MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132 plasmid pST75

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016942	ATG	2	6	205	210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
2	NC_016942	GAT	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
3	NC_016942	ATT	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793807
4	NC_016942	TAA	2	6	503	508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
5	NC_016942	TAA	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
6	NC_016942	TAA	2	6	655	660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
7	NC_016942	TTC	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793807
8	NC_016942	TTG	2	6	728	733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793807
9	NC_016942	ATG	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
10	NC_016942	TAG	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793807
11	NC_016942	AAT	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793807
12	NC_016942	TAA	2	6	3034	3039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
13	NC_016942	AAT	2	6	3040	3045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
14	NC_016942	ATG	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793808
15	NC_016942	TCT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793808
16	NC_016942	ATA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793808
17	NC_016942	TCT	2	6	3202	3207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793808
18	NC_016942	ATC	2	6	3251	3256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793808
19	NC_016942	AAT	3	9	3392	3400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
20	NC_016942	AAT	2	6	3422	3427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
21	NC_016942	CAA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793809
22	NC_016942	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793809
23	NC_016942	ATC	2	6	3701	3706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793809
24	NC_016942	ATA	2	6	3822	3827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
25	NC_016942	TAA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
26	NC_016942	TAA	2	6	3908	3913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793809
27	NC_016942	CTG	2	6	3919	3924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793809
28	NC_016942	CAG	3	9	3940	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793809
29	NC_016942	CAA	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793809
30	NC_016942	ATT	2	6	5013	5018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793811
31	NC_016942	TTC	2	6	5074	5079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793811
32	NC_016942	AAG	2	6	5184	5189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793811
33	NC_016942	TAA	2	6	5311	5316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793811
34	NC_016942	ATC	2	6	5362	5367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793811
35	NC_016942	ATT	2	6	5443	5448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793811
36	NC_016942	TCT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793811
37	NC_016942	CGT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793811
38	NC_016942	TCA	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793811
39	NC_016942	GAA	2	6	6438	6443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
40	NC_016942	TAA	2	6	6470	6475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
41	NC_016942	AGA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
42	NC_016942	TAC	2	6	6599	6604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
43	NC_016942	ATA	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
44	NC_016942	TAG	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793812
45	NC_016942	AAT	2	6	6702	6707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
46	NC_016942	GTC	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793812
47	NC_016942	ACA	2	6	6738	6743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793812
48	NC_016942	TAA	2	6	6818	6823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793812
49	NC_016942	CTA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
50	NC_016942	TAC	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793812
51	NC_016942	GAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
52	NC_016942	CGA	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793812
53	NC_016942	GAA	2	6	7038	7043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
54	NC_016942	AGA	2	6	7052	7057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
55	NC_016942	AGA	2	6	7094	7099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
56	NC_016942	GAA	2	6	7107	7112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793812
57	NC_016942	CAT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793813
58	NC_016942	AAT	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
59	NC_016942	TCA	2	6	7483	7488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
60	NC_016942	AGT	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793814
61	NC_016942	AAT	3	9	7677	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
62	NC_016942	TAA	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
63	NC_016942	TAA	2	6	7872	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793814
64	NC_016942	CTA	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
65	NC_016942	TCA	2	6	8030	8035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793814
66	NC_016942	TCT	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793815
67	NC_016942	TTG	2	6	8829	8834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793815
68	NC_016942	TCA	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793815
69	NC_016942	ATT	2	6	8869	8874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
70	NC_016942	TAG	2	6	8875	8880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793815
71	NC_016942	GTT	2	6	9100	9105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793815
72	NC_016942	ACA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793815
73	NC_016942	CAA	2	6	9173	9178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793815
74	NC_016942	ATT	2	6	9239	9244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
75	NC_016942	TAA	2	6	9277	9282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793815
76	NC_016942	GTA	2	6	9330	9335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793815
77	NC_016942	TAA	2	6	9355	9360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793815
78	NC_016942	AAG	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793815
79	NC_016942	GGT	2	6	9397	9402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379793815
80	NC_016942	ATA	2	6	9410	9415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793815
81	NC_016942	GCA	2	6	9421	9426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793815
82	NC_016942	ATT	2	6	9450	9455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
83	NC_016942	ATT	2	6	9540	9545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793815
84	NC_016942	TAA	2	6	10047	10052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793816
85	NC_016942	GTA	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793816
86	NC_016942	ATT	2	6	10152	10157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793816
87	NC_016942	AAG	2	6	10172	10177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793816
88	NC_016942	GTA	2	6	10219	10224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793816
89	NC_016942	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793816
90	NC_016942	TTG	2	6	10382	10387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793816
91	NC_016942	AAT	2	6	10404	10409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793816
92	NC_016942	GGT	2	6	10417	10422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379793816
93	NC_016942	TTG	2	6	10427	10432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793816
94	NC_016942	CAA	2	6	10433	10438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793816
95	NC_016942	TGG	2	6	10446	10451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379793816
96	NC_016942	ACA	2	6	10544	10549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793816
97	NC_016942	CTG	2	6	10568	10573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793816
98	NC_016942	TGG	2	6	10605	10610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379793816
99	NC_016942	GAA	2	6	10636	10641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793816
100	NC_016942	AAG	3	9	10670	10678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793816
101	NC_016942	GCT	2	6	10690	10695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379793816
102	NC_016942	TTG	2	6	11153	11158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379793817
103	NC_016942	CGA	2	6	11181	11186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793817
104	NC_016942	GTG	2	6	11201	11206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379793817
105	NC_016942	ATG	2	6	11227	11232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793817
106	NC_016942	ATG	2	6	11314	11319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793817
107	NC_016942	CTT	2	6	11342	11347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793817
108	NC_016942	TTA	2	6	11392	11397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793817
109	NC_016942	GAT	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793817
110	NC_016942	AGA	2	6	11640	11645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793817
111	NC_016942	CAA	2	6	11703	11708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793817
112	NC_016942	ATT	2	6	11786	11791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793817
113	NC_016942	ATG	2	6	11864	11869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793817
114	NC_016942	AGA	2	6	11889	11894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793817
115	NC_016942	GAT	2	6	12003	12008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793817
116	NC_016942	AAT	2	6	12241	12246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793817
117	NC_016942	TGA	2	6	12324	12329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793817
118	NC_016942	GAA	2	6	12396	12401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793817
119	NC_016942	AGT	2	6	12609	12614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793817
120	NC_016942	TAT	2	6	12666	12671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793817
121	NC_016942	CTA	2	6	12869	12874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793818
122	NC_016942	CAT	2	6	12893	12898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379793818
123	NC_016942	ATG	2	6	12902	12907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793818
124	NC_016942	TTC	2	6	12975	12980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379793818
125	NC_016942	TGA	2	6	13014	13019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379793818
126	NC_016942	AGA	2	6	13056	13061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793818
127	NC_016942	CAG	2	6	13121	13126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379793818
128	NC_016942	ATT	2	6	13162	13167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793818
129	NC_016942	ATA	2	6	13264	13269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793818
130	NC_016942	CGC	2	6	13329	13334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379793818
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255	NC_016942	TAT	2	6	23771	23776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379793827
256	NC_016942	TAA	2	6	23821	23826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379793827
257	NC_016942	ACA	2	6	23842	23847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379793827
258	NC_016942	GAA	2	6	23934	23939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379793827

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.