MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSHR1132

Total Repeats: 2451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016941	CAAAT	2	10	1447	1456	60 %	20 %	0 %	20 %	379794528
2	NC_016941	AATTT	2	10	2496	2505	40 %	60 %	0 %	0 %	379794529
3	NC_016941	CAATT	2	10	2562	2571	40 %	40 %	0 %	20 %	379794529
4	NC_016941	AAATT	2	10	2940	2949	60 %	40 %	0 %	0 %	379794529
5	NC_016941	TAAAA	2	10	3376	3385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016941	TGAAC	2	10	6982	6991	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016941	TTCAA	2	10	7728	7737	40 %	40 %	0 %	20 %	379794533
8	NC_016941	CTATA	2	10	9742	9751	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016941	ACAAT	2	10	11116	11125	60 %	20 %	0 %	20 %	379794535
10	NC_016941	CTTTG	2	10	11911	11920	0 %	60 %	20 %	20 %	379794535
11	NC_016941	AAAAT	2	10	12737	12746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016941	AAATA	2	10	14498	14507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016941	TTATT	2	10	15378	15387	20 %	80 %	0 %	0 %	379794538
14	NC_016941	AAAAG	2	10	17593	17602	80 %	0 %	20 %	0 %	379794540
15	NC_016941	AGTTA	2	10	22032	22041	40 %	40 %	20 %	0 %	379794543
16	NC_016941	ACAAT	2	10	22053	22062	60 %	20 %	0 %	20 %	379794543
17	NC_016941	CAATT	2	10	22506	22515	40 %	40 %	0 %	20 %	379794544
18	NC_016941	ATGTA	2	10	23590	23599	40 %	40 %	20 %	0 %	379794544
19	NC_016941	AATTT	2	10	24912	24921	40 %	60 %	0 %	0 %	379794545
20	NC_016941	ATCAA	2	10	26901	26910	60 %	20 %	0 %	20 %	379794546
21	NC_016941	AGATA	2	10	27193	27202	60 %	20 %	20 %	0 %	379794546
22	NC_016941	ATTAT	2	10	29315	29324	40 %	60 %	0 %	0 %	379794548
23	NC_016941	TAAAG	2	10	29429	29438	60 %	20 %	20 %	0 %	379794548
24	NC_016941	GAAAC	2	10	31230	31239	60 %	0 %	20 %	20 %	379794550
25	NC_016941	TGGCG	2	10	31916	31925	0 %	20 %	60 %	20 %	379794550
26	NC_016941	AAGGT	2	10	32403	32412	40 %	20 %	40 %	0 %	379794550
27	NC_016941	TATGA	2	10	32600	32609	40 %	40 %	20 %	0 %	379794550
28	NC_016941	CATTA	2	10	33831	33840	40 %	40 %	0 %	20 %	379794551
29	NC_016941	TTTCA	2	10	34234	34243	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016941	AAATG	2	10	35475	35484	60 %	20 %	20 %	0 %	379794552
31	NC_016941	ATTTT	2	10	35556	35565	20 %	80 %	0 %	0 %	379794552
32	NC_016941	TAAAA	2	10	35687	35696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016941	AGATA	2	10	35845	35854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016941	ATGAG	2	10	38179	38188	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016941	TGAAT	2	10	38526	38535	40 %	40 %	20 %	0 %	379794556
36	NC_016941	TTGGT	2	10	38568	38577	0 %	60 %	40 %	0 %	379794556
37	NC_016941	AATAT	2	10	38636	38645	60 %	40 %	0 %	0 %	379794556
38	NC_016941	TTCGT	2	10	38847	38856	0 %	60 %	20 %	20 %	379794556
39	NC_016941	CAAAA	2	10	39207	39216	80 %	0 %	0 %	20 %	379794557
40	NC_016941	AAATT	2	10	41306	41315	60 %	40 %	0 %	0 %	379794558
41	NC_016941	TTGAA	2	10	43335	43344	40 %	40 %	20 %	0 %	379794561
42	NC_016941	TTGAA	2	10	43681	43690	40 %	40 %	20 %	0 %	379794561
43	NC_016941	TTTGT	2	10	44585	44594	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016941	TTTGA	2	10	47935	47944	20 %	60 %	20 %	0 %	379794565
45	NC_016941	GTTTT	2	10	48018	48027	0 %	80 %	20 %	0 %	379794565
46	NC_016941	GTTTG	2	10	48648	48657	0 %	60 %	40 %	0 %	379794566
