MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 3139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	CGACC	2	10	1821	1830	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016940	GAAAT	2	10	5579	5588	60 %	20 %	20 %	0 %	379728139
3	NC_016940	GCTTT	2	10	5662	5671	0 %	60 %	20 %	20 %	379728139
4	NC_016940	ATTAG	2	10	6896	6905	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016940	TCTTT	2	10	10410	10419	0 %	80 %	0 %	20 %	379728142
6	NC_016940	TCGCT	2	10	10734	10743	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016940	ACAGC	2	10	10809	10818	40 %	0 %	20 %	40 %	379728143
8	NC_016940	CGCTT	2	10	11196	11205	0 %	40 %	20 %	40 %	379728144
9	NC_016940	AGATT	2	10	11762	11771	40 %	40 %	20 %	0 %	379728145
10	NC_016940	GCTTT	2	10	12791	12800	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016940	TAAAT	2	10	14895	14904	60 %	40 %	0 %	0 %	379728150
12	NC_016940	GCCCG	2	10	15208	15217	0 %	0 %	40 %	60 %	379728152
13	NC_016940	AATCA	2	10	16243	16252	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016940	CCTTA	2	10	17652	17661	20 %	40 %	0 %	40 %	379728154
15	NC_016940	GCCAA	2	10	20425	20434	40 %	0 %	20 %	40 %	379728158
16	NC_016940	TTTGG	2	10	25286	25295	0 %	60 %	40 %	0 %	379728163
17	NC_016940	TTTGA	2	10	25428	25437	20 %	60 %	20 %	0 %	379728163
18	NC_016940	AAAAT	2	10	25753	25762	80 %	20 %	0 %	0 %	379728163
19	NC_016940	AGTTT	2	10	27466	27475	20 %	60 %	20 %	0 %	379728164
20	NC_016940	TTATT	2	10	31264	31273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016940	GGTCG	2	10	33808	33817	0 %	20 %	60 %	20 %	379728170
22	NC_016940	AAAGG	2	10	37245	37254	60 %	0 %	40 %	0 %	379728175
23	NC_016940	GTTAA	2	10	38184	38193	40 %	40 %	20 %	0 %	379728176
24	NC_016940	AATTT	2	10	40555	40564	40 %	60 %	0 %	0 %	379728180
25	NC_016940	AATAG	2	10	43823	43832	60 %	20 %	20 %	0 %	379728186
26	NC_016940	GCAAA	2	10	44768	44777	60 %	0 %	20 %	20 %	379728187
27	NC_016940	AGCGA	2	10	45322	45331	40 %	0 %	40 %	20 %	379728188
28	NC_016940	CCCGA	2	10	45430	45439	20 %	0 %	20 %	60 %	379728188
29	NC_016940	GCATA	2	10	49852	49861	40 %	20 %	20 %	20 %	379728191
30	NC_016940	AGAGC	2	10	50100	50109	40 %	0 %	40 %	20 %	379728191
31	NC_016940	CAGCC	2	10	50830	50839	20 %	0 %	20 %	60 %	379728192
32	NC_016940	CTAAA	2	10	51653	51662	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016940	TTTTG	2	10	52718	52727	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016940	CAAAA	2	10	53474	53483	80 %	0 %	0 %	20 %	379728195
35	NC_016940	CGCTT	2	10	53946	53955	0 %	40 %	20 %	40 %	379728196
36	NC_016940	ATTTT	2	10	57463	57472	20 %	80 %	0 %	0 %	379728201
37	NC_016940	AGCAC	2	10	59657	59666	40 %	0 %	20 %	40 %	379728201
38	NC_016940	TTTGA	2	10	62308	62317	20 %	60 %	20 %	0 %	379728205
39	NC_016940	TCGCT	2	10	66259	66268	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016940	TGGGA	2	10	67760	67769	20 %	20 %	60 %	0 %	379728208
41	NC_016940	TTTAT	2	10	68595	68604	20 %	80 %	0 %	0 %	379728208
42	NC_016940	ACTTA	2	10	72201	72210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016940	GCAAG	2	10	72373	72382	40 %	0 %	40 %	20 %	379728216
44	NC_016940	CCCGA	2	10	72807	72816	20 %	0 %	20 %	60 %	379728217
45	NC_016940	AGTTT	2	10	73127	73136	20 %	60 %	20 %	0 %	379728218
46	NC_016940	AAAGC	2	10	73380	73389	60 %	0 %	20 %	20 %	379728218
