MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Melissococcus plutonius DAT561 chromosome 1

Total Repeats: 634

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016938	ATTTCT	2	12	1444144	1444155	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379727814
502	NC_016938	ATCAAT	2	12	1449437	1449448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379727818
503	NC_016938	TAGAAG	2	12	1450963	1450974	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379727819
504	NC_016938	ACGTTG	2	12	1456994	1457005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379727824
505	NC_016938	TGGAGT	2	12	1460588	1460599	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379727826
506	NC_016938	AATGTG	2	12	1468237	1468248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379727835
507	NC_016938	ATAGAT	2	12	1476629	1476640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379727843
508	NC_016938	ATTTTT	2	12	1484662	1484673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379727848
509	NC_016938	TCCAAT	2	12	1486759	1486770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379727850
510	NC_016938	TGATAA	2	12	1490401	1490412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379727853
511	NC_016938	TGCAAG	2	12	1492201	1492212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379727856
512	NC_016938	AATTTT	2	12	1493300	1493311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379727858
513	NC_016938	ATCAAA	2	12	1493669	1493680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379727858
514	NC_016938	CTTTTT	2	12	1496478	1496489	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379727862
515	NC_016938	TAAACC	2	12	1496787	1496798	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379727863
516	NC_016938	AGGTGA	2	12	1497153	1497164	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379727863
517	NC_016938	CAAAAG	2	12	1503136	1503147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379727870
518	NC_016938	TCACCT	2	12	1503467	1503478	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379727871
519	NC_016938	CTATAT	2	12	1504190	1504201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379727872
520	NC_016938	TGTATG	2	12	1506527	1506538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379727874
521	NC_016938	TGAAAA	2	12	1521750	1521761	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379727888
522	NC_016938	GAACAA	2	12	1529413	1529424	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379727895
523	NC_016938	CATAGG	2	12	1530703	1530714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379727896
524	NC_016938	AATTTA	2	12	1537120	1537131	50 %	50 %	0 %	0 %	379727900
525	NC_016938	TTTTTC	2	12	1538636	1538647	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379727901
526	NC_016938	TCATAA	2	12	1538772	1538783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379727901
527	NC_016938	ATAAAT	2	12	1539641	1539652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379727902
528	NC_016938	TAAAAT	2	12	1541413	1541424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379727904
529	NC_016938	TAATTT	2	12	1544022	1544033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379727908
530	NC_016938	CTTTTA	2	12	1545233	1545244	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379727908
531	NC_016938	TTTATC	2	12	1547222	1547233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379727911
532	NC_016938	TAAGCA	2	12	1548616	1548627	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379727912
533	NC_016938	AGCTGC	2	12	1549845	1549856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379727914
534	NC_016938	GGACCA	2	12	1554887	1554898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379727919
535	NC_016938	AATTGT	2	12	1558796	1558807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379727922
536	NC_016938	AATTAA	2	12	1569884	1569895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379727927
537	NC_016938	TTGTGC	2	12	1571339	1571350	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379727929
538	NC_016938	AAAAGA	2	12	1574088	1574099	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379727931
539	NC_016938	AATAAA	2	12	1574252	1574263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379727932
540	NC_016938	ATTAAA	2	12	1576980	1576991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379727934
541	NC_016938	TTAAAA	2	12	1584132	1584143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379727940
542	NC_016938	ATTTAA	2	12	1585488	1585499	50 %	50 %	0 %	0 %	379727941
543	NC_016938	AGGTGT	2	12	1589846	1589857	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379727943
544	NC_016938	AGATAA	2	12	1590362	1590373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379727944
545	NC_016938	TCTTTT	2	12	1594996	1595007	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379727948
546	NC_016938	TACAAG	2	12	1595799	1595810	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379727950
547	NC_016938	TACTTT	2	12	1597032	1597043	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379727951
548	NC_016938	CTTTAA	2	12	1598436	1598447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379727952
549	NC_016938	TCAAAA	2	12	1601860	1601871	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379727955
550	NC_016938	GCCAAG	2	12	1602515	1602526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379727956
551	NC_016938	AAATAA	2	12	1606214	1606225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379727957
552	NC_016938	ATTAAT	2	12	1607549	1607560	50 %	50 %	0 %	0 %	379727958
553	NC_016938	TCACCA	2	12	1611719	1611730	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379727960
554	NC_016938	TTTTAT	2	12	1618544	1618555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379727965
555	NC_016938	TTGATA	2	12	1618966	1618977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379727965
556	NC_016938	CTTTAA	2	12	1620286	1620297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379727966
557	NC_016938	TTTTCC	2	12	1623352	1623363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379727968
558	NC_016938	TTTTAT	2	12	1633372	1633383	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379727975
559	NC_016938	AGATGG	2	12	1635592	1635603	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379727977
560	NC_016938	TTATTG	2	12	1636107	1636118	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379727977
561	NC_016938	ACGGCA	2	12	1636616	1636627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379727977
562	NC_016938	AGAATA	2	12	1638326	1638337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379727978
563	NC_016938	CTATTT	2	12	1642177	1642188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379727982
564	NC_016938	GCATAA	2	12	1655915	1655926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379727993
565	NC_016938	CAATCG	2	12	1657036	1657047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379727993
566	NC_016938	TAAATA	2	12	1657795	1657806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379727994
