MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 2898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016945	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016945	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016945	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016945	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	379743461
5	NC_016945	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
6	NC_016945	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	379743461
7	NC_016945	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	379743461
8	NC_016945	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	379743461
9	NC_016945	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	379743461
10	NC_016945	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	379743461
11	NC_016945	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	379743461
12	NC_016945	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	379743461
13	NC_016945	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016945	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	379743462
15	NC_016945	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	379743462
16	NC_016945	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016945	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	379743464
18	NC_016945	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	379743464
19	NC_016945	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	379743465
20	NC_016945	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	379743465
21	NC_016945	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	379743465
22	NC_016945	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	379743466
23	NC_016945	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	379743466
24	NC_016945	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	379743466
25	NC_016945	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	379743467
26	NC_016945	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
27	NC_016945	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	379743467
28	NC_016945	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	379743467
29	NC_016945	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	379743467
30	NC_016945	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	379743467
31	NC_016945	GTTA	2	8	8302	8309	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016945	CTTG	2	8	8396	8403	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016945	AGTG	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016945	AGCA	2	8	8716	8723	50 %	0 %	25 %	25 %	379743468
35	NC_016945	AATG	2	8	9249	9256	50 %	25 %	25 %	0 %	379743469
36	NC_016945	TGGT	2	8	9407	9414	0 %	50 %	50 %	0 %	379743469
37	NC_016945	TCAA	2	8	10010	10017	50 %	25 %	0 %	25 %	379743469
38	NC_016945	GCCA	2	8	10439	10446	25 %	0 %	25 %	50 %	379743469
39	NC_016945	TTGA	2	8	10498	10505	25 %	50 %	25 %	0 %	379743469
40	NC_016945	AGTT	2	8	10746	10753	25 %	50 %	25 %	0 %	379743469
41	NC_016945	GTTG	2	8	11103	11110	0 %	50 %	50 %	0 %	379743469
42	NC_016945	CACG	2	8	11175	11182	25 %	0 %	25 %	50 %	379743469
43	NC_016945	TCAC	2	8	12132	12139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016945	GTTT	2	8	12722	12729	0 %	75 %	25 %	0 %	379743470
