MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 1752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016944	CAGTG	2	10	2878	2887	20 %	20 %	40 %	20 %	379739911
2	NC_016944	CGCAG	2	10	5470	5479	20 %	0 %	40 %	40 %	379739915
3	NC_016944	TCTGC	2	10	5631	5640	0 %	40 %	20 %	40 %	379739916
4	NC_016944	TTGAT	2	10	5790	5799	20 %	60 %	20 %	0 %	379739916
5	NC_016944	AAGTG	2	10	9241	9250	40 %	20 %	40 %	0 %	379739919
6	NC_016944	AGCTC	2	10	9415	9424	20 %	20 %	20 %	40 %	379739919
7	NC_016944	CTGCG	2	10	9863	9872	0 %	20 %	40 %	40 %	379739919
8	NC_016944	CCAAA	2	10	12107	12116	60 %	0 %	0 %	40 %	379739921
9	NC_016944	AAGCG	2	10	12200	12209	40 %	0 %	40 %	20 %	379739921
10	NC_016944	GCTGA	2	10	13068	13077	20 %	20 %	40 %	20 %	379739921
11	NC_016944	GCTAA	2	10	15712	15721	40 %	20 %	20 %	20 %	379739925
12	NC_016944	CGCAG	2	10	15779	15788	20 %	0 %	40 %	40 %	379739925
13	NC_016944	GGTTG	2	10	15975	15984	0 %	40 %	60 %	0 %	379739925
14	NC_016944	TGGTT	2	10	17271	17280	0 %	60 %	40 %	0 %	379739926
15	NC_016944	TCTGC	2	10	17804	17813	0 %	40 %	20 %	40 %	379739926
16	NC_016944	TCGAT	2	10	18011	18020	20 %	40 %	20 %	20 %	379739926
17	NC_016944	GGCGT	2	10	18782	18791	0 %	20 %	60 %	20 %	379739926
18	NC_016944	TTCTG	2	10	18954	18963	0 %	60 %	20 %	20 %	379739927
19	NC_016944	CCAGA	2	10	19313	19322	40 %	0 %	20 %	40 %	379739927
20	NC_016944	GTACC	2	10	23864	23873	20 %	20 %	20 %	40 %	379739933
21	NC_016944	TGCAT	2	10	27490	27499	20 %	40 %	20 %	20 %	379739935
22	NC_016944	CGCAG	2	10	28007	28016	20 %	0 %	40 %	40 %	379739937
23	NC_016944	ATACA	2	10	28927	28936	60 %	20 %	0 %	20 %	379739937
24	NC_016944	GCACC	2	10	30873	30882	20 %	0 %	20 %	60 %	379739938
25	NC_016944	GCCAT	2	10	33423	33432	20 %	20 %	20 %	40 %	379739941
26	NC_016944	TAAAG	2	10	35142	35151	60 %	20 %	20 %	0 %	379739942
27	NC_016944	CTCTG	2	10	38580	38589	0 %	40 %	20 %	40 %	379739946
28	NC_016944	AATCC	2	10	39300	39309	40 %	20 %	0 %	40 %	379739947
29	NC_016944	CGGCG	2	10	40841	40850	0 %	0 %	60 %	40 %	379739948
30	NC_016944	GCAGC	2	10	42521	42530	20 %	0 %	40 %	40 %	379739949
31	NC_016944	AAAAG	2	10	48181	48190	80 %	0 %	20 %	0 %	379739955
32	NC_016944	CAATC	2	10	49074	49083	40 %	20 %	0 %	40 %	379739956
33	NC_016944	TGCGC	2	10	50139	50148	0 %	20 %	40 %	40 %	379739958
34	NC_016944	GTTTG	2	10	50184	50193	0 %	60 %	40 %	0 %	379739958
35	NC_016944	AAGAT	2	10	50741	50750	60 %	20 %	20 %	0 %	379739959
36	NC_016944	AGCAC	2	10	53232	53241	40 %	0 %	20 %	40 %	379739962
37	NC_016944	GCAGC	2	10	63661	63670	20 %	0 %	40 %	40 %	379739967
