MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 4495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	CT	3	6	1094	1099	0 %	50 %	0 %	50 %	379728135
2	NC_016940	CT	3	6	1451	1456	0 %	50 %	0 %	50 %	379728135
3	NC_016940	CA	3	6	2056	2061	50 %	0 %	0 %	50 %	379728136
4	NC_016940	TC	3	6	2673	2678	0 %	50 %	0 %	50 %	379728136
5	NC_016940	CT	3	6	3263	3268	0 %	50 %	0 %	50 %	379728137
6	NC_016940	TA	3	6	7091	7096	50 %	50 %	0 %	0 %	379728141
7	NC_016940	TA	4	8	7103	7110	50 %	50 %	0 %	0 %	379728141
8	NC_016940	GA	3	6	8095	8100	50 %	0 %	50 %	0 %	379728141
9	NC_016940	TA	3	6	9108	9113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016940	TA	3	6	10281	10286	50 %	50 %	0 %	0 %	379728142
11	NC_016940	TC	3	6	11183	11188	0 %	50 %	0 %	50 %	379728144
12	NC_016940	TA	3	6	11643	11648	50 %	50 %	0 %	0 %	379728144
13	NC_016940	AT	3	6	11711	11716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016940	CT	3	6	12859	12864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016940	AT	3	6	13922	13927	50 %	50 %	0 %	0 %	379728150
16	NC_016940	CT	3	6	14080	14085	0 %	50 %	0 %	50 %	379728150
17	NC_016940	GC	3	6	14270	14275	0 %	0 %	50 %	50 %	379728150
18	NC_016940	AC	3	6	14647	14652	50 %	0 %	0 %	50 %	379728150
19	NC_016940	AG	3	6	14958	14963	50 %	0 %	50 %	0 %	379728151
20	NC_016940	AT	3	6	15249	15254	50 %	50 %	0 %	0 %	379728152
21	NC_016940	GA	3	6	16984	16989	50 %	0 %	50 %	0 %	379728154
22	NC_016940	CT	3	6	17252	17257	0 %	50 %	0 %	50 %	379728154
23	NC_016940	AT	3	6	18539	18544	50 %	50 %	0 %	0 %	379728156
24	NC_016940	TC	3	6	18784	18789	0 %	50 %	0 %	50 %	379728156
25	NC_016940	TA	3	6	18899	18904	50 %	50 %	0 %	0 %	379728156
26	NC_016940	AT	3	6	18977	18982	50 %	50 %	0 %	0 %	379728156
27	NC_016940	GC	3	6	19776	19781	0 %	0 %	50 %	50 %	379728158
28	NC_016940	CT	3	6	19965	19970	0 %	50 %	0 %	50 %	379728158
29	NC_016940	CA	3	6	20134	20139	50 %	0 %	0 %	50 %	379728158
30	NC_016940	CT	3	6	24049	24054	0 %	50 %	0 %	50 %	379728160
31	NC_016940	AT	4	8	25149	25156	50 %	50 %	0 %	0 %	379728162
32	NC_016940	GA	3	6	25951	25956	50 %	0 %	50 %	0 %	379728163
33	NC_016940	AG	3	6	26397	26402	50 %	0 %	50 %	0 %	379728163
34	NC_016940	TC	3	6	27008	27013	0 %	50 %	0 %	50 %	379728163
35	NC_016940	CT	3	6	28033	28038	0 %	50 %	0 %	50 %	379728164
36	NC_016940	CT	4	8	29691	29698	0 %	50 %	0 %	50 %	379728165
37	NC_016940	GC	3	6	31066	31071	0 %	0 %	50 %	50 %	379728167
38	NC_016940	TA	3	6	34460	34465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016940	CT	3	6	38663	38668	0 %	50 %	0 %	50 %	379728176
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41	NC_016940	TC	3	6	40720	40725	0 %	50 %	0 %	50 %	379728180
42	NC_016940	CT	3	6	41994	41999	0 %	50 %	0 %	50 %	379728181
43	NC_016940	TA	3	6	43054	43059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016940	AT	3	6	43270	43275	50 %	50 %	0 %	0 %	379728185
45	NC_016940	TA	3	6	43355	43360	50 %	50 %	0 %	0 %	379728185
46	NC_016940	AT	3	6	43480	43485	50 %	50 %	0 %	0 %	379728185
47	NC_016940	CA	3	6	44023	44028	50 %	0 %	0 %	50 %	379728186
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49	NC_016940	TC	3	6	44899	44904	0 %	50 %	0 %	50 %	379728187
50	NC_016940	AT	3	6	46096	46101	50 %	50 %	0 %	0 %	379728189
51	NC_016940	AC	3	6	47448	47453	50 %	0 %	0 %	50 %	379728190
52	NC_016940	GA	3	6	49726	49731	50 %	0 %	50 %	0 %	379728191
53	NC_016940	TA	3	6	53217	53222	50 %	50 %	0 %	0 %	379728195
54	NC_016940	CT	3	6	59356	59361	0 %	50 %	0 %	50 %	379728201
55	NC_016940	AG	3	6	60761	60766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016940	GC	3	6	60940	60945	0 %	0 %	50 %	50 %	379728204
57	NC_016940	AT	3	6	61097	61102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016940	AG	3	6	61666	61671	50 %	0 %	50 %	0 %	379728205
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60	NC_016940	AT	3	6	63630	63635	50 %	50 %	0 %	0 %	379728205