47	NC_016940	AAAAT	2	10	75601	75610	80 %	20 %	0 %	0 %	379728219
48	NC_016940	CCCGA	2	10	77159	77168	20 %	0 %	20 %	60 %	379728220
49	NC_016940	CAAAA	2	10	77196	77205	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016940	TCAAA	2	10	80226	80235	60 %	20 %	0 %	20 %	379728224
51	NC_016940	AGAGC	2	10	84113	84122	40 %	0 %	40 %	20 %	379728229
52	NC_016940	CAGCG	2	10	84791	84800	20 %	0 %	40 %	40 %	379728230
53	NC_016940	TTGGC	2	10	96780	96789	0 %	40 %	40 %	20 %	379728244
54	NC_016940	GACAA	2	10	98413	98422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016940	ACCTT	2	10	100469	100478	20 %	40 %	0 %	40 %	379728249
56	NC_016940	TTTGT	2	10	102220	102229	0 %	80 %	20 %	0 %	379728251
57	NC_016940	CTTTT	2	10	103683	103692	0 %	80 %	0 %	20 %	379728251
58	NC_016940	AGTCA	2	10	107251	107260	40 %	20 %	20 %	20 %	379728253
59	NC_016940	GGTCG	2	10	107771	107780	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016940	CTGCT	2	10	107882	107891	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016940	TTTTC	2	10	108008	108017	0 %	80 %	0 %	20 %	379728254
62	NC_016940	ATTTT	2	10	108863	108872	20 %	80 %	0 %	0 %	379728255
63	NC_016940	CAAGC	2	10	110224	110233	40 %	0 %	20 %	40 %	379728256
64	NC_016940	CTTTT	2	10	112538	112547	0 %	80 %	0 %	20 %	379728259
65	NC_016940	GCCCT	2	10	114282	114291	0 %	20 %	20 %	60 %	379728262
66	NC_016940	CCCGA	2	10	115456	115465	20 %	0 %	20 %	60 %	379728263
67	NC_016940	AAATT	2	10	118337	118346	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016940	ATTAT	2	10	120068	120077	40 %	60 %	0 %	0 %	379728270
69	NC_016940	TCGCC	2	10	120344	120353	0 %	20 %	20 %	60 %	379728270
70	NC_016940	GAAAA	2	10	122157	122166	80 %	0 %	20 %	0 %	379728270
71	NC_016940	ATTTT	2	10	123782	123791	20 %	80 %	0 %	0 %	379728273
72	NC_016940	TTAGT	2	10	124828	124837	20 %	60 %	20 %	0 %	379728275
73	NC_016940	ATCAA	2	10	127150	127159	60 %	20 %	0 %	20 %	379728277
74	NC_016940	TCGGG	2	10	128810	128819	0 %	20 %	60 %	20 %	379728280
75	NC_016940	ATTTT	2	10	133596	133605	20 %	80 %	0 %	0 %	379728285
76	NC_016940	TTGGC	2	10	133821	133830	0 %	40 %	40 %	20 %	379728285
77	NC_016940	TCGCT	2	10	134794	134803	0 %	40 %	20 %	40 %	379728286
78	NC_016940	CGACC	2	10	135484	135493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_016940	CCAGC	2	10	135624	135633	20 %	0 %	20 %	60 %	379728288
80	NC_016940	TTTCC	2	10	137733	137742	0 %	60 %	0 %	40 %	379728291
81	NC_016940	TCGCT	2	10	138577	138586	0 %	40 %	20 %	40 %	379728292
82	NC_016940	CTTGG	2	10	140209	140218	0 %	40 %	40 %	20 %	379728294
83	NC_016940	GATTT	2	10	140812	140821	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016940	TCGCT	2	10	141009	141018	0 %	40 %	20 %	40 %	379728295
85	NC_016940	AAAAG	2	10	144048	144057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016940	TAGTA	2	10	144158	144167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016940	ATGTA	2	10	144519	144528	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016940	TATTG	2	10	148889	148898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016940	AATAG	2	10	149399	149408	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016940	AAAAG	2	10	149675	149684	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016940	TAATT	2	10	153601	153610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016940	AAAAC	2	10	154469	154478	80 %	0 %	0 %	20 %	379728297
