MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016941	AAATTA	2	12	3547	3558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016941	AAAAAT	2	12	38305	38316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016941	AATTAA	2	12	52937	52948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016941	GTATTA	2	12	71847	71858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016941	TTAAAT	2	12	102765	102776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016941	TTTATA	2	12	187735	187746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016941	ATTAAT	2	12	187758	187769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016941	AATATA	2	12	201085	201096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016941	ATATAG	2	12	272718	272729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016941	ATACGT	2	12	290708	290719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016941	TTTTAC	2	12	354768	354779	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016941	CAATAT	2	12	368309	368320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016941	ATAAAA	2	12	368984	368995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016941	TCTTTA	2	12	395068	395079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016941	CTATAA	2	12	396540	396551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016941	GATTTT	2	12	418112	418123	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016941	TCTTAT	2	12	418141	418152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016941	TTGAAA	2	12	425549	425560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016941	TGTATA	2	12	436198	436209	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016941	TGTTTT	2	12	447968	447979	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016941	ACATAT	2	12	449017	449028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016941	TTTTTA	2	12	449159	449170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016941	TTTTAT	2	12	460827	460838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016941	AATATT	2	12	476009	476020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016941	TGATTG	2	12	484570	484581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016941	AAATTA	2	12	544287	544298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016941	GTTATA	2	12	558288	558299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016941	TGGAAT	2	12	604790	604801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016941	CTATAA	2	12	613726	613737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016941	TTGATT	2	12	618409	618420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016941	TAAAAT	2	12	627878	627889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016941	ATTTTA	2	12	633107	633118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016941	CATCAA	2	12	663009	663020	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016941	TAATTT	2	12	667244	667255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016941	TTAATT	2	12	667326	667337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016941	TAAAAA	2	12	686164	686175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016941	TTTTTA	2	12	687414	687425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016941	TTGAAA	2	12	695654	695665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016941	TTATTT	2	12	705450	705461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016941	ATAATG	2	12	710069	710080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016941	TAACTA	2	12	712153	712164	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016941	ATTTAC	2	12	726215	726226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016941	ATTATA	2	12	726797	726808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016941	TGAAAA	2	12	759661	759672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016941	AATGAT	2	12	770225	770236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016941	TAAAAT	2	12	782005	782016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016941	CAATTG	2	12	784607	784618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016941	AATTAA	2	12	806203	806214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016941	CAAAAT	2	12	809431	809442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016941	GAGAAA	2	12	814729	814740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016941	TTTTAA	2	12	832074	832085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016941	TATAAA	2	12	852992	853003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016941	TAAATT	2	12	857831	857842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016941	AAATTA	2	12	859428	859439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016941	GTATTT	2	12	897709	897720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016941	TTTAAT	2	12	946388	946399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016941	GGAATT	2	12	963826	963837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016941	TTAAAT	2	12	964748	964759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016941	AACGGA	2	12	978447	978458	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016941	GTTGGG	2	12	997932	997943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016941	GTTGGG	3	18	997990	998007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016941	CAAAAT	2	12	1013453	1013464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016941	TAAAAA	2	12	1018420	1018431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016941	TAAAAA	2	12	1034944	1034955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016941	TATAAA	2	12	1037029	1037040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016941	GTTGAT	2	12	1041094	1041105	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016941	AATTTT	2	12	1044092	1044103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016941	AATTTA	2	12	1048089	1048100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016941	AAATTC	2	12	1074569	1074580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016941	TAAAAT	2	12	1085524	1085535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016941	TTTTAA	2	12	1103909	1103920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016941	AATTAA	2	12	1111514	1111525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016941	GTTGGG	2	12	1116369	1116380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016941	AGTTGG	2	12	1116426	1116437	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016941	TTTAAT	2	12	1122340	1122351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016941	ACGAAG	2	12	1126723	1126734	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016941	ATTTTA	2	12	1143690	1143701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016941	CAATCT	2	12	1162428	1162439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016941	AATTTT	2	12	1164884	1164895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016941	GAAATT	2	12	1213764	1213775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016941	AATGAT	2	12	1226460	1226471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016941	TAAAGA	2	12	1240884	1240895	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016941	TATATT	2	12	1261585	1261596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016941	GATAGT	2	12	1274118	1274129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016941	ATGTAT	2	12	1287305	1287316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016941	AAAGAA	2	12	1287539	1287550	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016941	TATTTA	2	12	1288804	1288815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016941	TTAAAA	2	12	1295786	1295797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016941	TATATT	2	12	1310726	1310737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016941	AATTTT	2	12	1328874	1328885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016941	ATATAA	2	12	1329168	1329179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016941	AATATT	2	12	1340599	1340610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016941	GTTTTA	2	12	1359207	1359218	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016941	TAAAAT	2	12	1374734	1374745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016941	TATCTT	2	12	1396025	1396036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016941	TTGATT	2	12	1396088	1396099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016941	TAAAAT	2	12	1405580	1405591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016941	TAAAAA	2	12	1432430	1432441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016941	ATATAC	2	12	1434205	1434216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016941	ATTTTC	2	12	1442854	1442865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016941	TTTCTA	2	12	1461176	1461187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016941	CCAATT	2	12	1462256	1462267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016941	TTTTAA	2	12	1477880	1477891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016941	AATTAA	2	12	1500108	1500119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016941	TAAATA	2	12	1506682	1506693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016941	AATAAA	2	12	1506852	1506863	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016941	ATAAAA	2	12	1510632	1510643	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016941	TTAAAA	2	12	1539490	1539501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016941	ATTTAA	2	12	1548232	1548243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016941	AATAAA	2	12	1551526	1551537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016941	AGCCAA	2	12	1576150	1576161	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016941	TTGACT	2	12	1576169	1576180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016941	TTATAA	2	12	1583182	1583193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016941	ACCTTT	2	12	1593174	1593185	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016941	TTCTTT	2	12	1613933	1613944	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016941	ATATTC	2	12	1618900	1618911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016941	ATTTTC	2	12	1640543	1640554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016941	TTGTTT	2	12	1643760	1643771	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016941	GTAATA	2	12	1646654	1646665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016941	ATTTTA	2	12	1646789	1646800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016941	TGTTCA	2	12	1680934	1680945	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016941	ATTTAT	2	12	1688060	1688071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016941	TTTTTA	2	12	1689175	1689186	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016941	AATTAA	2	12	1697106	1697117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016941	TTGATT	2	12	1704032	1704043	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016941	TTTCAT	2	12	1709422	1709433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016941	CAGAAG	2	12	1733158	1733169	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016941	CTTTTT	2	12	1734254	1734265	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016941	TAAAAT	2	12	1742218	1742229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016941	TAATTA	2	12	1743932	1743943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016941	TATCAA	2	12	1747839	1747850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.