MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132 plasmid pST75

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016942	ATCAC	2	10	3303	3312	40 %	20 %	0 %	40 %	379793808
2	NC_016942	TTTAA	2	10	4512	4521	40 %	60 %	0 %	0 %	379793810
3	NC_016942	ATATT	2	10	5027	5036	40 %	60 %	0 %	0 %	379793811
4	NC_016942	ATTGA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	20 %	0 %	379793811
5	NC_016942	CTTTT	2	10	5746	5755	0 %	80 %	0 %	20 %	379793811
6	NC_016942	CGAAG	2	10	10392	10401	40 %	0 %	40 %	20 %	379793816
7	NC_016942	AATAA	2	10	10764	10773	80 %	20 %	0 %	0 %	379793816
8	NC_016942	ATTCA	2	10	12020	12029	40 %	40 %	0 %	20 %	379793817
9	NC_016942	TTCAA	2	10	12367	12376	40 %	40 %	0 %	20 %	379793817
10	NC_016942	CTTTT	2	10	13722	13731	0 %	80 %	0 %	20 %	379793818
11	NC_016942	CAAAT	2	10	14715	14724	60 %	20 %	0 %	20 %	379793819
12	NC_016942	AAATT	2	10	16236	16245	60 %	40 %	0 %	0 %	379793821
13	NC_016942	ATATT	2	10	17186	17195	40 %	60 %	0 %	0 %	379793822
14	NC_016942	TAATT	2	10	17603	17612	40 %	60 %	0 %	0 %	379793823
15	NC_016942	TTGAG	2	10	17615	17624	20 %	40 %	40 %	0 %	379793823
16	NC_016942	TATGA	2	10	17776	17785	40 %	40 %	20 %	0 %	379793823
17	NC_016942	GTATC	2	10	18543	18552	20 %	40 %	20 %	20 %	379793823
18	NC_016942	TTATG	2	10	18747	18756	20 %	60 %	20 %	0 %	379793823
19	NC_016942	AATTA	2	10	19572	19581	60 %	40 %	0 %	0 %	379793824
20	NC_016942	TTTGT	2	10	21184	21193	0 %	80 %	20 %	0 %	379793825
21	NC_016942	GTAAA	2	10	21607	21616	60 %	20 %	20 %	0 %	379793825

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.