61	NC_016940	CT	3	6	63955	63960	0 %	50 %	0 %	50 %	379728206
62	NC_016940	AG	3	6	64011	64016	50 %	0 %	50 %	0 %	379728206
63	NC_016940	TA	3	6	65242	65247	50 %	50 %	0 %	0 %	379728206
64	NC_016940	GT	4	8	66070	66077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_016940	AG	3	6	73655	73660	50 %	0 %	50 %	0 %	379728218
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72	NC_016940	TA	3	6	76786	76791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74	NC_016940	TC	3	6	78382	78387	0 %	50 %	0 %	50 %	379728222
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76	NC_016940	CT	4	8	79020	79027	0 %	50 %	0 %	50 %	379728223
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83	NC_016940	CT	3	6	84773	84778	0 %	50 %	0 %	50 %	379728230
84	NC_016940	TA	3	6	85288	85293	50 %	50 %	0 %	0 %	379728232
85	NC_016940	TA	4	8	87249	87256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_016940	AT	3	6	89558	89563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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92	NC_016940	TA	3	6	93176	93181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94	NC_016940	TA	3	6	95375	95380	50 %	50 %	0 %	0 %	379728243
95	NC_016940	TC	3	6	95517	95522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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97	NC_016940	TC	3	6	97578	97583	0 %	50 %	0 %	50 %	379728245
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104	NC_016940	CT	3	6	103171	103176	0 %	50 %	0 %	50 %	379728251
105	NC_016940	AT	3	6	103320	103325	50 %	50 %	0 %	0 %	379728251
106	NC_016940	TC	3	6	103335	103340	0 %	50 %	0 %	50 %	379728251
107	NC_016940	CT	3	6	103430	103435	0 %	50 %	0 %	50 %	379728251
108	NC_016940	TA	3	6	103731	103736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016940	TA	3	6	103739	103744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016940	AT	3	6	105656	105661	50 %	50 %	0 %	0 %	379728253
111	NC_016940	AG	3	6	105982	105987	50 %	0 %	50 %	0 %	379728253
112	NC_016940	AG	3	6	106666	106671	50 %	0 %	50 %	0 %	379728253
113	NC_016940	AT	3	6	108207	108212	50 %	50 %	0 %	0 %	379728254
114	NC_016940	CT	3	6	109470	109475	0 %	50 %	0 %	50 %	379728255
115	NC_016940	AT	3	6	112324	112329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016940	CT	3	6	112528	112533	0 %	50 %	0 %	50 %	379728259
117	NC_016940	TA	3	6	113744	113749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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119	NC_016940	TA	4	8	114789	114796	50 %	50 %	0 %	0 %	379728262
120	NC_016940	TA	3	6	118241	118246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016940	CT	3	6	119275	119280	0 %	50 %	0 %	50 %	379728269
122	NC_016940	TG	3	6	119836	119841	0 %	50 %	50 %	0 %	379728269
123	NC_016940	AT	3	6	122368	122373	50 %	50 %	0 %	0 %	379728270
124	NC_016940	AT	3	6	122659	122664	50 %	50 %	0 %	0 %	379728271
125	NC_016940	TA	3	6	123081	123086	50 %	50 %	0 %	0 %	379728271
126	NC_016940	AG	3	6	123614	123619	50 %	0 %	50 %	0 %	379728272
127	NC_016940	AT	3	6	124716	124721	50 %	50 %	0 %	0 %	379728275
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134	NC_016940	CT	3	6	129066	129071	0 %	50 %	0 %	50 %	379728281
135	NC_016940	TA	3	6	130505	130510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016940	CT	3	6	134603	134608	0 %	50 %	0 %	50 %	379728285
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138	NC_016940	AC	4	8	135719	135726	50 %	0 %	0 %	50 %	379728288
139	NC_016940	TA	3	6	136638	136643	50 %	50 %	0 %	0 %	379728289
140	NC_016940	TC	4	8	138991	138998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016940	GC	3	6	139764	139769	0 %	0 %	50 %	50 %	379728294
142	NC_016940	CT	3	6	141387	141392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016940	TC	4	8	142471	142478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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