567	NC_016938	ATTTAT	2	12	1658556	1658567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379727995
568	NC_016938	GCTTTA	2	12	1661280	1661291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379727998
569	NC_016938	TTTCTT	2	12	1668505	1668516	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728004
570	NC_016938	CTTTTT	2	12	1671449	1671460	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728008
571	NC_016938	TTTAAT	2	12	1672128	1672139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728008
572	NC_016938	TTGGTA	2	12	1678181	1678192	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379728014
573	NC_016938	TCCCAA	2	12	1678585	1678596	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379728014
574	NC_016938	TTCTCC	2	12	1680576	1680587	0 %	50 %	0 %	50 %	379728016
575	NC_016938	GCATAG	2	12	1684702	1684713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379728020
576	NC_016938	GATGAG	3	18	1684714	1684731	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379728020
577	NC_016938	TAATTT	2	12	1684775	1684786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728020
578	NC_016938	TTCACT	2	12	1685470	1685481	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379728021
579	NC_016938	AAACAG	2	12	1689656	1689667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379728025
580	NC_016938	TTACAG	2	12	1690295	1690306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379728025
581	NC_016938	CTTGTG	2	12	1693973	1693984	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728028
582	NC_016938	ATCCTG	2	12	1694545	1694556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728029
583	NC_016938	GTTATT	2	12	1700808	1700819	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379728032
584	NC_016938	TTTTAT	2	12	1701805	1701816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379728032
585	NC_016938	ATAAAA	2	12	1708324	1708335	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379728035
586	NC_016938	CTTGTA	2	12	1709165	1709176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728037
587	NC_016938	TTGCAT	2	12	1718398	1718409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728044
588	NC_016938	TATTTT	2	12	1720674	1720685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379728045
589	NC_016938	GCAATT	2	12	1720949	1720960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379728045
590	NC_016938	ATTGAA	2	12	1722470	1722481	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379728046
591	NC_016938	TGAAAT	2	12	1723549	1723560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379728046
592	NC_016938	TGTTAC	2	12	1725831	1725842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728048
593	NC_016938	GCAATA	2	12	1728979	1728990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379728049
594	NC_016938	TTAATT	2	12	1732756	1732767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728052
595	NC_016938	TGAACA	2	12	1736484	1736495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379728056
596	NC_016938	TAAATT	2	12	1738207	1738218	50 %	50 %	0 %	0 %	379728057
597	NC_016938	CAATTG	2	12	1745257	1745268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379728062
598	NC_016938	TTTCTT	2	12	1747802	1747813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728064
599	NC_016938	CTTTTT	2	12	1751654	1751665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728067
600	NC_016938	CAAATA	2	12	1756504	1756515	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379728071
601	NC_016938	CAAATG	2	12	1757068	1757079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379728071
602	NC_016938	GTTTTT	2	12	1760085	1760096	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	379728073
603	NC_016938	AGTCCC	2	12	1765567	1765578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379728078
604	NC_016938	ATTACA	2	12	1765895	1765906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379728078
605	NC_016938	TCTCCA	2	12	1766669	1766680	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379728079
606	NC_016938	AAAAAC	2	12	1768820	1768831	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379728080
607	NC_016938	GTTTAG	2	12	1768964	1768975	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379728080
608	NC_016938	CAGAGA	2	12	1772281	1772292	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379728084
609	NC_016938	AATAAA	2	12	1772900	1772911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379728085
610	NC_016938	AATTCC	2	12	1776724	1776735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728087
611	NC_016938	TTGTTC	2	12	1776976	1776987	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728087
612	NC_016938	CCAATT	2	12	1777239	1777250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728087
613	NC_016938	TTCTTT	2	12	1777564	1777575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728087
614	NC_016938	ATTCAA	2	12	1782752	1782763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379728090
615	NC_016938	CAACCA	2	12	1788557	1788568	50 %	0 %	0 %	50 %	379728093
616	NC_016938	ATTGTC	2	12	1789693	1789704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728094
617	NC_016938	TTCTTT	2	12	1790235	1790246	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728094
618	NC_016938	CTATTT	2	12	1793122	1793133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379728095
619	NC_016938	TTGTTT	2	12	1798012	1798023	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	379728099
620	NC_016938	TTCTAT	2	12	1800874	1800885	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379728101
621	NC_016938	TCCACC	2	12	1805319	1805330	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	379728104
622	NC_016938	GGACTT	2	12	1813631	1813642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379728106
623	NC_016938	TAAAAA	2	12	1813762	1813773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379728106
624	NC_016938	TGATTT	2	12	1816332	1816343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379728108
625	NC_016938	TTAATG	2	12	1816480	1816491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379728108
626	NC_016938	CTGTTT	2	12	1818208	1818219	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728109
627	NC_016938	ATCTTT	2	12	1818897	1818908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379728110
628	NC_016938	ATCAAT	2	12	1821676	1821687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379728113
629	NC_016938	ACCTGT	2	12	1826992	1827003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728117
630	NC_016938	TTTCTC	2	12	1833158	1833169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728122
631	NC_016938	CTGCTT	2	12	1838550	1838561	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379728126
632	NC_016938	ATCCTT	2	12	1840314	1840325	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379728127
633	NC_016938	CTTTTT	2	12	1844272	1844283	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728131
634	NC_016938	CCTATA	2	12	1844874	1844885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728131

< Previous 12Next >