MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132

Total Repeats: 1404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016941	GTTATC	2	12	7304	7315	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794533
2	NC_016941	CAGATA	2	12	8213	8224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794533
3	NC_016941	ACAAGC	2	12	8271	8282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379794533
4	NC_016941	ACAATT	2	12	11266	11277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379794535
5	NC_016941	TAGCAT	2	12	11361	11372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794535
6	NC_016941	AATGTT	2	12	12790	12801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794536
7	NC_016941	TTTACG	2	12	16116	16127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794539
8	NC_016941	GCTTTA	2	12	17384	17395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794540
9	NC_016941	TTTGAA	2	12	18205	18216	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794540
10	NC_016941	TAAAGG	2	12	20252	20263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379794542
11	NC_016941	TGATTG	2	12	21653	21664	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379794543
12	NC_016941	TGAAAT	2	12	21984	21995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379794543
13	NC_016941	AAGGAA	2	12	22422	22433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379794544
14	NC_016941	TGAATT	2	12	25339	25350	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794545
15	NC_016941	CGTATT	2	12	26420	26431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794546
16	NC_016941	TGAACG	2	12	26686	26697	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379794546
17	NC_016941	GGTATC	2	12	27167	27178	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379794546
18	NC_016941	GGATTA	2	12	27257	27268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794546
19	NC_016941	CTAAAG	2	12	28957	28968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794548
20	NC_016941	AAAAGA	2	12	33777	33788	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379794551
21	NC_016941	ACATCT	2	12	35431	35442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794552
22	NC_016941	GTTTAA	2	12	36574	36585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794554
23	NC_016941	AATGAA	2	12	39541	39552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379794557
24	NC_016941	ACAACT	2	12	41606	41617	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379794558
25	NC_016941	GCTAAA	2	12	42845	42856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794560
26	NC_016941	GTATGA	2	12	50131	50142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794567
27	NC_016941	GAAGGT	2	12	54852	54863	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379794570
28	NC_016941	TATTAA	2	12	57915	57926	50 %	50 %	0 %	0 %	379794573
29	NC_016941	GTCTAA	2	12	59704	59715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794574
30	NC_016941	CTTCAA	2	12	60917	60928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794574
31	NC_016941	ATTTTG	2	12	61313	61324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379794575
32	NC_016941	TACGCC	2	12	63275	63286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379794576
33	NC_016941	ATTAAA	2	12	64820	64831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379794578
34	NC_016941	AAAGAT	2	12	65850	65861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379794578
35	NC_016941	AAAATT	2	12	66354	66365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379794580
36	NC_016941	TAATGA	2	12	69421	69432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379794583
37	NC_016941	ATTATG	2	12	69522	69533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794583
38	NC_016941	AAATTA	2	12	72131	72142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379794585
39	NC_016941	ACCTTT	2	12	75502	75513	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379794590
40	NC_016941	TTTAGC	2	12	80244	80255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794594
41	NC_016941	AAATAA	2	12	80295	80306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379794594
42	NC_016941	TACAAG	2	12	82022	82033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794596
43	NC_016941	GCTAAA	2	12	82087	82098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794596
44	NC_016941	TAAAGA	2	12	86215	86226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379794601
45	NC_016941	AACCAC	2	12	90097	90108	50 %	0 %	0 %	50 %	379794603
46	NC_016941	AACCGA	2	12	93403	93414	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379794605
47	NC_016941	CATTAC	2	12	95103	95114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794606
48	NC_016941	AGCAAA	2	12	97862	97873	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379794608
49	NC_016941	ATAGAT	2	12	98302	98313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379794608
50	NC_016941	TATCAT	2	12	99070	99081	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379794609
51	NC_016941	CTAATG	2	12	101345	101356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794611
52	NC_016941	TTTTTC	2	12	102670	102681	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379794611
53	NC_016941	ATTTAG	2	12	108363	108374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794616
54	NC_016941	TGCGCA	2	12	108528	108539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379794617
55	NC_016941	ATTGCT	2	12	111364	111375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794619
56	NC_016941	GATAAA	2	12	114717	114728	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379794621
57	NC_016941	GCAATG	2	12	115745	115756	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379794621
58	NC_016941	TGAAGA	2	12	116580	116591	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379794622
59	NC_016941	TTTCAT	2	12	117261	117272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379794623
60	NC_016941	ATCCAT	2	12	117679	117690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379794623
61	NC_016941	AGACGA	2	12	119219	119230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379794625
