MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 plasmid pRMB

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016939	AT	4	8	343	350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016939	TA	3	6	396	401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016939	AT	4	8	1323	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016939	TA	3	6	2714	2719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016939	TG	3	6	2748	2753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016939	AG	3	6	2876	2881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016939	TA	3	6	4654	4659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016939	AG	3	6	4816	4821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016939	TA	3	6	5258	5263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016939	CT	3	6	5555	5560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016939	AT	3	6	5879	5884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016939	AT	3	6	7226	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016939	TA	3	6	7851	7856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016939	TA	3	6	8184	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016939	TA	3	6	8212	8217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016939	AT	3	6	8261	8266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016939	TA	3	6	8688	8693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016939	CA	3	6	8797	8802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016939	GA	3	6	9047	9052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016939	CT	3	6	12348	12353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.