MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	CGGTAT	2	12	8331	8342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016945	TTCATA	2	12	48310	48321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016945	AATAAA	2	12	86560	86571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016945	ATATTT	2	12	180055	180066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016945	GGTATG	2	12	180268	180279	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016945	AAGTGA	2	12	195265	195276	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016945	TGTTGA	2	12	196462	196473	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016945	TTATTT	2	12	201997	202008	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016945	TATAAA	2	12	219733	219744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016945	GAAGGA	2	12	243950	243961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016945	GATGGA	2	12	258679	258690	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016945	GTTTGG	2	12	314171	314182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016945	GTTTGG	2	12	316896	316907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016945	GTTTGG	2	12	335918	335929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016945	GAGTTT	2	12	338875	338886	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016945	GTTTGG	2	12	345698	345709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016945	GGTTGT	2	12	359745	359756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016945	GTTTGA	2	12	382526	382537	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016945	GTTTGG	2	12	383038	383049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016945	GTTTGG	2	12	412119	412130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016945	TTTTCA	2	12	444923	444934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016945	TAGTGA	2	12	454551	454562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016945	TAGTGG	2	12	483717	483728	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016945	TGGTTA	2	12	584239	584250	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016945	GATCAA	2	12	592657	592668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016945	TCTTTT	2	12	594361	594372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016945	AAACTC	2	12	596028	596039	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016945	AAATAA	2	12	630225	630236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016945	CAAATA	2	12	630499	630510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016945	CAACCC	2	12	677487	677498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016945	GACACT	2	12	687546	687557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016945	AAAACC	2	12	704384	704395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016945	AGGAAT	2	12	719472	719483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016945	CTAAGC	2	12	783619	783630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016945	AAATTA	2	12	832255	832266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016945	TTATTG	2	12	844853	844864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016945	CAAAAT	2	12	908265	908276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016945	AATCAC	2	12	940441	940452	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016945	TAGAAA	2	12	986313	986324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016945	CACAGA	2	12	1000727	1000738	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016945	AAAATT	2	12	1015701	1015712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016945	AAAATG	2	12	1027917	1027928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016945	TCCGCT	2	12	1039346	1039357	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.