MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132 plasmid pST75

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016942	CTAG	2	8	196	203	25 %	25 %	25 %	25 %	379793807
2	NC_016942	ATAA	2	8	599	606	75 %	25 %	0 %	0 %	379793807
3	NC_016942	GCTT	2	8	661	668	0 %	50 %	25 %	25 %	379793807
4	NC_016942	CCGA	2	8	1014	1021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016942	GTTG	2	8	1162	1169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016942	TGTA	2	8	1881	1888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016942	TTTG	2	8	2175	2182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016942	TTTA	2	8	2372	2379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016942	GCTA	2	8	2785	2792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016942	AGTA	2	8	3539	3546	50 %	25 %	25 %	0 %	379793809
11	NC_016942	TTCA	2	8	3662	3669	25 %	50 %	0 %	25 %	379793809
12	NC_016942	ACTA	2	8	3806	3813	50 %	25 %	0 %	25 %	379793809
13	NC_016942	CATA	2	8	3965	3972	50 %	25 %	0 %	25 %	379793809
14	NC_016942	AAAT	2	8	4343	4350	75 %	25 %	0 %	0 %	379793810
15	NC_016942	CAAA	2	8	4365	4372	75 %	0 %	0 %	25 %	379793810
16	NC_016942	TTAG	2	8	5321	5328	25 %	50 %	25 %	0 %	379793811
17	NC_016942	TCAT	2	8	5432	5439	25 %	50 %	0 %	25 %	379793811
18	NC_016942	CTTC	2	8	5577	5584	0 %	50 %	0 %	50 %	379793811
19	NC_016942	TTTA	2	8	5677	5684	25 %	75 %	0 %	0 %	379793811
20	NC_016942	TTAG	2	8	5888	5895	25 %	50 %	25 %	0 %	379793811
21	NC_016942	TCTT	2	8	5944	5951	0 %	75 %	0 %	25 %	379793811
22	NC_016942	TTTA	2	8	6040	6047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016942	ATTT	2	8	6055	6062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016942	TAAA	2	8	6215	6222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016942	GATG	2	8	6312	6319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016942	ACAA	2	8	6610	6617	75 %	0 %	0 %	25 %	379793812
27	NC_016942	GTTT	2	8	7141	7148	0 %	75 %	25 %	0 %	379793812
28	NC_016942	GTTT	2	8	7415	7422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016942	TAAT	2	8	7910	7917	50 %	50 %	0 %	0 %	379793814
30	NC_016942	TATT	2	8	8563	8570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016942	ATTA	2	8	8606	8613	50 %	50 %	0 %	0 %	379793815
32	NC_016942	TATG	2	8	8740	8747	25 %	50 %	25 %	0 %	379793815
33	NC_016942	TCTA	2	8	8995	9002	25 %	50 %	0 %	25 %	379793815
34	NC_016942	CATT	2	8	9074	9081	25 %	50 %	0 %	25 %	379793815
35	NC_016942	ATTC	2	8	9197	9204	25 %	50 %	0 %	25 %	379793815
36	NC_016942	ATCA	2	8	9321	9328	50 %	25 %	0 %	25 %	379793815
37	NC_016942	ATTT	2	8	9735	9742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016942	TCAG	2	8	9807	9814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016942	TTGT	2	8	9948	9955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016942	TTTA	2	8	11403	11410	25 %	75 %	0 %	0 %	379793817
41	NC_016942	CAGT	2	8	11421	11428	25 %	25 %	25 %	25 %	379793817
42	NC_016942	ATGA	2	8	11548	11555	50 %	25 %	25 %	0 %	379793817
43	NC_016942	AAAC	2	8	12377	12384	75 %	0 %	0 %	25 %	379793817
44	NC_016942	TGTC	2	8	12539	12546	0 %	50 %	25 %	25 %	379793817
45	NC_016942	CATA	2	8	13103	13110	50 %	25 %	0 %	25 %	379793818
46	NC_016942	ATTA	2	8	13794	13801	50 %	50 %	0 %	0 %	379793818
47	NC_016942	CTTT	2	8	13909	13916	0 %	75 %	0 %	25 %	379793818
