MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Blastococcus saxobsidens DD2

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016943	CCTTGG	2	12	9970	9981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016943	CCCCGG	2	12	13332	13343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016943	GCCACC	2	12	35311	35322	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016943	GCCCCC	2	12	38279	38290	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
5	NC_016943	TCCCGG	2	12	57980	57991	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016943	GCACCC	2	12	64829	64840	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016943	CGGCGA	2	12	68944	68955	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016943	CGGTGG	2	12	75620	75631	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016943	CGGGCG	2	12	82602	82613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016943	GGCCGG	2	12	122340	122351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016943	TCGCCG	2	12	130232	130243	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016943	GGGGTG	2	12	166202	166213	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016943	AGTGCA	2	12	168111	168122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016943	CCGGCA	2	12	168183	168194	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016943	CGCACC	2	12	173295	173306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016943	TCGCCG	2	12	186246	186257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016943	ACGGCG	2	12	186619	186630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016943	CCGCCC	2	12	245789	245800	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_016943	CGGCCC	2	12	261659	261670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016943	CACCGA	2	12	315141	315152	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016943	ACCGGC	2	12	326733	326744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016943	CGGCCG	2	12	378406	378417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016943	CCGGAC	2	12	404325	404336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016943	CAGCCG	2	12	421253	421264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016943	CCTATG	2	12	438989	439000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016943	CATAGG	2	12	439017	439028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016943	CACCGC	2	12	453440	453451	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016943	GTCGGC	2	12	454222	454233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016943	GAGGCG	2	12	460130	460141	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016943	CCGCCT	2	12	531802	531813	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016943	TCGGCA	2	12	586064	586075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016943	GAGGCC	2	12	586387	586398	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016943	CGGGTG	2	12	656738	656749	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016943	GCGCCG	2	12	681175	681186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016943	CTGATT	2	12	683037	683048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016943	CGCCGT	2	12	712984	712995	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016943	GTGCCG	2	12	732789	732800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016943	GCGGCC	2	12	759656	759667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016943	GGGCGG	4	24	773623	773646	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016943	GCTGCC	2	12	790195	790206	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016943	CGGACG	2	12	803922	803933	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016943	CCTTGG	2	12	804055	804066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016943	CGCCGG	2	12	833848	833859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016943	CGGCAC	2	12	838320	838331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016943	CAGGGC	2	12	838405	838416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016943	CGGGGC	2	12	849476	849487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016943	GCGAGC	2	12	864020	864031	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016943	GCGGGC	2	12	874700	874711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016943	GGTCGG	2	12	929301	929312	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016943	CCCGGA	2	12	950243	950254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016943	GCCCCG	2	12	951158	951169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016943	CGCGTG	2	12	998212	998223	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016943	CGCGGT	2	12	1051686	1051697	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016943	TGGCCG	2	12	1052502	1052513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016943	CGGTCG	2	12	1077210	1077221	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016943	CGTCGG	2	12	1081311	1081322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016943	TGACGA	2	12	1093243	1093254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016943	CCGGCC	2	12	1152971	1152982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016943	GGACGG	5	30	1174403	1174432	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016943	GTCAAC	2	12	1182611	1182622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016943	GACCAC	2	12	1199694	1199705	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016943	CTCCCG	2	12	1206890	1206901	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016943	AGCCGG	2	12	1214928	1214939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016943	CGCCGG	2	12	1226859	1226870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016943	GGTGCC	3	18	1245105	1245122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016943	CCCACC	2	12	1283577	1283588	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_016943	TTCCGC	2	12	1290746	1290757	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016943	CGACCC	2	12	1308962	1308973	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016943	GGGTCG	2	12	1313818	1313829	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016943	TGACCC	2	12	1413313	1413324	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016943	GGCCGG	2	12	1468235	1468246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016943	CATCGG	2	12	1468332	1468343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016943	TCCGCC	2	12	1523279	1523290	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016943	GCTCGG	2	12	1566422	1566433	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016943	GGGGGA	2	12	1588767	1588778	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016943	ACCCGC	2	12	1592867	1592878	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016943	GTTGTC	2	12	1631941	1631952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016943	CCGGGC	2	12	1635053	1635064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016943	GGCACG	2	12	1661437	1661448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016943	GGTGCA	2	12	1670274	1670285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016943	TCACCG	2	12	1687226	1687237	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016943	TCGTCC	2	12	1713448	1713459	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016943	GCGACG	2	12	1727048	1727059	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016943	TCGAGG	2	12	1745238	1745249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016943	GGCGGG	2	12	1788883	1788894	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_016943	TCCCGC	2	12	1801597	1801608	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016943	CCTGGG	2	12	