MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 plasmid pRMB

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016939	T	6	6	51	56	0 %	100 %	0 %	0 %	378750098
2	NC_016939	A	6	6	309	314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016939	A	6	6	417	422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016939	A	6	6	517	522	100 %	0 %	0 %	0 %	378750099
5	NC_016939	A	6	6	835	840	100 %	0 %	0 %	0 %	378750099
6	NC_016939	A	6	6	1117	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	378750100
7	NC_016939	A	7	7	1130	1136	100 %	0 %	0 %	0 %	378750100
8	NC_016939	T	7	7	1637	1643	0 %	100 %	0 %	0 %	378750101
9	NC_016939	T	7	7	1747	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	378750101
10	NC_016939	T	6	6	1757	1762	0 %	100 %	0 %	0 %	378750101
11	NC_016939	T	6	6	1938	1943	0 %	100 %	0 %	0 %	378750101
12	NC_016939	A	7	7	2272	2278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016939	A	6	6	2514	2519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016939	A	6	6	2794	2799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016939	T	6	6	2861	2866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016939	C	6	6	4788	4793	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17	NC_016939	T	6	6	5539	5544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016939	A	6	6	5607	5612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016939	A	6	6	6254	6259	100 %	0 %	0 %	0 %	378750104
20	NC_016939	A	6	6	6293	6298	100 %	0 %	0 %	0 %	378750104
21	NC_016939	A	8	8	6645	6652	100 %	0 %	0 %	0 %	378750104
22	NC_016939	T	6	6	7134	7139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016939	A	6	6	8386	8391	100 %	0 %	0 %	0 %	378750106
24	NC_016939	A	6	6	8909	8914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016939	T	6	6	9260	9265	0 %	100 %	0 %	0 %	378750107
26	NC_016939	A	6	6	9274	9279	100 %	0 %	0 %	0 %	378750107
27	NC_016939	T	7	7	9335	9341	0 %	100 %	0 %	0 %	378750107
28	NC_016939	A	6	6	9808	9813	100 %	0 %	0 %	0 %	378750107
29	NC_016939	A	6	6	10838	10843	100 %	0 %	0 %	0 %	378750107
30	NC_016939	A	7	7	10947	10953	100 %	0 %	0 %	0 %	378750107
31	NC_016939	T	6	6	12452	12457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016939	T	7	7	12488	12494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016939	T	6	6	12554	12559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016939	A	6	6	13568	13573	100 %	0 %	0 %	0 %	378750109
35	NC_016939	A	6	6	13595	13600	100 %	0 %	0 %	0 %	378750109
36	NC_016939	T	6	6	13861	13866	0 %	100 %	0 %	0 %	378750109
37	NC_016939	T	6	6	14364	14369	0 %	100 %	0 %	0 %	378750109

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.