MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	379743461
2	NC_016945	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	379743461
3	NC_016945	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	379743461
4	NC_016945	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	379743462
5	NC_016945	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	379743466
6	NC_016945	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	379743467
7	NC_016945	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	379743467
8	NC_016945	TTCAC	2	10	10193	10202	20 %	40 %	0 %	40 %	379743469
9	NC_016945	GTGGC	2	10	16691	16700	0 %	20 %	60 %	20 %	379743471
10	NC_016945	TGGTG	2	10	18194	18203	0 %	40 %	60 %	0 %	379743472
11	NC_016945	GGTTT	2	10	18631	18640	0 %	60 %	40 %	0 %	379743472
12	NC_016945	AGATG	2	10	19887	19896	40 %	20 %	40 %	0 %	379743473
13	NC_016945	ACCAC	2	10	21972	21981	40 %	0 %	0 %	60 %	379743474
14	NC_016945	GATCC	2	10	24330	24339	20 %	20 %	20 %	40 %	379743476
15	NC_016945	CCACC	2	10	27113	27122	20 %	0 %	0 %	80 %	379743477
16	NC_016945	AAAGA	2	10	27177	27186	80 %	0 %	20 %	0 %	379743477
17	NC_016945	CCAAT	2	10	29815	29824	40 %	20 %	0 %	40 %	379743480
18	NC_016945	CGCGA	2	10	30039	30048	20 %	0 %	40 %	40 %	379743480
19	NC_016945	AAGCG	2	10	33893	33902	40 %	0 %	40 %	20 %	379743483
20	NC_016945	AATGC	2	10	34774	34783	40 %	20 %	20 %	20 %	379743483
21	NC_016945	GCAAA	2	10	35755	35764	60 %	0 %	20 %	20 %	379743484
22	NC_016945	GCTTA	2	10	36692	36701	20 %	40 %	20 %	20 %	379743486
23	NC_016945	AAGCT	2	10	37129	37138	40 %	20 %	20 %	20 %	379743486
24	NC_016945	ACTCA	2	10	37248	37257	40 %	20 %	0 %	40 %	379743486
25	NC_016945	GCGGA	2	10	37687	37696	20 %	0 %	60 %	20 %	379743487
26	NC_016945	GAGCT	2	10	38253	38262	20 %	20 %	40 %	20 %	379743487
27	NC_016945	CCACT	2	10	40505	40514	20 %	20 %	0 %	60 %	379743489
28	NC_016945	GGTTG	2	10	41140	41149	0 %	40 %	60 %	0 %	379743489
29	NC_016945	GTGAA	2	10	41948	41957	40 %	20 %	40 %	0 %	379743489
30	NC_016945	GCTGA	2	10	42930	42939	20 %	20 %	40 %	20 %	379743490
31	NC_016945	TGGGT	2	10	43474	43483	0 %	40 %	60 %	0 %	379743491
32	NC_016945	CTTGG	2	10	43543	43552	0 %	40 %	40 %	20 %	379743491
33	NC_016945	ACTGA	2	10	43606	43615	40 %	20 %	20 %	20 %	379743491
34	NC_016945	TTCAA	2	10	45761	45770	40 %	40 %	0 %	20 %	379743493
35	NC_016945	GTTGC	2	10	47422	47431	0 %	40 %	40 %	20 %	379743496
36	NC_016945	CAATC	2	10	47593	47602	40 %	20 %	0 %	40 %	379743496
37	NC_016945	CATTT	2	10	49975	49984	20 %	60 %	0 %	20 %	379743497
38	NC_016945	TACCT	2	10	55198	55207	20 %	40 %	0 %	40 %	379743501
39	NC_016945	GAACA	2	10	55783	55792	60 %	0 %	20 %	20 %	379743501
40	NC_016945	TGGTT	2	10	55811	55820	0 %	60 %	40 %	0 %	379743501
41	NC_016945	GCTTG	2	10	57532	57541	0 %	40 %	40 %	20 %	379743503
42	NC_016945	CATGC	2	10	57812	57821	20 %	20 %	20 %	40 %	379743503
43	NC_016945	AGTTG	2	10	61206	61215	20 %	40 %	40 %	0 %	379743505
44	NC_016945	CCATG	2	10	61834	61843	20 %	20 %	20 %	40 %	379743506
45	NC_016945	TGGTT	2	10	64108	64117	0 %	60 %	40 %	0 %	379743509
