MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare MOTT-02 chromosome

Total Repeats: 469

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016947	CGCGG	2	10	11150	11159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016947	AGGGC	2	10	28117	28126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016947	CGTGG	2	10	34858	34867	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016947	TCGGC	2	10	60954	60963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016947	ATCGT	2	10	68611	68620	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016947	CGGCG	2	10	84393	84402	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016947	TCATA	2	10	84902	84911	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016947	TGCGC	2	10	92548	92557	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016947	GCAGC	2	10	94270	94279	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016947	ATCCT	2	10	118638	118647	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016947	TCGAC	2	10	122908	122917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016947	GCCCG	2	10	123436	123445	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016947	TCGAT	2	10	137367	137376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016947	CACTA	2	10	152995	153004	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016947	GGGCG	2	10	155430	155439	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016947	GGGGC	2	10	174682	174691	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016947	CGGGC	2	10	185737	185746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016947	ACACG	2	10	186707	186716	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016947	CGGGA	2	10	187896	187905	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016947	GCCCC	2	10	188342	188351	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_016947	GCGCC	2	10	188436	188445	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_016947	GCCGG	2	10	195857	195866	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016947	TGTGT	2	10	209525	209534	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016947	AGCGA	2	10	210989	210998	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016947	AGCGA	2	10	211039	211048	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016947	AGCGA	2	10	211089	211098	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016947	CAATG	2	10	256861	256870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016947	TCAGT	2	10	265424	265433	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016947	GGGAA	2	10	267662	267671	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016947	GCGCC	2	10	281974	281983	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016947	AACCC	2	10	338151	338160	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016947	ATGGC	2	10	356558	356567	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016947	GCGCC	2	10	369549	369558	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_016947	GCCGG	2	10	378623	378632	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016947	GCCGG	2	10	387006	387015	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016947	GAACA	2	10	389944	389953	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016947	CGGCC	2	10	408499	408508	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_016947	GACGG	2	10	423213	423222	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016947	CGGTA	2	10	431535	431544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016947	CGGCG	2	10	438087	438096	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016947	CGACA	2	10	440632	440641	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016947	CCGTC	2	10	447500	447509	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_016947	AGCAA	2	10	447598	447607	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016947	GTTGG	2	10	454176	454185	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016947	ACACG	2	10	479985	479994	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016947	GCCCG	2	10	544772	544781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_016947	GGCCG	2	10	577754	577763	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016947	AACCG	2	10	577993	578002	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_016947	CTTCG	2	10	579779	579788	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016947	GGACG	2	10	585043	585052	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016947	AGCGA	2	10	598506	598515	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016947	AGCCG	2	10	614229	614238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016947	GCGAC	2	10	668523	668532	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016947	ACGCG	2	10	672141	672150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016947	CGGCG	2	10	677572	677581	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016947	CCCCG	2	10	683196	683205	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
57	NC_016947	CGCTA	2	10	683893	683902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016947	AGCCG	2	10	684956	684965	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016947	CACCT	2	10	691352	691361	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_016947	GGTGG	2	10	695195	695204	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016947	CGCGA	2	10	705147	705156	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016947	GCTGA	2	10	712990	712999	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016947	CCGTC	2	10	741418	741427	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_016947	TGATC	2	10	753295	753304	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016947	TCGCT	2	10	774018	774027	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016947	CGGCG	2	10	774040	774049	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016947	CGCGC	2	10	786047	786056	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_016947	TGACG	2	10	802930	802939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016947	AGCGC	2	10	802985	802994	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016947	TTTTC	2	10	813073	813082	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016947	CGAGC	2	10	814170	814179	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016947	CTGGG	2	10	817994	818003	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016947	ACGAT	2	10	818121	818130	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016947	CCTTC	2	10	834895	834904	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016947	AGCAT	2	10	836194	836203	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016947	CCCGG	2	10	857230	857239	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_016947	GGTCA	2	10	863027	863036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016947	CGTGT	2	10	866022	866031	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016947	CGGGG	2	10	893137	893146	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016947	TTCAC	2	10	899555	899564	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016947	TCGCT	2	10	922815	922824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016947	CGGTC	2	10	926525	926534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016947	GCCGG	2	10	973293	973302	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016947	