379752147
121	NC_016947	CGGGG	2	10	136551	136560	0 %	0 %	80 %	20 %	379752150
122	NC_016947	TCGAT	2	10	137367	137376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016947	CGCGG	2	10	138867	138876	0 %	0 %	60 %	40 %	379752152
124	NC_016947	CCATC	2	10	139179	139188	20 %	20 %	0 %	60 %	379752153
125	NC_016947	CTCGA	2	10	139818	139827	20 %	20 %	20 %	40 %	379752155
126	NC_016947	CAGGG	2	10	140106	140115	20 %	0 %	60 %	20 %	379752155
127	NC_016947	ACCCG	2	10	141012	141021	20 %	0 %	20 %	60 %	379752156
128	NC_016947	TCACC	2	10	141546	141555	20 %	20 %	0 %	60 %	379752157
129	NC_016947	GGATT	2	10	142530	142539	20 %	40 %	40 %	0 %	379752158
130	NC_016947	CCGCG	2	10	147330	147339	0 %	0 %	40 %	60 %	379752164
131	NC_016947	GCCGC	2	10	147883	147892	0 %	0 %	40 %	60 %	379752164
132	NC_016947	TCGCG	2	10	149333	149342	0 %	20 %	40 %	40 %	379752166
133	NC_016947	GTCCC	2	10	150185	150194	0 %	20 %	20 %	60 %	379752166
134	NC_016947	TCGGC	2	10	150266	150275	0 %	20 %	40 %	40 %	379752166
135	NC_016947	GCCGC	2	10	151701	151710	0 %	0 %	40 %	60 %	379752168
136	NC_016947	CCGCG	2	10	152237	152246	0 %	0 %	40 %	60 %	379752168
137	NC_016947	CACTA	2	10	152995	153004	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016947	GTGCG	2	10	153228	153237	0 %	20 %	60 %	20 %	379752169
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140	NC_016947	GGGCG	2	10	155430	155439	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016947	CCGCC	2	10	158231	158240	0 %	0 %	20 %	80 %	379752175
142	NC_016947	GGCCG	2	10	159412	159421	0 %	0 %	60 %	40 %	379752176
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145	NC_016947	CGGCT	2	10	161290	161299	0 %	20 %	40 %	40 %	379752177
146	NC_016947	AGGGC	2	10	162889	162898	20 %	0 %	60 %	20 %	379752178
147	NC_016947	CGGCC	2	10	162991	163000	0 %	0 %	40 %	60 %	379752178
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150	NC_016947	TGCTG	2	10	166725	166734	0 %	40 %	40 %	20 %	379752182
151	NC_016947	CGCGG	2	10	166956	166965	0 %	0 %	60 %	40 %	379752182
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154	NC_016947	GCTGG	2	10	168612	168621	0 %	20 %	60 %	20 %	379752184
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157	NC_016947	GGGGC	2	10	174682	174691	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
158	NC_016947	GGCCA	2	10	176215	176224	20 %	0 %	40 %	40 %	379752188
159	NC_016947	GCTCC	2	10	176405	176414	0 %	20 %	20 %	60 %	379752188
160	NC_016947	CACTG	2	10	176758	176767	20 %	20 %	20 %	40 %	379752188
161	NC_016947	CGTGG	2	10	178213	178222	0 %	20 %	60 %	20 %	379752190
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172	NC_016947	GCCCC	2	10	188342	188351	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
173	NC_016947	GCGCC	2	10	188436	188445	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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196	NC_016947	AGCGA	2	10	211039	211048	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
197	NC_016947	AGCGA	2	10	211089	211098	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
198	NC_016947	CCGCC	2	10	211621	211630	0 %	0 %	20 %	80 %	379752228
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242	NC_016947	GCGCG	2	10	270139	270148	0 %	0 %	60 %	40 %	379752274
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396	NC_016947	GTTGG	2	10	439382	439391	0 %	40 %	60 %	0 %	379752450
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