46	NC_016945	GATTT	2	10	64248	64257	20 %	60 %	20 %	0 %	379743509
47	NC_016945	AATGG	2	10	69142	69151	40 %	20 %	40 %	0 %	379743513
48	NC_016945	GCAAG	2	10	71047	71056	40 %	0 %	40 %	20 %	379743514
49	NC_016945	GACAA	2	10	72093	72102	60 %	0 %	20 %	20 %	379743514
50	NC_016945	TTGAC	2	10	73221	73230	20 %	40 %	20 %	20 %	379743515
51	NC_016945	CGCTA	2	10	73782	73791	20 %	20 %	20 %	40 %	379743515
52	NC_016945	TGTGG	2	10	74632	74641	0 %	40 %	60 %	0 %	379743515
53	NC_016945	TGCGC	2	10	74911	74920	0 %	20 %	40 %	40 %	379743515
54	NC_016945	AACCA	2	10	75002	75011	60 %	0 %	0 %	40 %	379743515
55	NC_016945	TGCTG	2	10	75387	75396	0 %	40 %	40 %	20 %	379743516
56	NC_016945	GCACC	2	10	76846	76855	20 %	0 %	20 %	60 %	379743517
57	NC_016945	ACAGG	2	10	76968	76977	40 %	0 %	40 %	20 %	379743517
58	NC_016945	ATTGG	2	10	77767	77776	20 %	40 %	40 %	0 %	379743518
59	NC_016945	ACCCA	2	10	82467	82476	40 %	0 %	0 %	60 %	379743522
60	NC_016945	ATTTC	2	10	83017	83026	20 %	60 %	0 %	20 %	379743523
61	NC_016945	GATCA	2	10	83801	83810	40 %	20 %	20 %	20 %	379743523
62	NC_016945	TTTCT	2	10	90571	90580	0 %	80 %	0 %	20 %	379743529
63	NC_016945	AGCAC	2	10	92914	92923	40 %	0 %	20 %	40 %	379743530
64	NC_016945	CTAAG	2	10	96657	96666	40 %	20 %	20 %	20 %	379743533
65	NC_016945	TACCA	2	10	98756	98765	40 %	20 %	0 %	40 %	379743536
66	NC_016945	GCTTG	2	10	100337	100346	0 %	40 %	40 %	20 %	379743538
67	NC_016945	TGCAA	2	10	100880	100889	40 %	20 %	20 %	20 %	379743539
68	NC_016945	AACCA	2	10	101249	101258	60 %	0 %	0 %	40 %	379743539
69	NC_016945	GGATT	2	10	109232	109241	20 %	40 %	40 %	0 %	379743547
70	NC_016945	CAATG	2	10	113455	113464	40 %	20 %	20 %	20 %	379743550
71	NC_016945	GCTCA	2	10	113884	113893	20 %	20 %	20 %	40 %	379743550
72	NC_016945	ACTCA	2	10	117262	117271	40 %	20 %	0 %	40 %	379743553
73	NC_016945	TTTCA	2	10	117944	117953	20 %	60 %	0 %	20 %	379743554
74	NC_016945	TGAAC	2	10	118643	118652	40 %	20 %	20 %	20 %	379743554
75	NC_016945	CCGAT	2	10	120200	120209	20 %	20 %	20 %	40 %	379743556
76	NC_016945	CGTCC	2	10	120243	120252	0 %	20 %	20 %	60 %	379743556
77	NC_016945	TGGGG	2	10	120567	120576	0 %	20 %	80 %	0 %	379743556
78	NC_016945	GGTAC	2	10	120943	120952	20 %	20 %	40 %	20 %	379743556
79	NC_016945	GTGAT	2	10	121252	121261	20 %	40 %	40 %	0 %	379743557
80	NC_016945	TCCTG	2	10	126753	126762	0 %	40 %	20 %	40 %	379743562
81	NC_016945	GCTGA	2	10	127657	127666	20 %	20 %	40 %	20 %	379743562
82	NC_016945	CTGCT	2	10	128444	128453	0 %	40 %	20 %	40 %	379743562
83	NC_016945	CAATC	2	10	129045	129054	40 %	20 %	0 %	40 %	379743563
84	NC_016945	ACCCT	2	10	130098	130107	20 %	20 %	0 %	60 %	379743563
85	NC_016945	AGCTG	2	10	130465	130474	20 %	20 %	40 %	20 %	379743564
86	NC_016945	CAGTG	2	10	131172	131181	20 %	20 %	40 %	20 %	379743565
87	NC_016945	AGCAC	2	10	131193	131202	40 %	0 %	20 %	40 %	379743565
88	NC_016945	CGATG	2	10	132325	132334	20 %	20 %	40 %	20 %	379743565
89	NC_016945	GCGTC	2	10	135498	135507	0 %	20 %	40 %	40 %	379743566
90	NC_016945	GATCA	2	10	135548	135557	40 %	20 %	20 %	20 %	379743566
