MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 60687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	TAG	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
2	NC_016940	AGG	2	6	237	242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728135
3	NC_016940	CTT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728135
4	NC_016940	GGC	2	6	376	381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728135
5	NC_016940	GAA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
6	NC_016940	ACA	2	6	427	432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
7	NC_016940	ACA	2	6	496	501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
8	NC_016940	AGA	2	6	509	514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
9	NC_016940	CTG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728135
10	NC_016940	TGA	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
11	NC_016940	GGT	2	6	814	819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728135
12	NC_016940	ACT	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
13	NC_016940	GAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
14	NC_016940	AAG	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
15	NC_016940	ATC	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
16	NC_016940	CAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
17	NC_016940	ATG	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
18	NC_016940	GAT	2	6	1328	1333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
19	NC_016940	ACT	2	6	1380	1385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
20	NC_016940	TAA	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728135
21	NC_016940	GCC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728135
22	NC_016940	TGG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728135
23	NC_016940	AGA	2	6	1614	1619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
24	NC_016940	GGC	2	6	1666	1671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016940	GCC	2	6	1688	1693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016940	GCC	2	6	1748	1753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016940	GGC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016940	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728136
29	NC_016940	CAT	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728136
30	NC_016940	CCT	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728136
31	NC_016940	CGG	2	6	2091	2096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728136
32	NC_016940	TTC	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
33	NC_016940	GGT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728136
34	NC_016940	CCA	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728136
35	NC_016940	CTT	2	6	2473	2478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
36	NC_016940	CGT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
37	NC_016940	GGT	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728136
38	NC_016940	AAT	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728136
39	NC_016940	GCC	2	6	2759	2764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728136
40	NC_016940	CTT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
41	NC_016940	GCC	2	6	3040	3045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728136
42	NC_016940	ATA	2	6	3046	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728136
43	NC_016940	TTA	2	6	3080	3085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728136
44	NC_016940	GCT	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
45	NC_016940	CTG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
46	NC_016940	CTC	2	6	3175	3180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728136
47	NC_016940	ATT	3	9	3485	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016940	TGG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728138
49	NC_016940	ATT	2	6	3549	3554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728138
50	NC_016940	ATT	2	6	3590	3595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728138
51	NC_016940	GTC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728138
52	NC_016940	CCT	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728138
53	NC_016940	CAT	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728138
54	NC_016940	GCC	2	6	3962	3967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728138
55	NC_016940	CGA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728138
56	NC_016940	GAT	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728138
57	NC_016940	ATG	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728138
58	NC_016940	CAA	2	6	4379	4384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728138
59	NC_016940	TTC	2	6	4415	4420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728138
60	NC_016940	AGA	2	6	4426	4431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
61	NC_016940	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
62	NC_016940	GAA	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
63	NC_016940	CGC	2	6	4625	4630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728138
64	NC_016940	AGA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
65	NC_016940	GAA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
66	NC_016940	GGT	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728138
67	NC_016940	GAA	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
68	NC_016940	AGA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
69	NC_016940	AAT	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728138
70	NC_016940	CTG	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016940	TCG	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016940	TCA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016940	ATC	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016940	CAT	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
75	NC_016940	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
76	NC_016940	CCA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728139
77	NC_016940	ATT	2	6	5355	5360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
78	NC_016940	ATT	2	6	5410	5415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
79	NC_016940	CCG	2	6	5434	5439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728139
80	NC_016940	AAG	3	9	5532	5540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
81	NC_016940	AAG	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
82	NC_016940	AAG	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
83	NC_016940	AAG	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
84	NC_016940	ATT	2	6	5876	5881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
85	NC_016940	AAG	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
86	NC_016940	ACT	2	6	5920	5925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
87	NC_016940	ATT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
88	NC_016940	GCA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728139
89	NC_016940	TGC	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728139
90	NC_016940	TCA	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
91	NC_016940	CGG	3	9	6199	6207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728139
92	NC_016940	AAT	2	6	6290	6295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728139
93	NC_016940	CCT	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016940	CAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016940	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728140
96	NC_016940	CGA	2	6	6639	6644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728140
97	NC_016940	CCG	2	6	6658	6663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728140
98	NC_016940	TGC	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728140
99	NC_016940	TGC	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016940	TTC	2	6	6824	6829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016940	GAT	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016940	CAT	2	6	7018	7023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
103	NC_016940	GCA	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728141
104	NC_016940	GTT	2	6	7063	7068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728141
105	NC_016940	TTC	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728141
106	NC_016940	ATA	2	6	7184	7189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
107	NC_016940	CGG	2	6	7219	7224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728141
108	NC_016940	TCA	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
109	NC_016940	GTT	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728141
110	NC_016940	TAA	2	6	7403	7408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
111	NC_016940	TGC	2	6	7434	7439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
112	NC_016940	TGC	2	6	7560	7565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
113	NC_016940	CTG	2	6	7568	7573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
114	NC_016940	TGC	2	6	7709	7714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
115	NC_016940	TAA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
116	NC_016940	CTA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
117	NC_016940	GGC	2	6	7794	7799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728141
118	NC_016940	AGC	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728141
119	NC_016940	ATC	2	6	7976	7981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
120	NC_016940	GCT	2	6	7988	7993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
121	NC_016940	CAA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728141
122	NC_016940	GCC	2	6	8069	8074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728141
123	NC_016940	CTG	3	9	8143	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
124	NC_016940	ATA	2	6	8216	8221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
125	NC_016940	GCT	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728141
126	NC_016940	TTC	3	9	8435	8443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728141
127	NC_016940	TGT	2	6	8449	8454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728141
128	NC_016940	ACT	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
129	NC_016940	AGA	2	6	8552	8557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728141
130	NC_016940	ATA	3	9	8561	8569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728141
131	NC_016940	TCA	2	6	8598	8603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728141
132	NC_016940	GAA	2	6	8649	8654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728141
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245	NC_016940	GGC	2	6	16412	16417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728154
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252	NC_016940	AGA	2	6	16739	16744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728154
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254	NC_016940	GCC	2	6	16776	16781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728154
255	NC_016940	ACC	2	6	16818	16823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728154
256	NC_016940	ATT	2	6	16902	16907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728154
257	NC_016940	ATG	2	6	17097	17102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728154
258	NC_016940	GTT	2	6	17115	17120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728154
259	NC_016940	GAA	2	6	17151	17156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728154
260	NC_016940	CAC	2	6	17184	17189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728154
261	NC_016940	TTC	2	6	17223	17228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728154
262	NC_016940	TGG	2	6	17356	17361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728154
263	NC_016940	TGG	2	6	17404	17409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728154
264	NC_016940	CCG	2	6	17410	17415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728154
265	NC_016940	CTT	2	6	17468	17473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728154
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270	NC_016940	TTG	2	6	17811	17816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_016940	GCG	2	6	17835	17840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_016940	GTC	2	6	17859	17864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_016940	TTG	2	6	17884	17889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_016940	GCG	2	6	17935	17940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728155
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280	NC_016940	TGT	2	6	18469	18474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728156
281	NC_016940	TAT	2	6	18503	18508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728156
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293	NC_016940	ATA	2	6	19581	19586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728157
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381	NC_016940	GGC	2	6	25274	25279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728163
382	NC_016940	GCA	2	6	25388	25393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728163
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