62	NC_016941	AGTGAT	2	12	120082	120093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794626
63	NC_016941	GCTATT	2	12	120523	120534	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794627
64	NC_016941	TGTATA	2	12	122116	122127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794628
65	NC_016941	TACATT	2	12	123570	123581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379794630
66	NC_016941	CATATG	2	12	127424	127435	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794633
67	NC_016941	GGAATG	2	12	130293	130304	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379794636
68	NC_016941	TATTGG	2	12	130985	130996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379794637
69	NC_016941	ATTGCA	2	12	132003	132014	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794637
70	NC_016941	CAGATT	2	12	132894	132905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794638
71	NC_016941	AGGTAA	2	12	138841	138852	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379794644
72	NC_016941	ACTAAG	2	12	139049	139060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794644
73	NC_016941	AAATGG	2	12	139393	139404	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379794644
74	NC_016941	ACGACA	2	12	145464	145475	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379794648
75	NC_016941	TTAATT	2	12	147147	147158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794650
76	NC_016941	GATATG	2	12	147729	147740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379794650
77	NC_016941	CAGGTG	2	12	147778	147789	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379794650
78	NC_016941	AGTTAA	2	12	150893	150904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379794653
79	NC_016941	AATTTG	2	12	151634	151645	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794653
80	NC_016941	AATATT	2	12	165245	165256	50 %	50 %	0 %	0 %	379794666
81	NC_016941	GAATAT	2	12	165859	165870	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379794667
82	NC_016941	CGTAAT	2	12	167641	167652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794669
83	NC_016941	ATTTAA	2	12	169193	169204	50 %	50 %	0 %	0 %	379794671
84	NC_016941	TTTGGA	2	12	171759	171770	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379794674
85	NC_016941	ACCTGC	2	12	172094	172105	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379794674
86	NC_016941	AAGATA	2	12	172240	172251	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379794674
87	NC_016941	ATTTAA	2	12	174720	174731	50 %	50 %	0 %	0 %	379794676
88	NC_016941	AAGTGA	2	12	180065	180076	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379794676
89	NC_016941	ATCGTT	2	12	184907	184918	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794680
90	NC_016941	AGCAAC	2	12	185083	185094	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379794680
91	NC_016941	AAATGC	2	12	193374	193385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794687
92	NC_016941	GCAATA	2	12	193401	193412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794687
93	NC_016941	CACCAA	2	12	193639	193650	50 %	0 %	0 %	50 %	379794687
94	NC_016941	ATTTTA	2	12	194974	194985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794688
95	NC_016941	TATCTT	2	12	199568	199579	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379794691
96	NC_016941	GCTGGA	2	12	199785	199796	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379794691
97	NC_016941	AAATAT	2	12	206766	206777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379794696
98	NC_016941	AATATG	2	12	209799	209810	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379794698
99	NC_016941	CTGCAC	2	12	211168	211179	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379794699
100	NC_016941	AAAAAT	2	12	213310	213321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379794700
101	NC_016941	CTATAG	2	12	220405	220416	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794706
102	NC_016941	TTGGTG	2	12	221678	221689	0 %	50 %	50 %	0 %	379794708
103	NC_016941	GGACGT	2	12	230782	230793	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379794715
104	NC_016941	TTTAAT	2	12	234002	234013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379794717
105	NC_016941	ATAATC	2	12	240017	240028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379794721
106	NC_016941	TGTATC	2	12	240200	240211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379794721
107	NC_016941	TATCTT	2	12	241228	241239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379794721
108	NC_016941	CTTTTT	2	12	243476	243487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379794722
109	NC_016941	ACATTG	2	12	245561	245572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379794724
110	NC_016941	AATATC	2	12	252279	252290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379794730
111	NC_016941	TAAAGA	2	12	267867	267878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379794743
112	NC_016941	AATGAC	2	12	269173	269184	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794745
113	NC_016941	TATGAT	2	12	269906	269917	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794745
114	NC_016941	TTTAGA	2	12	272821	272832	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379794747
115	NC_016941	AACAGA	2	12	273731	273742	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379794748
116	NC_016941	AGAATC	2	12	279897	279908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794751
117	NC_016941	AAACTT	2	12	279930	279941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379794751
118	NC_016941	CTAAAG	2	12	280405	280416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379794752
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342	NC_016941	GACTCA	2	12	595544	595555	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379795035
343	NC_016941	GATTCA	2	12	595562	595573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379795035
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345	NC_016941	GACTCA	2	12	595616	595627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379795035
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