45	NC_016945	ACCA	2	8	13345	13352	50 %	0 %	0 %	50 %	379743470
46	NC_016945	GAGT	2	8	13383	13390	25 %	25 %	50 %	0 %	379743470
47	NC_016945	GTGC	2	8	13462	13469	0 %	25 %	50 %	25 %	379743470
48	NC_016945	GCTG	2	8	13691	13698	0 %	25 %	50 %	25 %	379743470
49	NC_016945	GATG	2	8	14295	14302	25 %	25 %	50 %	0 %	379743470
50	NC_016945	CGAT	2	8	14860	14867	25 %	25 %	25 %	25 %	379743471
51	NC_016945	ATTG	2	8	15223	15230	25 %	50 %	25 %	0 %	379743471
52	NC_016945	TATG	2	8	18872	18879	25 %	50 %	25 %	0 %	379743472
53	NC_016945	GGAT	2	8	19126	19133	25 %	25 %	50 %	0 %	379743472
54	NC_016945	CAAG	2	8	19599	19606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016945	TCAT	2	8	19738	19745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016945	ATTC	2	8	19865	19872	25 %	50 %	0 %	25 %	379743473
57	NC_016945	GGAA	2	8	20411	20418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016945	TGCC	2	8	20733	20740	0 %	25 %	25 %	50 %	379743474
59	NC_016945	GCGG	2	8	21047	21054	0 %	0 %	75 %	25 %	379743474
60	NC_016945	CGGG	2	8	21604	21611	0 %	0 %	75 %	25 %	379743474
61	NC_016945	GGGC	2	8	21690	21697	0 %	0 %	75 %	25 %	379743474
62	NC_016945	TTTC	2	8	21747	21754	0 %	75 %	0 %	25 %	379743474
63	NC_016945	TTGA	2	8	21959	21966	25 %	50 %	25 %	0 %	379743474
64	NC_016945	CAAC	2	8	22042	22049	50 %	0 %	0 %	50 %	379743474
65	NC_016945	GCAG	2	8	22307	22314	25 %	0 %	50 %	25 %	379743474
66	NC_016945	TGGC	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	379743476
67	NC_016945	ATTG	2	8	23700	23707	25 %	50 %	25 %	0 %	379743476
68	NC_016945	CAAA	2	8	23722	23729	75 %	0 %	0 %	25 %	379743476
69	NC_016945	ATTT	2	8	24178	24185	25 %	75 %	0 %	0 %	379743476
70	NC_016945	ATGA	2	8	25302	25309	50 %	25 %	25 %	0 %	379743476
71	NC_016945	ATCG	2	8	25826	25833	25 %	25 %	25 %	25 %	379743476
72	NC_016945	ATGG	2	8	26270	26277	25 %	25 %	50 %	0 %	379743476
73	NC_016945	TTAT	2	8	26710	26717	25 %	75 %	0 %	0 %	379743477
74	NC_016945	ATTT	2	8	26807	26814	25 %	75 %	0 %	0 %	379743477
75	NC_016945	TGGG	2	8	27009	27016	0 %	25 %	75 %	0 %	379743477
76	NC_016945	TGTT	2	8	27027	27034	0 %	75 %	25 %	0 %	379743477
77	NC_016945	GCGG	2	8	27072	27079	0 %	0 %	75 %	25 %	379743477
78	NC_016945	AAGA	2	8	27129	27136	75 %	0 %	25 %	0 %	379743477
79	NC_016945	ATTG	2	8	27155	27162	25 %	50 %	25 %	0 %	379743477
80	NC_016945	ATTT	2	8	27525	27532	25 %	75 %	0 %	0 %	379743478
81	NC_016945	AATG	2	8	27677	27684	50 %	25 %	25 %	0 %	379743478
82	NC_016945	TGAC	2	8	28214	28221	25 %	25 %	25 %	25 %	379743479
83	NC_016945	ACAA	2	8	28481	28488	75 %	0 %	0 %	25 %	379743479
84	NC_016945	TTGA	2	8	28762	28769	25 %	50 %	25 %	0 %	379743479
85	NC_016945	TAAA	2	8	28947	28954	75 %	25 %	0 %	0 %	379743479
86	NC_016945	TGGT	2	8	31072	31079	0 %	50 %	50 %	0 %	379743481
87	NC_016945	ACTG	2	8	31125	31132	25 %	25 %	25 %	25 %	379743481
88	NC_016945	ATTG	2	8	31697	31704	25 %	50 %	25 %	0 %	379743481
89	NC_016945	TATT	2	8	31964	31971	25 %	75 %	0 %	0 %	379743482
90	NC_016945	TTGG	2	8	32321	32328	0 %	50 %	50 %	0 %	379743482
91	NC_016945	GCAA	2	8	32568	32575	50 %	0 %	25 %	25 %	379743482
92	NC_016945	AATC	2	8	32792	32799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016945	CAAA	2	8	32925	32932	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016945	ATCG	2	8	33843	33850	25 %	25 %	25 %	25 %	379743483
