MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 33881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016944	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739909
2	NC_016944	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739909
3	NC_016944	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739909
4	NC_016944	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739909
5	NC_016944	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739909
6	NC_016944	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739909
7	NC_016944	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739909
8	NC_016944	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739910
9	NC_016944	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739910
10	NC_016944	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739910
11	NC_016944	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739910
12	NC_016944	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739910
13	NC_016944	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739910
14	NC_016944	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739910
15	NC_016944	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739910
16	NC_016944	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739910
17	NC_016944	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739910
18	NC_016944	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739910
19	NC_016944	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739910
20	NC_016944	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739910
21	NC_016944	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739910
22	NC_016944	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739910
23	NC_016944	AAT	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739910
24	NC_016944	ACC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739910
25	NC_016944	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739910
26	NC_016944	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739911
27	NC_016944	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
28	NC_016944	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
29	NC_016944	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739911
30	NC_016944	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739911
31	NC_016944	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
32	NC_016944	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
33	NC_016944	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739911
34	NC_016944	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
35	NC_016944	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739911
36	NC_016944	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739911
37	NC_016944	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
38	NC_016944	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739911
39	NC_016944	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
40	NC_016944	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739911
41	NC_016944	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739911
42	NC_016944	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739911
43	NC_016944	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
44	NC_016944	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
45	NC_016944	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739911
46	NC_016944	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739911
47	NC_016944	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739911
48	NC_016944	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739911
49	NC_016944	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739911
50	NC_016944	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739911
51	NC_016944	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739911
52	NC_016944	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739911
53	NC_016944	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739911
54	NC_016944	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739911
55	NC_016944	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739912
56	NC_016944	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739912
57	NC_016944	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739912
58	NC_016944	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739913
59	NC_016944	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739913
60	NC_016944	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739913
61	NC_016944	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379739913
62	NC_016944	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739914
63	NC_016944	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739914
64	NC_016944	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739914
65	NC_016944	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739915
66	NC_016944	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739915
67	NC_016944	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739915
68	NC_016944	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739915
69	NC_016944	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739915
70	NC_016944	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739915
71	NC_016944	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739915
72	NC_016944	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739915
73	NC_016944	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739915
74	NC_016944	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739915
75	NC_016944	ACC	3	9	5669	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739916
76	NC_016944	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739916
77	NC_016944	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739916
78	NC_016944	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739916
79	NC_016944	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739916
80	NC_016944	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739916
81	NC_016944	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739916
82	NC_016944	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739917
83	NC_016944	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739917
84	NC_016944	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739917
85	NC_016944	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
86	NC_016944	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739918
87	NC_016944	GCC	2	6	7650	7655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739918
88	NC_016944	TGG	2	6	7659	7664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739918
89	NC_016944	CGG	2	6	7704	7709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739918
90	NC_016944	TCG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
91	NC_016944	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739918
92	NC_016944	TGC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
93	NC_016944	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739918
94	NC_016944	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739918
95	NC_016944	GGC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739918
96	NC_016944	TGC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
97	NC_016944	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739918
98	NC_016944	AAC	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739918
99	NC_016944	GTG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739918
100	NC_016944	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739918
101	NC_016944	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739918
102	NC_016944	CTA	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739918
103	NC_016944	TTG	2	6	8105	8110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739918
104	NC_016944	CGA	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739918
105	NC_016944	CAA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379739918
106	NC_016944	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739918
107	NC_016944	CTG	2	6	8180	8185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739918
108	NC_016944	ATT	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739918
109	NC_016944	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739918
110	NC_016944	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739918
111	NC_016944	GCC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379739918
112	NC_016944	TGA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379739918
113	NC_016944	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739918
114	NC_016944	ATA	2	6	8541	8546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379739918
115	NC_016944	AGA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739918
116	NC_016944	TAC	2	6	8567	8572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739918
117	NC_016944	GGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379739918
118	NC_016944	AGA	2	6	8776	8781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739918
119	NC_016944	GCA	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739919
120	NC_016944	GGT	2	6	8936	8941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739919
121	NC_016944	TTG	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379739919
122	NC_016944	TGC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739919
123	NC_016944	CTA	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739919
124	NC_016944	CAC	2	6	9364	9369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379739919
125	NC_016944	TGC	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379739919
126	NC_016944	GTG	2	6	9708	9713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739919
127	NC_016944	AAG	3	9	9768	9776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379739919
128	NC_016944	TGG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379739919
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130	NC_016944	CAG	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379739920
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253	NC_016944	TAC	2	6	20306	20311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739928
254	NC_016944	ATT	2	6	20391	20396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379739928
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258	NC_016944	CTT	2	6	20603	20608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379739928
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500	NC_016944	CTA	2	6	40751	40756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379739948

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