MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 chromosome 1

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016938	AAAATA	2	12	8992	9003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016938	ATTTTT	2	12	14086	14097	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016938	TATTTT	3	18	15860	15877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016938	TAAAAA	2	12	27857	27868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016938	TAAAAA	2	12	33044	33055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016938	TAATTG	2	12	33083	33094	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016938	ATATTT	2	12	39897	39908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016938	TCTTAT	2	12	42500	42511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016938	TGAGAA	2	12	54477	54488	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016938	AAAATA	2	12	57096	57107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016938	TTTATA	2	12	60145	60156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016938	TTTAAT	2	12	72643	72654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016938	AATATA	2	12	83365	83376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016938	AAATAA	2	12	83694	83705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016938	TTTTTA	2	12	84051	84062	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016938	TATAAA	2	12	96944	96955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016938	AAGATA	2	12	97616	97627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016938	TAAAAA	2	12	104425	104436	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016938	ACCAAC	2	12	105274	105285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016938	TAAATT	2	12	105507	105518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016938	GAAAAA	2	12	107281	107292	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016938	ATAAAA	2	12	107515	107526	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016938	ATGTTA	2	12	111525	111536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016938	TAAAAA	2	12	113861	113872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016938	TTTATA	2	12	114392	114403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016938	AAAATT	2	12	122414	122425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016938	TAAGAA	3	18	123343	123360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016938	TATTTT	2	12	153651	153662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016938	ATAAAA	2	12	173306	173317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016938	TTTTAT	2	12	173350	173361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016938	TATGAA	2	12	173392	173403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016938	TTTTAA	2	12	190385	190396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016938	AAATTT	2	12	195937	195948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016938	ATTTTA	2	12	232456	232467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016938	ATTAAC	2	12	233931	233942	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016938	ATTTAA	2	12	236922	236933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016938	TATAAA	2	12	238194	238205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016938	AAAAAT	2	12	240218	240229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016938	TTTTTA	2	12	256530	256541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016938	TATTGA	2	12	257494	257505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016938	TTTAAT	2	12	277147	277158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016938	CAAAAA	2	12	285192	285203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016938	TGCTTA	2	12	286775	286786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016938	TGAAAA	2	12	287387	287398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016938	ATTAAA	2	12	297488	297499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016938	AATTTA	2	12	309301	309312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016938	TTGATT	2	12	309676	309687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016938	ATTTAA	2	12	318731	318742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016938	TAAAAA	2	12	330102	330113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016938	TAGATA	2	12	350247	350258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016938	GTAACA	2	12	352874	352885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016938	TAAATA	2	12	356475	356486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016938	TTTATT	2	12	357877	357888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016938	AATATA	2	12	363470	363481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016938	TTAAAA	2	12	377473	377484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016938	ATTAAT	2	12	383941	383952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016938	AATAAA	2	12	386010	386021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016938	TAAAAA	2	12	387744	387755	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016938	AAATGC	2	12	411886	411897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016938	ATTTTT	2	12	421612	421623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016938	TAATTA	2	12	423150	423161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016938	ATAAAA	2	12	428693	428704	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016938	TTCTTG	2	12	432882	432893	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016938	TTTTTA	2	12	433080	433091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016938	TTAGCA	2	12	433262	433273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016938	GTTTAA	2	12	433359	433370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016938	AAACAA	2	12	442205	442216	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016938	GAATAA	2	12	447046	447057	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016938	CAAAGA	2	12	448985	448996	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016938	AATAAA	2	12	453639	453650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016938	TATATT	2	12	456656	456667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016938	AGTAAA	2	12	471010	471021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016938	TATTTT	2	12	485111	485122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016938	TTTCTT	2	12	493240	493251	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016938	TTATTT	2	12	508861	508872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016938	TTTAAT	2	12	508954	508965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016938	TTTCTG	2	12	523139	523150	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016938	TAACCA	2	12	523996	524007	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016938	TGAATT	2	12	526241	526252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016938	ATAAAA	2	12	526876	526887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016938	GTTAAT	2	12	535541	535552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016938	TAAAAA	2	12	550786	550797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016938	ATATTT	2	12	550976	550987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016938	CAGTAT	2	12	585848	585859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016938	GGTATA	2	12	596937	596948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016938	AATTAG	2	12	603101	603112	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016938	TATTCT	2	12	603196	603207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016938	ATTTTT	2	12	603809	603820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016938	ATACTA	2	12	614572	614583	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016938	ATAGTT	2	12	618030	618041	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016938	AAAAAT	2	12	627534	627545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016938	TAAATT	2	12	631836	631847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016938	TTATTT	2	12	640139	640150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016938	TTTAAC	2	12	651134	651145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016938	TAAAAA	2	12	678960	678971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016938	GAAAAA	2	12	682422	682433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016938	ACAAGG	2	12	688725	688736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016938	AGTTAA	2	12	694279	694290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016938	TAAAAA	2	12	712800	712811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016938	TTTATT	2	12	724483	724494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016938	AAATGA	2	12	745962	745973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016938	TATTTT	2	12	746209	746220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016938	AAATAT	2	12	746639	746650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016938	AGTTCA	2	12	747452	747463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016938	TTTTTA	2	12	752854	752865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016938	TAGGAG	2	12	760981	760992	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016938	GAAAAA	2	12	765670	765681	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016938	ATGATA	2	12	772965	772976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016938	AATTAA	3	18	773008	773025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016938	ATTTTC	2	12	774749	774760	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016938	TTACAT	2	12	806891	806902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016938	CAAAAA	2	12	813215	813226	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016938	AAACTG	2	12	813638	813649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016938	AAAAAT	2	12	814534	814545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016938	TTTTAA	2	12	827016	827027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016938	AAAAAT	2	12	827390	827401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016938	ATAACA	2	12	833005	833016	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016938	TTTTAT	2	12	845713	845724	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016938	TTTAAA	2	12	860645	860656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016938	ATTGGT	2	12	864330	864341	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016938	TTTCTT	2	12	870988	870999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016938	TTGAAT	2	12	881374	881385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016938	AAAAAT	2	12	887122	887133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016938	ATATTT	2	12	899474	899485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016938	ATATAA	2	12	899493	899504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016938	ATATGA	2	12	899657	899668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016938	ATTTTT	2	12	899984	899995	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016938	TTAAAT	2	12	919467	919478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016938	TGAAAA	2	12	923091	923102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016938	AGAGGG	2	12	948205	948216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016938	ATTGGA	2	12	954550	954561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016938	GCCATT	2	12	958659	958670	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016938	ATTTAA	2	12	960245	960256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_016938	ATTTAA	2	12	1779092	1779103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016938	TTTTTC	2	12	1780526	1780537	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_016938	GAATTT	2	12	1788125	1788136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016938	TAAAAC	2	12	1788189	1788200	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_016938	AGATAA	2	12	1823042	1823053	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016938	TTTAAT	2	12	1830905	1830916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_016938	AGAATT	2	12	1843415	1843426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
266	NC_016938	CTTCAG	2	12	1845532	1845543	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.