38	NC_016944	GCTGC	2	10	64650	64659	0 %	20 %	40 %	40 %	379739969
39	NC_016944	CCAAG	2	10	64735	64744	40 %	0 %	20 %	40 %	379739969
40	NC_016944	CAGCG	2	10	68293	68302	20 %	0 %	40 %	40 %	379739972
41	NC_016944	GTTGG	2	10	71572	71581	0 %	40 %	60 %	0 %	379739976
42	NC_016944	TCCGA	2	10	74364	74373	20 %	20 %	20 %	40 %	379739977
43	NC_016944	CAAGC	2	10	75944	75953	40 %	0 %	20 %	40 %	379739979
44	NC_016944	GCCAC	2	10	77024	77033	20 %	0 %	20 %	60 %	379739981
45	NC_016944	GCGCT	2	10	77475	77484	0 %	20 %	40 %	40 %	379739982
46	NC_016944	AAGCC	2	10	79927	79936	40 %	0 %	20 %	40 %	379739984
47	NC_016944	CAAGC	2	10	83383	83392	40 %	0 %	20 %	40 %	379739988
48	NC_016944	GCTTT	2	10	87511	87520	0 %	60 %	20 %	20 %	379739992
49	NC_016944	ATGGC	2	10	87932	87941	20 %	20 %	40 %	20 %	379739993
50	NC_016944	GATCC	2	10	88010	88019	20 %	20 %	20 %	40 %	379739993
51	NC_016944	CATCA	2	10	89509	89518	40 %	20 %	0 %	40 %	379739994
52	NC_016944	GATCA	2	10	90598	90607	40 %	20 %	20 %	20 %	379739995
53	NC_016944	AGCTG	2	10	93136	93145	20 %	20 %	40 %	20 %	379739996
54	NC_016944	GAAGA	2	10	93146	93155	60 %	0 %	40 %	0 %	379739996
55	NC_016944	TCATC	2	10	95879	95888	20 %	40 %	0 %	40 %	379740000
56	NC_016944	TCACC	2	10	96563	96572	20 %	20 %	0 %	60 %	379740000
57	NC_016944	AGTTG	2	10	100286	100295	20 %	40 %	40 %	0 %	379740003
58	NC_016944	GATCT	2	10	100916	100925	20 %	40 %	20 %	20 %	379740004
59	NC_016944	AAAGC	2	10	104347	104356	60 %	0 %	20 %	20 %	379740006
60	NC_016944	ACAGC	2	10	104510	104519	40 %	0 %	20 %	40 %	379740006
61	NC_016944	AAAGT	2	10	105805	105814	60 %	20 %	20 %	0 %	379740006
62	NC_016944	GTTCC	2	10	107966	107975	0 %	40 %	20 %	40 %	379740008
63	NC_016944	CGCAG	2	10	110866	110875	20 %	0 %	40 %	40 %	379740012
64	NC_016944	GCGAT	2	10	112961	112970	20 %	20 %	40 %	20 %	379740014
65	NC_016944	GCTTG	2	10	113174	113183	0 %	40 %	40 %	20 %	379740014
66	NC_016944	CGATG	2	10	114025	114034	20 %	20 %	40 %	20 %	379740015
67	NC_016944	CCGTA	2	10	118528	118537	20 %	20 %	20 %	40 %	379740017
68	NC_016944	CACTG	2	10	119094	119103	20 %	20 %	20 %	40 %	379740019
69	NC_016944	CGCAG	2	10	119762	119771	20 %	0 %	40 %	40 %	379740020
70	NC_016944	TTTTG	2	10	124600	124609	0 %	80 %	20 %	0 %	379740025
71	NC_016944	CAAGC	2	10	124660	124669	40 %	0 %	20 %	40 %	379740025
72	NC_016944	CTTGC	2	10	124840	124849	0 %	40 %	20 %	40 %	379740025
73	NC_016944	GGCAG	2	10	125220	125229	20 %	0 %	60 %	20 %	379740025
74	NC_016944	GTTGG	2	10	126663	126672	0 %	40 %	60 %	0 %	379740026
75	NC_016944	TTGTA	2	10	127005	127014	20 %	60 %	20 %	0 %	379740027