95	NC_016945	TATG	2	8	34410	34417	25 %	50 %	25 %	0 %	379743483
96	NC_016945	TACG	2	8	34705	34712	25 %	25 %	25 %	25 %	379743483
97	NC_016945	GACA	2	8	35049	35056	50 %	0 %	25 %	25 %	379743483
98	NC_016945	GTGA	2	8	35338	35345	25 %	25 %	50 %	0 %	379743483
99	NC_016945	TTGA	2	8	36117	36124	25 %	50 %	25 %	0 %	379743485
100	NC_016945	AATC	2	8	36933	36940	50 %	25 %	0 %	25 %	379743486
101	NC_016945	GTCA	2	8	37215	37222	25 %	25 %	25 %	25 %	379743486
102	NC_016945	GTTG	2	8	37427	37434	0 %	50 %	50 %	0 %	379743486
103	NC_016945	TGCA	2	8	37513	37520	25 %	25 %	25 %	25 %	379743486
104	NC_016945	TGAT	2	8	37543	37550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016945	TGGT	2	8	37831	37838	0 %	50 %	50 %	0 %	379743487
106	NC_016945	GGTT	2	8	38114	38121	0 %	50 %	50 %	0 %	379743487
107	NC_016945	TATG	2	8	38396	38403	25 %	50 %	25 %	0 %	379743487
108	NC_016945	AACG	2	8	39032	39039	50 %	0 %	25 %	25 %	379743487
109	NC_016945	TGAG	2	8	39794	39801	25 %	25 %	50 %	0 %	379743488
110	NC_016945	AGTG	2	8	40368	40375	25 %	25 %	50 %	0 %	379743489
111	NC_016945	GCAA	2	8	40568	40575	50 %	0 %	25 %	25 %	379743489
112	NC_016945	ACGT	2	8	40730	40737	25 %	25 %	25 %	25 %	379743489
113	NC_016945	TGGA	2	8	41425	41432	25 %	25 %	50 %	0 %	379743489
114	NC_016945	TCGT	2	8	41678	41685	0 %	50 %	25 %	25 %	379743489
115	NC_016945	TGTT	2	8	42026	42033	0 %	75 %	25 %	0 %	379743489
116	NC_016945	CAAG	2	8	43671	43678	50 %	0 %	25 %	25 %	379743491
117	NC_016945	TTTC	2	8	43751	43758	0 %	75 %	0 %	25 %	379743491
118	NC_016945	GTCG	2	8	44130	44137	0 %	25 %	50 %	25 %	379743492
119	NC_016945	CAAA	2	8	44228	44235	75 %	0 %	0 %	25 %	379743492
120	NC_016945	CCGC	2	8	44266	44273	0 %	0 %	25 %	75 %	379743492
121	NC_016945	AGTA	2	8	44441	44448	50 %	25 %	25 %	0 %	379743492
122	NC_016945	AAGT	2	8	45437	45444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016945	AGAA	2	8	46063	46070	75 %	0 %	25 %	0 %	379743493
124	NC_016945	CTTT	2	8	46114	46121	0 %	75 %	0 %	25 %	379743494
125	NC_016945	TGGT	2	8	46287	46294	0 %	50 %	50 %	0 %	379743494
126	NC_016945	TGGG	2	8	46921	46928	0 %	25 %	75 %	0 %	379743495
127	NC_016945	TTTC	2	8	47478	47485	0 %	75 %	0 %	25 %	379743496
128	NC_016945	CATA	2	8	47670	47677	50 %	25 %	0 %	25 %	379743496
129	NC_016945	CAGG	2	8	47712	47719	25 %	0 %	50 %	25 %	379743496
130	NC_016945	TGAG	2	8	48371	48378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016945	TGGG	2	8	48894	48901	0 %	25 %	75 %	0 %	379743497
132	NC_016945	GTTG	2	8	49518	49525	0 %	50 %	50 %	0 %	379743497
133	NC_016945	CTTT	2	8	49932	49939	0 %	75 %	0 %	25 %	379743497
134	NC_016945	ATCT	2	8	50936	50943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016945	AGTG	2	8	51297	51304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016945	ATCG	2	8	51751	51758	25 %	25 %	25 %	25 %	379743500
137	NC_016945	TCTG	2	8	52228	52235	0 %	50 %	25 %	25 %	379743500
138	NC_016945	AAGC	2	8	52400	52407	50 %	0 %	25 %	25 %	379743500
139	NC_016945	CTCA	2	8	53320	53327	25 %	25 %	0 %	50 %	379743500
140	NC_016945	AATC	2	8	53410	53417	50 %	25 %	0 %	25 %	379743500
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142	NC_016945	GAAA	2	8	53968	53975	75 %	0 %	25 %	0 %	379743500
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