47	NC_016941	TTGCT	2	10	48976	48985	0 %	60 %	20 %	20 %	379794566
48	NC_016941	TATTT	2	10	52470	52479	20 %	80 %	0 %	0 %	379794569
49	NC_016941	TATGT	2	10	55676	55685	20 %	60 %	20 %	0 %	379794571
50	NC_016941	GATTT	2	10	56997	57006	20 %	60 %	20 %	0 %	379794572
51	NC_016941	AAAGA	2	10	57638	57647	80 %	0 %	20 %	0 %	379794573
52	NC_016941	TCATA	2	10	59793	59802	40 %	40 %	0 %	20 %	379794574
53	NC_016941	AATAC	2	10	60076	60085	60 %	20 %	0 %	20 %	379794574
54	NC_016941	AAGGT	2	10	60952	60961	40 %	20 %	40 %	0 %	379794574
55	NC_016941	CTTTT	2	10	62151	62160	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016941	AGTTT	2	10	63429	63438	20 %	60 %	20 %	0 %	379794577
57	NC_016941	AAATT	2	10	66162	66171	60 %	40 %	0 %	0 %	379794579
58	NC_016941	ATTCT	2	10	67646	67655	20 %	60 %	0 %	20 %	379794581
59	NC_016941	CAAAT	2	10	69612	69621	60 %	20 %	0 %	20 %	379794583
60	NC_016941	ATTTC	2	10	70124	70133	20 %	60 %	0 %	20 %	379794583
61	NC_016941	TATAA	2	10	70923	70932	60 %	40 %	0 %	0 %	379794584
62	NC_016941	GAATG	2	10	71647	71656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016941	ATTAA	2	10	73232	73241	60 %	40 %	0 %	0 %	379794585
64	NC_016941	TGTAT	2	10	76859	76868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016941	TTTTA	2	10	78598	78607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016941	ATTCA	2	10	79697	79706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016941	TATAT	2	10	79958	79967	40 %	60 %	0 %	0 %	379794594
68	NC_016941	ACAAT	2	10	80324	80333	60 %	20 %	0 %	20 %	379794594
69	NC_016941	TTTTA	2	10	81284	81293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016941	TTTTA	2	10	82392	82401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016941	GATAT	2	10	83981	83990	40 %	40 %	20 %	0 %	379794598
72	NC_016941	GATAT	2	10	84800	84809	40 %	40 %	20 %	0 %	379794599
73	NC_016941	AATAA	2	10	85427	85436	80 %	20 %	0 %	0 %	379794600
74	NC_016941	GATAT	2	10	86454	86463	40 %	40 %	20 %	0 %	379794601
75	NC_016941	ATTGC	2	10	87396	87405	20 %	40 %	20 %	20 %	379794602
76	NC_016941	CAACA	2	10	87517	87526	60 %	0 %	0 %	40 %	379794602
77	NC_016941	ATCAT	2	10	87664	87673	40 %	40 %	0 %	20 %	379794602
78	NC_016941	CATGG	2	10	88800	88809	20 %	20 %	40 %	20 %	379794602
79	NC_016941	TGAAA	2	10	89477	89486	60 %	20 %	20 %	0 %	379794603
80	NC_016941	TCAAT	2	10	89849	89858	40 %	40 %	0 %	20 %	379794603
81	NC_016941	GTATT	2	10	90338	90347	20 %	60 %	20 %	0 %	379794604
82	NC_016941	GTTGT	2	10	91370	91379	0 %	60 %	40 %	0 %	379794604
83	NC_016941	ATTGG	2	10	92093	92102	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016941	AGATA	2	10	96193	96202	60 %	20 %	20 %	0 %	379794607
85	NC_016941	TAAAA	2	10	96753	96762	80 %	20 %	0 %	0 %	379794607
86	NC_016941	GTAAT	2	10	98606	98615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016941	AGTAT	2	10	100386	100395	40 %	40 %	20 %	0 %	379794610
88	NC_016941	TTGCG	2	10	100444	100453	0 %	40 %	40 %	20 %	379794610
89	NC_016941	AGTTA	2	10	101982	101991	40 %	40 %	20 %	0 %	379794611
90	NC_016941	TTGTT	2	10	102388	102397	0 %	80 %	20 %	0 %	379794611
91	NC_016941	AAGTA	2	10	102609	102618	60 %	20 %	20 %	0 %	379794611
92	NC_016941	GTAAA	2	10	103042	103051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016941	TTTTG	2	10	104204	104213	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016941	TTAAT	2	10	105515	105524	40 %	60 %	0 %	0 %	379794614