76	NC_016944	CTTCG	2	10	130574	130583	0 %	40 %	20 %	40 %	379740029
77	NC_016944	TCGGA	2	10	132126	132135	20 %	20 %	40 %	20 %	379740031
78	NC_016944	GGACA	2	10	132180	132189	40 %	0 %	40 %	20 %	379740031
79	NC_016944	TTTTG	2	10	135000	135009	0 %	80 %	20 %	0 %	379740036
80	NC_016944	TTGGT	2	10	135045	135054	0 %	60 %	40 %	0 %	379740036
81	NC_016944	TGGTG	2	10	135517	135526	0 %	40 %	60 %	0 %	379740037
82	NC_016944	AAGCC	2	10	137058	137067	40 %	0 %	20 %	40 %	379740040
83	NC_016944	GCAAG	2	10	137592	137601	40 %	0 %	40 %	20 %	379740040
84	NC_016944	CAAAA	2	10	137797	137806	80 %	0 %	0 %	20 %	379740040
85	NC_016944	TGGTT	2	10	139607	139616	0 %	60 %	40 %	0 %	379740042
86	NC_016944	ATTAC	2	10	140123	140132	40 %	40 %	0 %	20 %	379740043
87	NC_016944	GATGG	2	10	142309	142318	20 %	20 %	60 %	0 %	379740044
88	NC_016944	AAAGA	2	10	142804	142813	80 %	0 %	20 %	0 %	379740045
89	NC_016944	TGCTT	2	10	143538	143547	0 %	60 %	20 %	20 %	379740046
90	NC_016944	CTCAG	2	10	143607	143616	20 %	20 %	20 %	40 %	379740046
91	NC_016944	GAGTT	2	10	146811	146820	20 %	40 %	40 %	0 %	379740048
92	NC_016944	TGATT	2	10	147727	147736	20 %	60 %	20 %	0 %	379740049
93	NC_016944	TTGGG	2	10	148809	148818	0 %	40 %	60 %	0 %	379740049
94	NC_016944	GCAAA	2	10	149959	149968	60 %	0 %	20 %	20 %	379740050
95	NC_016944	GCTTG	2	10	150150	150159	0 %	40 %	40 %	20 %	379740051
96	NC_016944	ATGAA	2	10	158660	158669	60 %	20 %	20 %	0 %	379740053
97	NC_016944	AACGC	2	10	158812	158821	40 %	0 %	20 %	40 %	379740053
98	NC_016944	CCAGA	2	10	159571	159580	40 %	0 %	20 %	40 %	379740055
99	NC_016944	GCACC	2	10	160117	160126	20 %	0 %	20 %	60 %	379740055
100	NC_016944	TGGCT	2	10	160663	160672	0 %	40 %	40 %	20 %	379740055
101	NC_016944	GAACT	2	10	160754	160763	40 %	20 %	20 %	20 %	379740055
102	NC_016944	CAAGA	2	10	164421	164430	60 %	0 %	20 %	20 %	379740058
103	NC_016944	TGGTC	2	10	169555	169564	0 %	40 %	40 %	20 %	379740061
104	NC_016944	GCCGA	2	10	169772	169781	20 %	0 %	40 %	40 %	379740061
105	NC_016944	CGCGA	2	10	169936	169945	20 %	0 %	40 %	40 %	379740061
106	NC_016944	CTGGG	2	10	172564	172573	0 %	20 %	60 %	20 %	379740063
107	NC_016944	AATAA	2	10	176235	176244	80 %	20 %	0 %	0 %	379740066
108	NC_016944	ATCTT	2	10	184151	184160	20 %	60 %	0 %	20 %	379740075
109	NC_016944	TTTCT	2	10	186536	186545	0 %	80 %	0 %	20 %	379740077
110	NC_016944	TTTGT	2	10	187960	187969	0 %	80 %	20 %	0 %	379740077
111	NC_016944	TTTTC	2	10	188222	188231	0 %	80 %	0 %	20 %	379740078
112	NC_016944	TTTTC	2	10	188508	188517	0 %	80 %	0 %	20 %	379740078