91	NC_016945	TGATC	2	10	136842	136851	20 %	40 %	20 %	20 %	379743567
92	NC_016945	AGCCA	2	10	138162	138171	40 %	0 %	20 %	40 %	379743569
93	NC_016945	TGCTT	2	10	138438	138447	0 %	60 %	20 %	20 %	379743569
94	NC_016945	CGGAG	2	10	139347	139356	20 %	0 %	60 %	20 %	379743569
95	NC_016945	GGCGC	2	10	139564	139573	0 %	0 %	60 %	40 %	379743569
96	NC_016945	GAGCT	2	10	142542	142551	20 %	20 %	40 %	20 %	379743573
97	NC_016945	ACTGA	2	10	142995	143004	40 %	20 %	20 %	20 %	379743573
98	NC_016945	GCGTG	2	10	143036	143045	0 %	20 %	60 %	20 %	379743573
99	NC_016945	GATTG	2	10	147264	147273	20 %	40 %	40 %	0 %	379743577
100	NC_016945	GTTTG	2	10	147856	147865	0 %	60 %	40 %	0 %	379743578
101	NC_016945	TTCTT	2	10	148151	148160	0 %	80 %	0 %	20 %	379743578
102	NC_016945	GCGAT	2	10	154460	154469	20 %	20 %	40 %	20 %	379743585
103	NC_016945	TTGCC	2	10	154697	154706	0 %	40 %	20 %	40 %	379743585
104	NC_016945	GCGCT	2	10	157120	157129	0 %	20 %	40 %	40 %	379743586
105	NC_016945	CGGTG	2	10	158188	158197	0 %	20 %	60 %	20 %	379743587
106	NC_016945	AGTGA	2	10	158771	158780	40 %	20 %	40 %	0 %	379743587
107	NC_016945	GTTTG	2	10	158830	158839	0 %	60 %	40 %	0 %	379743587
108	NC_016945	TTTCC	2	10	161308	161317	0 %	60 %	0 %	40 %	379743590
109	NC_016945	AAACG	2	10	164640	164649	60 %	0 %	20 %	20 %	379743592
110	NC_016945	GGTGT	2	10	165451	165460	0 %	40 %	60 %	0 %	379743592
111	NC_016945	AACCA	2	10	172318	172327	60 %	0 %	0 %	40 %	379743598
112	NC_016945	AATCC	2	10	174239	174248	40 %	20 %	0 %	40 %	379743600
113	NC_016945	ATGGA	2	10	174977	174986	40 %	20 %	40 %	0 %	379743600
114	NC_016945	TGGCT	2	10	176538	176547	0 %	40 %	40 %	20 %	379743602
115	NC_016945	CTGAA	2	10	177478	177487	40 %	20 %	20 %	20 %	379743603
116	NC_016945	TCTGC	2	10	179585	179594	0 %	40 %	20 %	40 %	379743604
117	NC_016945	AGAGA	2	10	185242	185251	60 %	0 %	40 %	0 %	379743609
118	NC_016945	GCTGC	2	10	185644	185653	0 %	20 %	40 %	40 %	379743610
119	NC_016945	ATGGC	2	10	186368	186377	20 %	20 %	40 %	20 %	379743610
120	NC_016945	GATTG	2	10	189294	189303	20 %	40 %	40 %	0 %	379743612
121	NC_016945	GAGCT	2	10	192046	192055	20 %	20 %	40 %	20 %	379743615
122	NC_016945	CGGCA	2	10	195389	195398	20 %	0 %	40 %	40 %	379743618
123	NC_016945	GTTCA	2	10	195800	195809	20 %	40 %	20 %	20 %	379743618
124	NC_016945	AAACG	2	10	198785	198794	60 %	0 %	20 %	20 %	379743621
125	NC_016945	TTTGC	2	10	200996	201005	0 %	60 %	20 %	20 %	379743623
126	NC_016945	GCATC	2	10	204652	204661	20 %	20 %	20 %	40 %	379743627
127	NC_016945	TGGCT	2	10	205125	205134	0 %	40 %	40 %	20 %	379743628
128	NC_016945	AAACC	2	10	206807	206816	60 %	0 %	0 %	40 %	379743631
129	NC_016945	ATCAC	2	10	208941	208950	40 %	20 %	0 %	40 %	379743633
130	NC_016945	AATTC	2	10	215286	215295	40 %	40 %	0 %	20 %	379743638
131	NC_016945	AGAAA	2	10	218039	218048	80 %	0 %	20 %	0 %	379743640
132	NC_016945	GATAT	2	10	220189	220198	40 %	40 %	20 %	0 %	379743641
133	NC_016945	GGCTG	2	10	221470	221479	0 %	20 %	60 %	20 %	379743642
134	NC_016945	ACACC	2	10	222729	222738	40 %	0 %	0 %	60 %	379743643
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