95	NC_016941	AATTA	2	10	107283	107292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016941	GAAAA	2	10	109213	109222	80 %	0 %	20 %	0 %	379794617
97	NC_016941	TTATT	2	10	109380	109389	20 %	80 %	0 %	0 %	379794617
98	NC_016941	AATCA	2	10	112402	112411	60 %	20 %	0 %	20 %	379794619
99	NC_016941	AAATT	2	10	114691	114700	60 %	40 %	0 %	0 %	379794621
100	NC_016941	AACGG	2	10	114921	114930	40 %	0 %	40 %	20 %	379794621
101	NC_016941	GACAA	2	10	118256	118265	60 %	0 %	20 %	20 %	379794624
102	NC_016941	ATAAC	2	10	119281	119290	60 %	20 %	0 %	20 %	379794625
103	NC_016941	AACAA	2	10	119878	119887	80 %	0 %	0 %	20 %	379794626
104	NC_016941	TAAAA	2	10	120200	120209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016941	ATCTA	2	10	121341	121350	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016941	AAACT	2	10	122991	123000	60 %	20 %	0 %	20 %	379794629
107	NC_016941	ATTAC	2	10	124581	124590	40 %	40 %	0 %	20 %	379794631
108	NC_016941	TTTTA	2	10	125639	125648	20 %	80 %	0 %	0 %	379794631
109	NC_016941	ACCAA	2	10	127827	127836	60 %	0 %	0 %	40 %	379794633
110	NC_016941	CTTTT	2	10	128230	128239	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016941	TCCCT	2	10	129647	129656	0 %	40 %	0 %	60 %	379794635
112	NC_016941	TAATG	2	10	130003	130012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016941	TGCAA	2	10	130382	130391	40 %	20 %	20 %	20 %	379794636
114	NC_016941	GCTTT	2	10	131884	131893	0 %	60 %	20 %	20 %	379794637
115	NC_016941	TAATA	2	10	134304	134313	60 %	40 %	0 %	0 %	379794640
116	NC_016941	ATATG	2	10	140545	140554	40 %	40 %	20 %	0 %	379794645
117	NC_016941	AATAT	2	10	141377	141386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016941	CGTGT	2	10	142996	143005	0 %	40 %	40 %	20 %	379794646
119	NC_016941	CAAAA	2	10	143524	143533	80 %	0 %	0 %	20 %	379794646
120	NC_016941	AAATG	2	10	144468	144477	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016941	TTCAA	2	10	145409	145418	40 %	40 %	0 %	20 %	379794647
122	NC_016941	GTAAA	2	10	148618	148627	60 %	20 %	20 %	0 %	379794650
123	NC_016941	TTTGA	2	10	152736	152745	20 %	60 %	20 %	0 %	379794654
124	NC_016941	TTTAG	2	10	153499	153508	20 %	60 %	20 %	0 %	379794655
125	NC_016941	TGTTA	2	10	153627	153636	20 %	60 %	20 %	0 %	379794655
126	NC_016941	ATTTT	2	10	155373	155382	20 %	80 %	0 %	0 %	379794657
127	NC_016941	TGAAA	2	10	156851	156860	60 %	20 %	20 %	0 %	379794658
128	NC_016941	TTTGC	2	10	157225	157234	0 %	60 %	20 %	20 %	379794658
129	NC_016941	AATCA	2	10	158184	158193	60 %	20 %	0 %	20 %	379794660
130	NC_016941	GAATT	2	10	160806	160815	40 %	40 %	20 %	0 %	379794662
131	NC_016941	TTATT	2	10	160972	160981	20 %	80 %	0 %	0 %	379794662
132	NC_016941	ATTGA	2	10	161145	161154	40 %	40 %	20 %	0 %	379794662
133	NC_016941	CAAAA	2	10	162193	162202	80 %	0 %	0 %	20 %	379794664
134	NC_016941	ATTAC	2	10	164594	164603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016941	TGTCA	2	10	164630	164639	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016941	TGTTT	2	10	165768	165777	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016941	TTTAT	2	10	173951	173960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016941	GTAGT	2	10	175181	175190	20 %	40 %	40 %	0 %	379794676
139	NC_016941	TTACA	2	10	177836	177845	40 %	40 %	0 %	20 %	379794676
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