113	NC_016944	GCTCA	2	10	190328	190337	20 %	20 %	20 %	40 %	379740079
114	NC_016944	GCCAA	2	10	193543	193552	40 %	0 %	20 %	40 %	379740081
115	NC_016944	TGTGG	2	10	194480	194489	0 %	40 %	60 %	0 %	379740082
116	NC_016944	TGGCG	2	10	194989	194998	0 %	20 %	60 %	20 %	379740082
117	NC_016944	GGGTC	2	10	198341	198350	0 %	20 %	60 %	20 %	379740084
118	NC_016944	ACCAC	2	10	198505	198514	40 %	0 %	0 %	60 %	379740084
119	NC_016944	CGAGG	2	10	200030	200039	20 %	0 %	60 %	20 %	379740085
120	NC_016944	ACCAC	2	10	201532	201541	40 %	0 %	0 %	60 %	379740086
121	NC_016944	AGCTC	2	10	205279	205288	20 %	20 %	20 %	40 %	379740090
122	NC_016944	GCGCT	2	10	206752	206761	0 %	20 %	40 %	40 %	379740091
123	NC_016944	CCAAC	2	10	208124	208133	40 %	0 %	0 %	60 %	379740091
124	NC_016944	GCGCT	2	10	209330	209339	0 %	20 %	40 %	40 %	379740092
125	NC_016944	CCAAC	2	10	210119	210128	40 %	0 %	0 %	60 %	379740093
126	NC_016944	CTCAC	2	10	210708	210717	20 %	20 %	0 %	60 %	379740094
127	NC_016944	CACTG	2	10	211895	211904	20 %	20 %	20 %	40 %	379740094
128	NC_016944	GCTTG	2	10	212051	212060	0 %	40 %	40 %	20 %	379740094
129	NC_016944	TGTGA	2	10	217943	217952	20 %	40 %	40 %	0 %	379740100
130	NC_016944	TGTGC	2	10	218107	218116	0 %	40 %	40 %	20 %	379740100
131	NC_016944	TCGGT	2	10	220784	220793	0 %	40 %	40 %	20 %	379740103
132	NC_016944	TGAGT	2	10	227108	227117	20 %	40 %	40 %	0 %	379740110
133	NC_016944	GCGCG	2	10	228686	228695	0 %	0 %	60 %	40 %	379740112
134	NC_016944	GCAGC	3	15	229382	229396	20 %	0 %	40 %	40 %	379740113
135	NC_016944	ATCGC	2	10	230260	230269	20 %	20 %	20 %	40 %	379740114
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168	NC_016944	TTGGG	2	10	280552	280561	0 %	40 %	60 %	0 %	379740162
169	NC_016944	TCAGC	2	10	281245	281254	20 %	20 %	20 %	40 %	379740163
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251	NC_016944	TGGTT	2	10	433085	433094	0 %	60 %	40 %	0 %	379740280
252	NC_016944	ACATC	2	10	436854	436863	40 %	20 %	0 %	40 %	379740286
253	NC_016944	GGCAG	2	10	440855	440864	20 %	0 %	60 %	20 %	379740289
254	NC_016944	TTTGA	2	10	441420	441429	20 %	60 %	20 %	0 %	379740289
255	NC_016944	CGAAT	2	10	441986	441995	40 %	20 %	20 %	20 %	379740289
256	NC_016944	AAGCC	2	10	442478	442487	40 %	0 %	20 %	40 %	379740290
257	NC_016944	TGGAG	2	10	444548	444557	20 %	20 %	60 %	0 %	379740292
258	NC_016944	GCGCA	2	10	445862	445871	20 %	0 %	40 %	40 %	379740294
259	NC_016944	TCTGG	2	10	448057	448066	0 %	40 %	40 %	20 %	379740295
260	NC_016944	GGCGC	2	10	448646	448655	0 %	0 %	60 %	40 %	379740295
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