93	NC_016940	TCAAA	2	10	156389	156398	60 %	20 %	0 %	20 %	379728299
94	NC_016940	CCAAA	2	10	156435	156444	60 %	0 %	0 %	40 %	379728299
95	NC_016940	GCTCT	2	10	157859	157868	0 %	40 %	20 %	40 %	379728299
96	NC_016940	AATCA	2	10	158154	158163	60 %	20 %	0 %	20 %	379728299
97	NC_016940	AGGCA	2	10	159476	159485	40 %	0 %	40 %	20 %	379728301
98	NC_016940	TAAAG	2	10	160384	160393	60 %	20 %	20 %	0 %	379728302
99	NC_016940	CCCGA	2	10	162592	162601	20 %	0 %	20 %	60 %	379728304
100	NC_016940	CAAAG	2	10	166490	166499	60 %	0 %	20 %	20 %	379728307
101	NC_016940	TCGCT	2	10	168176	168185	0 %	40 %	20 %	40 %	379728309
102	NC_016940	CCCGA	2	10	169968	169977	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_016940	TTATC	2	10	170171	170180	20 %	60 %	0 %	20 %	379728311
104	NC_016940	TTTTG	2	10	171226	171235	0 %	80 %	20 %	0 %	379728311
105	NC_016940	ACGAT	2	10	171435	171444	40 %	20 %	20 %	20 %	379728311
106	NC_016940	GGGCA	2	10	172565	172574	20 %	0 %	60 %	20 %	379728311
107	NC_016940	TCGCT	2	10	175841	175850	0 %	40 %	20 %	40 %	379728312
108	NC_016940	CATTA	2	10	176790	176799	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016940	ATTGA	2	10	177194	177203	40 %	40 %	20 %	0 %	379728314
110	NC_016940	GCTAG	2	10	178065	178074	20 %	20 %	40 %	20 %	379728315
111	NC_016940	CTTTT	2	10	179379	179388	0 %	80 %	0 %	20 %	379728317
112	NC_016940	CTTTG	2	10	180330	180339	0 %	60 %	20 %	20 %	379728318
113	NC_016940	AGCCA	2	10	182151	182160	40 %	0 %	20 %	40 %	379728321
114	NC_016940	TGAGC	2	10	183245	183254	20 %	20 %	40 %	20 %	379728322
115	NC_016940	ATAAG	2	10	183468	183477	60 %	20 %	20 %	0 %	379728323
116	NC_016940	TTTTA	2	10	184030	184039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016940	CAAAA	2	10	184708	184717	80 %	0 %	0 %	20 %	379728324
118	NC_016940	CTTCT	2	10	186550	186559	0 %	60 %	0 %	40 %	379728325
119	NC_016940	AGCGA	2	10	187426	187435	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016940	AAGCG	2	10	187486	187495	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016940	TCTCC	2	10	190605	190614	0 %	40 %	0 %	60 %	379728329
122	NC_016940	TCGGG	2	10	193772	193781	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016940	CATAT	2	10	194691	194700	40 %	40 %	0 %	20 %	379728336
124	NC_016940	ATTTT	2	10	195458	195467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016940	TCGGG	2	10	195504	195513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016940	AATTA	2	10	198955	198964	60 %	40 %	0 %	0 %	379728341
127	NC_016940	TTTGA	2	10	199854	199863	20 %	60 %	20 %	0 %	379728341
128	NC_016940	AAAGC	2	10	200394	200403	60 %	0 %	20 %	20 %	379728341
129	NC_016940	TAAAA	2	10	202272	202281	80 %	20 %	0 %	0 %	379728343
130	NC_016940	AAAGG	2	10	202681	202690	60 %	0 %	40 %	0 %	379728343
131	NC_016940	AGACT	2	10	202942	202951	40 %	20 %	20 %	20 %	379728344
132	NC_016940	CCTTT	2	10	204002	204011	0 %	60 %	0 %	40 %	379728345
133	NC_016940	ATTTT	2	10	207142	207151	20 %	80 %	0 %	0 %	379728347
134	NC_016940	AAATG	2	10	207656	207665	60 %	20 %	20 %	0 %	379728348
135	NC_016940	GCCCC	2	10	209146	209155	0 %	0 %	20 %	80 %	379728350
136	NC_016940	TCGGG	2	10	210712	210721	0 %	20 %	60 %	20 %	379728352
137	NC_016940	CCGTT	2	10	214179	214188	0 %	40 %	20 %	40 %	379728354
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