MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis TI0902 chromosome

Total Repeats: 921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016937	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725074
2	NC_016937	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016937	GTTTTA	2	12	8679	8690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016937	TATATC	2	12	12059	12070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379725078
5	NC_016937	CTGCTT	2	12	14915	14926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379725081
6	NC_016937	TACTGA	2	12	15081	15092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725081
7	NC_016937	AGATGG	2	12	17180	17191	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379725083
8	NC_016937	TTATAT	2	12	17525	17536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725083
9	NC_016937	TCAAGA	2	12	18094	18105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725084
10	NC_016937	GAAGCA	2	12	18321	18332	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725085
11	NC_016937	GAGTAT	2	12	20318	20329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725086
12	NC_016937	CCAGAT	2	12	20456	20467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379725086
13	NC_016937	GTAAAG	2	12	21000	21011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725086
14	NC_016937	ATGATA	2	12	24619	24630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016937	CAAATC	2	12	26615	26626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379725091
16	NC_016937	AGCTAA	2	12	28105	28116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725092
17	NC_016937	ATGATA	2	12	30309	30320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016937	TACTCG	2	12	31894	31905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725096
19	NC_016937	TGGTGC	2	12	34964	34975	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379725100
20	NC_016937	TGCAAA	2	12	36024	36035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725101
21	NC_016937	ATATTG	2	12	37485	37496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725101
22	NC_016937	TAACAT	2	12	40119	40130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379725104
23	NC_016937	TCAGTC	2	12	40257	40268	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725105
24	NC_016937	TGCAAA	2	12	42290	42301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725106
25	NC_016937	TTGGTA	2	12	43073	43084	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725107
26	NC_016937	TATTGG	2	12	43761	43772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725107
27	NC_016937	TCCATG	2	12	46956	46967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016937	TTTTGA	2	12	49141	49152	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725111
29	NC_016937	TGAAGA	2	12	49407	49418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725112
30	NC_016937	GGCAAA	2	12	59140	59151	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725119
31	NC_016937	ATTATG	2	12	59799	59810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725120
32	NC_016937	ATAAAT	2	12	61273	61284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725122
33	NC_016937	AGGCTA	2	12	61521	61532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379725123
34	NC_016937	AGCAAG	2	12	66496	66507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725128
35	NC_016937	GTTAGA	2	12	76228	76239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725137
36	NC_016937	AAAGCT	2	12	77478	77489	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725139
37	NC_016937	TAAAGC	2	12	77678	77689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725139
38	NC_016937	ATTATA	2	12	78847	78858	50 %	50 %	0 %	0 %	379725139
39	NC_016937	AAATGC	2	12	78925	78936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725139
40	NC_016937	AGATAC	2	12	81150	81161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725140
41	NC_016937	GGAGCA	2	12	84276	84287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379725144
42	NC_016937	TTTATA	2	12	85264	85275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016937	TGGTGT	2	12	89444	89455	0 %	50 %	50 %	0 %	379725149
44	NC_016937	ATCCGT	2	12	90969	90980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725149
45	NC_016937	TGATGT	2	12	91409	91420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725149
46	NC_016937	AGCTTG	2	12	94366	94377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379725152
47	NC_016937	GTTGAG	2	12	99953	99964	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379725155
48	NC_016937	AAAAAC	2	12	100170	100181	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379725155
49	NC_016937	GCAAAT	2	12	109760	109771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725161
50	NC_016937	CAAATA	2	12	110271	110282	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379725161
51	NC_016937	CAACAT	2	12	111384	111395	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379725161
52	NC_016937	CAATAG	2	12	113495	113506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725162
53	NC_016937	TAAATA	2	12	114182	114193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725163
54	NC_016937	TGCAGC	2	12	116395	116406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379725165
55	NC_016937	TTATAG	2	12	117860	117871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725166
56	NC_016937	AGATAA	2	12	117882	117893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379725166
57	NC_016937	GAAAGT	2	12	119489	119500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725167
58	NC_016937	CTGGTA	2	12	119677	119688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379725167
59	NC_016937	GCAAAT	2	12	127918	127929	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725174
60	NC_016937	TAGGTG	2	12	130831	130842	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379725176
61	NC_016937	TAGTGC	2	12	135518	135529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016937	ATTTTT	2	12	136176	136187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016937	TTAATA	2	12	142561	142572	50 %	50 %	0 %	0 %	379725184