1823831	1823842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016943	CCGGGG	2	12	1849570	1849581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016943	GACGCG	2	12	1859892	1859903	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016943	CTGGCG	2	12	1859991	1860002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016943	GACGGC	2	12	1873550	1873561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016943	GTGGCG	4	24	1877446	1877469	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016943	GTCCAG	2	12	1970740	1970751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016943	CGACGG	2	12	1981418	1981429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016943	CCGGCG	2	12	2059993	2060004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016943	GCTCCG	2	12	2164779	2164790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016943	CCCCGA	2	12	2167711	2167722	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_016943	CCCGGT	2	12	2190213	2190224	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016943	GGCCCG	2	12	2246698	2246709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016943	GCGGCC	2	12	2308071	2308082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016943	CCTTGG	2	12	2339719	2339730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016943	CGGGCG	2	12	2341355	2341366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016943	GGGGTG	2	12	2358147	2358158	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016943	AGTGCA	2	12	2360056	2360067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016943	CCGGCA	2	12	2360128	2360139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016943	GGCGTC	2	12	2365085	2365096	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016943	CGTCCG	2	12	2367126	2367137	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016943	TGCCGC	2	12	2393794	2393805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016943	TCGTCT	2	12	2398377	2398388	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016943	TGGAAG	2	12	2411769	2411780	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016943	GGGTGC	2	12	2419568	2419579	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016943	ACGATC	2	12	2522917	2522928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016943	CGCGGA	2	12	2636546	2636557	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016943	GAGGTG	2	12	2651087	2651098	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016943	GGACGA	2	12	2668077	2668088	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016943	CCTGGG	2	12	2721749	2721760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016943	CGGCGC	2	12	2764473	2764484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016943	ACGCCG	2	12	2778335	2778346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016943	GTCCGT	2	12	2797006	2797017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016943	GACGCC	2	12	2800964	2800975	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016943	CCCCGC	2	12	2847317	2847328	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
122	NC_016943	TGCTCC	2	12	2865772	2865783	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016943	CGACGG	2	12	2865950	2865961	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016943	AGCCCG	2	12	2866567	2866578	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016943	CGGCCG	2	12	2866643	2866654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016943	GGCCGT	2	12	2919082	2919093	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016943	CCAGTA	2	12	2956133	2956144	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016943	CGGCCG	2	12	3084443	3084454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016943	GCTCGC	2	12	3100055	3100066	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016943	TGCCCG	2	12	3100744	3100755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016943	GCACCT	2	12	3100841	3100852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016943	CCCGGG	2	12	3107918	3107929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016943	GCGACG	2	12	3148491	3148502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016943	GCGACC	2	12	3201569	3201580	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016943	CCGTTC	2	12	3230832	3230843	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016943	CTCGCG	2	12	3248533	3248544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016943	CCGGCC	2	12	3276235	3276246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016943	GACGGC	2	12	3277245	3277256	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016943	CCAAGA	2	12	3282235	3282246	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016943	TAGCCC	2	12	3369845	3369856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016943	CTCTGG	2	12	3394653	3394664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016943	GACGAT	2	12	3459474	3459485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_016943	GGCGGA	2	12	3520671	3520682	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_016943	TCCCCC	2	12	3534360	3534371	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
145	NC_016943	TGCCGG	2	12	3587590	3587601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016943	TGCACT	2	12	3587662	3587673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016943	CACCCC	2	12	3589571	3589582	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
148	NC_016943	CCACAA	2	12	3592297	3592308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016943	GAACGG	2	12	3597740	3597751	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_016943	ACGGCC	2	12	3608330	3608341	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016943	CGTGGC	2	12	3753699	3753710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016943	GCTTCG	2	12	3754166	3754177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_016943	CGACGG	2	12	3816971	3816982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_016943	TCTCCC	2	12	3824918	3824929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_016943	GTCCCG	2	12	3832851	3832862	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_016943	CGCGTG	2	12	3874006	3874017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_016943	ACGGGC	2	12	3877004	3877015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_016943	GGGTTC	2	12	3911642	3911653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_016943	ACGGTC	2	12	3927724	3927735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_016943	GCCGTA	2	12	3955226	3955237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_016943	TTGCAT	2	12	3956225	3956236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_016943	GCCTCC	2	12	3967431	3967442	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_016943	CTCTCG	2	12	3981653	3981664	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
164	NC_016943	TCCGGG	2	12	4017321	4017332	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_016943	CGACGG	2	12	4017678	4017689	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_016943	CGGGCA	2	12	4069701	4069712	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_016943	GCCGCG	2	12	4079843	4079854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_016943	CGCCGG	2	12	4083378	4083389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_016943	CGGCGT	2	12	4093274	4093285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_016943	CGGCGC	2	12	4494046	4494057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
180	NC_016943	GGCTGG	2	12	4494080	4494091	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
181	NC_016943	CGGCTG	2	12	4494133	4494144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.