CGTGT	2	10	978664	978673	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016947	CGGGG	2	10	983611	983620	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016947	TCGCG	2	10	1012592	1012601	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016947	GCGCG	2	10	1027986	1027995	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016947	GATGC	2	10	1063667	1063676	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016947	ACGCC	2	10	1063826	1063835	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016947	CGGCG	2	10	1068823	1068832	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016947	GCTCG	2	10	1111625	1111634	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016947	GGCTG	2	10	1111684	1111693	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016947	AAATG	2	10	1140550	1140559	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016947	GCATG	2	10	1154349	1154358	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016947	GATTC	2	10	1154794	1154803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016947	GACGC	2	10	1167836	1167845	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016947	CCGGC	2	10	1171784	1171793	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_016947	GAAGG	2	10	1200633	1200642	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016947	CAACT	2	10	1205697	1205706	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016947	GCAAC	2	10	1222670	1222679	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016947	ACCGG	2	10	1239641	1239650	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016947	TCGCC	2	10	1243340	1243349	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_016947	GCTCC	2	10	1255436	1255445	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_016947	CGCTG	2	10	1260447	1260456	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016947	GGTGG	2	10	1305051	1305060	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016947	CGATC	2	10	1318089	1318098	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_016947	CTGCG	2	10	1320377	1320386	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016947	GTGCT	2	10	1321325	1321334	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016947	TTGCC	2	10	1321486	1321495	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016947	TAATG	2	10	1321497	1321506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016947	GTGCG	2	10	1332767	1332776	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016947	TCCCG	2	10	1367609	1367618	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_016947	CCAAT	2	10	1393660	1393669	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016947	AATGG	2	10	1411474	1411483	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016947	TGGCG	2	10	1420590	1420599	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016947	AGCCG	2	10	1427985	1427994	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016947	GGAAG	2	10	1439326	1439335	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016947	GGTCA	2	10	1454649	1454658	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016947	TGACC	2	10	1466297	1466306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_016947	GCCAG	2	10	1469752	1469761	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016947	TCGCT	2	10	1473079	1473088	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016947	CGCAC	2	10	1481986	1481995	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_016947	CGGCG	2	10	1496365	1496374	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016947	GAATT	2	10	1496740	1496749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016947	CGGTC	2	10	1503091	1503100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_016947	TCGGC	2	10	1505379	1505388	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016947	CCGCG	2	10	1526930	1526939	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_016947	CGGAA	2	10	1536830	1536839	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016947	CGGGT	2	10	1568602	1568611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016947	CACGG	2	10	1574112	1574121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016947	TGCAT	2	10	1574253	1574262	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016947	TTCGG	2	10	1576757	1576766	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016947	CTTCT	2	10	1577642	1577651	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016947	GGATT	2	10	1578810	1578819	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016947	TCGTG	2	10	1604225	1604234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016947	CGTCA	2	10	1604562	1604571	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016947	GGTGT	2	10	1604872	1604881	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016947	GGGAG	2	10	1605559	1605568	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016947	GCCAG	2	10	1606407	1606416	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_016947	CGCGG	2	10	1638096	1638105	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_016947	GTCCC	2	10	1638184	1638193	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_016947	GAAAT	2	10	1639126	1639135	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016947	CGTCA	2	10	1711887	1711896	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016947	TTCCC	2	10	1714358	1714367	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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146	NC_016947	TCGCT	2	10	1716045	1716054	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_016947	TCGCT	2	10	1716095	1716104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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262	NC_016947	CGAAC	2	10	3156557	3156566	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_016947	CGACG	2	10	3397094	3397103	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_016947	CCAGG	2	10	3424050	3424059	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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287	NC_016947	CGGGC	2	10	3425506	3425515	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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302	NC_016947	GCCCG	2	10	3672211	3672220	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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457	NC_016947	GCCCG	2	10	5311794	5311803	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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461	NC_016947	CGCCA	2	10	5364266	5364275	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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463	NC_016947	CGGGG	2	10	5384382	5384391	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
464	NC_016947	CATTG	2	10	5384415	5384424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
465	NC_016947	GACGC	2	10	5387660	5387669	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
466	NC_016947	AACAA	2	10	5391172	5391181	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
467	NC_016947	CCGGA	2	10	5404574	5404583	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
468	NC_016947	TTCCG	2	10	5409322	5409331	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
469	NC_016947	CTCGG	2	10	5409338	5409347	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.