64	NC_016937	ACTTTG	2	12	144860	144871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379725185
65	NC_016937	ATTGTT	2	12	147441	147452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725187
66	NC_016937	AGCAAC	2	12	148434	148445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379725189
67	NC_016937	TAGATC	2	12	149397	149408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725189
68	NC_016937	GCTGTT	2	12	154521	154532	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379725196
69	NC_016937	AGAAAA	2	12	155538	155549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379725197
70	NC_016937	TTGATT	2	12	155806	155817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725197
71	NC_016937	GGTAAA	2	12	156261	156272	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725197
72	NC_016937	TATATG	2	12	158661	158672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725197
73	NC_016937	GTTGAG	2	12	159340	159351	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379725198
74	NC_016937	TCCACA	2	12	164744	164755	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016937	TGCCTA	2	12	169508	169519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725205
76	NC_016937	TGATTT	2	12	172542	172553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725210
77	NC_016937	ATAAAC	2	12	173971	173982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016937	ATTAAA	2	12	175517	175528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725211
79	NC_016937	TTTCAT	2	12	177231	177242	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379725214
80	NC_016937	TGTTTT	2	12	182287	182298	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016937	GTTTTA	2	12	186322	186333	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016937	TCCTTG	2	12	191952	191963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379725226
83	NC_016937	AGCTAT	2	12	192879	192890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725227
84	NC_016937	TAAAAG	2	12	196661	196672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379725228
85	NC_016937	AAATAA	2	12	197248	197259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379725229
86	NC_016937	ATTTCC	2	12	200182	200193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016937	TTATGA	2	12	201387	201398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725233
88	NC_016937	ATCAAA	2	12	203912	203923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379725236
89	NC_016937	GTACAG	2	12	204085	204096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379725236
90	NC_016937	TATTGA	2	12	208287	208298	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725239
91	NC_016937	CAAAGT	2	12	208417	208428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725239
92	NC_016937	TAAAGA	2	12	210897	210908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016937	AAATGC	2	12	211770	211781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725242
94	NC_016937	ATAGCT	2	12	212916	212927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725243
95	NC_016937	TTTCAT	2	12	220395	220406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016937	CAGATA	2	12	222470	222481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725247
97	NC_016937	ATCGTA	2	12	222692	222703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725248
98	NC_016937	AAGGTA	2	12	222723	222734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725248
99	NC_016937	ATCGCT	2	12	225088	225099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016937	TATAAA	2	12	225288	225299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016937	TTGTGT	2	12	226437	226448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725251
102	NC_016937	GTTGCT	2	12	230102	230113	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379725254
103	NC_016937	TAGTAT	2	12	230182	230193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725254
104	NC_016937	TCATTA	2	12	230929	230940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379725255
105	NC_016937	GACAAG	2	12	233892	233903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725256
106	NC_016937	GTTTTA	2	12	234588	234599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016937	ACCTTA	2	12	235414	235425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016937	GCCATT	2	12	236080	236091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725257
109	NC_016937	ACTGTT	2	12	237483	237494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379725258
110	NC_016937	AATTAT	2	12	239106	239117	50 %	50 %	0 %	0 %	379725259
111	NC_016937	ATCAAT	2	12	240744	240755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379725261
112	NC_016937	TTTGTC	2	12	246885	246896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379725268
113	NC_016937	AGCTGG	2	12	247416	247427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379725269
114	NC_016937	AGCCAA	2	12	250760	250771	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379725273
115	NC_016937	TTTAAA	2	12	254791	254802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016937	ATAATT	2	12	255003	255014	50 %	50 %	0 %	0 %	379725278
117	NC_016937	ATTGAT	2	12	255266	255277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725278
118	NC_016937	GTTTTA	2	12	259899	259910	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016937	TATCAG	2	12	261190	261201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725282
120	NC_016937	GGTATT	2	12	261456	261467	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725282
121	NC_016937	TTATAA	2	12	271797	271808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016937	TTGAGA	2	12	273279	273290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725289
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237	NC_016937	ATTTTT	2	12	503064	503075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379725489
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