MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium intracellulare ATCC 13950 chromosome

Total Repeats: 1376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016946	TCGT	2	8	1683	1690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016946	CCGC	2	8	5210	5217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016946	GACC	2	8	7311	7318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016946	GGCC	2	8	15003	15010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016946	CCCG	2	8	15675	15682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016946	CGCC	2	8	15995	16002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016946	ATTC	2	8	16251	16258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016946	GTCG	2	8	16260	16267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016946	CCGG	2	8	25687	25694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016946	GGCC	2	8	29230	29237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016946	AGCT	2	8	32627	32634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016946	AGGG	2	8	32636	32643	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016946	CCGG	2	8	35106	35113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016946	CGCC	2	8	40622	40629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016946	CGGC	2	8	60977	60984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016946	GGTC	2	8	61370	61377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016946	GAAA	2	8	76064	76071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016946	ATGT	2	8	77312	77319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016946	TCAG	2	8	88144	88151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016946	GGTG	2	8	88435	88442	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016946	GCGT	2	8	90888	90895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016946	GAAC	2	8	90947	90954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016946	CGCC	2	8	90956	90963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_016946	CGTA	2	8	92529	92536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016946	CACC	2	8	92556	92563	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016946	GACA	2	8	94581	94588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016946	GCCG	2	8	97020	97027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016946	GGTC	2	8	97156	97163	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016946	GCGG	2	8	97403	97410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016946	CCCT	2	8	102375	102382	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_016946	GTGC	2	8	102561	102568	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016946	GGGA	2	8	102577	102584	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016946	AACC	2	8	107522	107529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016946	CCGG	2	8	118295	118302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016946	TGCG	2	8	119685	119692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016946	CGAC	2	8	119696	119703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016946	CAAC	2	8	125277	125284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016946	TTAG	2	8	126276	126283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016946	GGAT	2	8	126968	126975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016946	TGGA	2	8	130552	130559	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016946	CTCG	2	8	136211	136218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016946	GCCG	2	8	140721	140728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016946	CGAA	2	8	145569	145576	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016946	TCGG	2	8	150344	150351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016946	CGGC	2	8	152594	152601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016946	ACTC	2	8	154508	154515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016946	CGGC	2	8	154549	154556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016946	CCCG	2	8	156128	156135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_016946	CCCA	2	8	158380	158387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016946	GCTC	2	8	165651	165658	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016946	GTTC	2	8	177729	177736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016946	GGTG	2	8	177763	177770	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016946	GGAC	2	8	177824	177831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016946	GGGC	2	8	188455	188462	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016946	GCCG	2	8	189268	189275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016946	GTGA	2	8	191160	191167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016946	GTGG	2	8	191264	191271	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016946	ACGT	2	8	194665	194672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016946	GCAC	2	8	201328	201335	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016946	GCCG	2	8	204844	204851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016946	CGGC	2	8	206796	206803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016946	CTGG	2	8	212931	212938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016946	CGGC	2	8	213086	213093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016946	CGGC	2	8	219833	219840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016946	CGAA	2	8	219997	220004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016946	GCAG	2	8	220103	220110	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016946	GGCC	2	8	221328	221335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016946	CCGA	2	8	223680	223687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016946	TGGC	2	8	261170	261177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016946	ACTT	2	8	271907	271914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016946	GCCG	2	8	273025	273032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016946	GAAG	2	8	273406	273413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016946	CGTG	2	8	291372	291379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016946	GCTG	2	8	295109	295116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016946	CACC	2	8	298392	298399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_016946	GCCG	2	8	298457	298464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016946	CGCC	2	8	299041	299048	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_016946	CGAC	2	8	321847	321854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016946	GGGC	2	8	324706	324713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016946	GGGC	2	8	326445	326452	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016946	AATC	2	8	329099	329106	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016946	TTCG	3	12	329134	329145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016946	GTTC	2	8	329385	329392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016946	ACCG	2	8	329413	329420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016946	ACGT	2	8	329524	329531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016946	CGAC	2	8	329540	329547	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016946	GGAA	2	8	330068	330075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016946	CCTT	2	8	330077	330084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016946	CGAT	2	8	332600	332607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016946	GTCG	2	8	342863	342870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016946	GGTT	2	8	343701	343708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016946	CGGG	2	8	350584	350591	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016946	GTCG	2	8	354879	354886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016946	CGCC	2	8	371439	371446	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_016946	CGGG	2	8	375278	375285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016946	CTCG	2	8	380534	380541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016946	ATCG	2	8	389099	389106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016946	GCCC	2	8	389237	389244	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_016946	GTTG	2	8	391197	391204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016946	CCGG	2	8	392788	392795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016946	GCGA	2	8	392869	392876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016946	TGCG	2	8	392952	392959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016946	CTGC	2	8	393012	393019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016946	CGAC	2	8	394993	395000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016946	CGAA	2	8	395063	395070	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016946	CGGC	2	8	400083	400090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016946	CCGG	2	8	402595	402602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016946	CCGA	2	8	402624	402631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016946	CTCG	2	8	404191	404198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016946	CCGA	2	8	410688	410695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016946	CCGC	2	8	415096	415103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_016946	CCCA	2	8	421135	421142	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_016946	GGCC	2	8	422575	422582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016946	TCCG	2	8	422602	422609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016946	CTCG	2	8	426657	426664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016946	TCGG	2	8	430851	430858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016946	GCCC	2	8	431965	431972	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_016946	CCCG	2	8	437928	437935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_016946	CCGC	2	8	448421	448428	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_016946	CCGG	2	8	449106	449113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016946	GCGG	2	8	451148	451155	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016946	GCCG	2	8	451352	451359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016946	CGAT	2	8	463877	463884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016946	GAAC	2	8	465467	465474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016946	GGCG	2	8	481826	481833	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016946	CGCC	2	8	493171	493178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_016946	GCTG	2	8	495036	495043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016946	GCCG	2	8	495285	495292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016946	CAAG	2	8	513194	513201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016946	AAGC	2	8	520004	520011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016946	CTTG	2	8	520013	520020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016946	ACTG	2	8	531449	531456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016946	ATCC	2	8	540574	540581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016946	ATCC	2	8	540588	540595	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016946	CTGG	2	8	542387	542394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016946	GGGC	2	8	546609	546616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016946	GCTG	2	8	546624	546631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016946	CCGG	2	8	547872	547879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016946	CCGC	2	8	554210	554217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_016946	CGTC	2	8	560301	560308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016946	GCCA	2	8	563062	563069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016946	CCGG	2	8	576012	576019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016946	CCTG	2	8	580588	580595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016946	CCGA	2	8	581660	581667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016946	CCGC	2	8	583474	583481	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_016946	CCGA	2	8	583618	583625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016946	TTGG	2	8	594745	594752	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016946	GTCC	2	8	599715	599722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016946	GTTC	2	8	608945	608952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016946	TGGC	2	8	608992	608999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016946	GCCG	2	8	627597	627604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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163	NC_016946	GCCG	2	8	672192	672199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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176	NC_016946	TCGA	2	8	691374	691381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_016946	TTGG	2	8	757133	757140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_016946	GCGG	2	8	774828	774835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
190	NC_016946	TTAG	2	8	780980	780987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_016946	TCGG	2	8	789845	789852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
195	NC_016946	GACC	2	8	794075	794082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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