48	NC_016942	TAAT	2	8	14216	14223	50 %	50 %	0 %	0 %	379793818
49	NC_016942	AAAC	2	8	14247	14254	75 %	0 %	0 %	25 %	379793818
50	NC_016942	AATA	2	8	15102	15109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016942	CGTT	2	8	15124	15131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016942	CTGT	2	8	15317	15324	0 %	50 %	25 %	25 %	379793820
53	NC_016942	TTTC	2	8	15467	15474	0 %	75 %	0 %	25 %	379793820
54	NC_016942	TTCA	2	8	15597	15604	25 %	50 %	0 %	25 %	379793820
55	NC_016942	TCAT	2	8	15887	15894	25 %	50 %	0 %	25 %	379793820
56	NC_016942	TTTA	2	8	16020	16027	25 %	75 %	0 %	0 %	379793821
57	NC_016942	TTTA	2	8	16159	16166	25 %	75 %	0 %	0 %	379793821
58	NC_016942	TCTA	2	8	16405	16412	25 %	50 %	0 %	25 %	379793821
59	NC_016942	ATAC	2	8	16704	16711	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016942	AAAT	2	8	17041	17048	75 %	25 %	0 %	0 %	379793822
61	NC_016942	TCCA	2	8	17561	17568	25 %	25 %	0 %	50 %	379793823
62	NC_016942	TAAA	2	8	17806	17813	75 %	25 %	0 %	0 %	379793823
63	NC_016942	CTTT	2	8	17849	17856	0 %	75 %	0 %	25 %	379793823
64	NC_016942	TCTT	2	8	17879	17886	0 %	75 %	0 %	25 %	379793823
65	NC_016942	AATT	2	8	18061	18068	50 %	50 %	0 %	0 %	379793823
66	NC_016942	ATTA	2	8	18100	18107	50 %	50 %	0 %	0 %	379793823
67	NC_016942	AATG	2	8	18140	18147	50 %	25 %	25 %	0 %	379793823
68	NC_016942	ACTT	2	8	18771	18778	25 %	50 %	0 %	25 %	379793823
69	NC_016942	AGCA	2	8	18856	18863	50 %	0 %	25 %	25 %	379793823
70	NC_016942	TAAA	2	8	19341	19348	75 %	25 %	0 %	0 %	379793824
71	NC_016942	TAAA	2	8	19638	19645	75 %	25 %	0 %	0 %	379793824
72	NC_016942	TTAA	2	8	19727	19734	50 %	50 %	0 %	0 %	379793824
73	NC_016942	ATTT	2	8	20048	20055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016942	ATAA	2	8	20103	20110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016942	ACAA	2	8	20229	20236	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016942	TAAT	2	8	20289	20296	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
77	NC_016942	TAAA	2	8	20501	20508	75 %	25 %	0 %	0 %	379793825
78	NC_016942	CTTA	2	8	20989	20996	25 %	50 %	0 %	25 %	379793825
79	NC_016942	TTTA	2	8	21004	21011	25 %	75 %	0 %	0 %	379793825
80	NC_016942	TCTT	2	8	21079	21086	0 %	75 %	0 %	25 %	379793825
81	NC_016942	CATA	2	8	21256	21263	50 %	25 %	0 %	25 %	379793825
82	NC_016942	TAAT	2	8	21462	21469	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
83	NC_016942	CTTT	4	16	21492	21507	0 %	75 %	0 %	25 %	379793825
84	NC_016942	TAAT	2	8	22001	22008	50 %	50 %	0 %	0 %	379793825
85	NC_016942	TAAA	2	8	22023	22030	75 %	25 %	0 %	0 %	379793825
86	NC_016942	ATTA	2	8	22209	22216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016942	TCTT	2	8	22906	22913	0 %	75 %	0 %	25 %	379793826
88	NC_016942	ATTT	2	8	23708	23715	25 %	75 %	0 %	0 %	379793827
89	NC_016942	TTTA	2	8	23900	23907	25 %	75 %	0 %	0 %	379793827
90	NC_016942	TACA	2	8	24165	24172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016942	ACCT	2	8	24491	24498	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016942	TACT	2	8	24575	24582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016942	AAAT	2	8	24782	24789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016942	AAAT	2	8	24797	24804	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.