MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis TI0902 chromosome

Total Repeats: 737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016937	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725074
2	NC_016937	TATATC	2	12	12059	12070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379725078
3	NC_016937	CTGCTT	2	12	14915	14926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379725081
4	NC_016937	TACTGA	2	12	15081	15092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725081
5	NC_016937	AGATGG	2	12	17180	17191	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379725083
6	NC_016937	TTATAT	2	12	17525	17536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379725083
7	NC_016937	TCAAGA	2	12	18094	18105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725084
8	NC_016937	GAAGCA	2	12	18321	18332	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725085
9	NC_016937	GAGTAT	2	12	20318	20329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725086
10	NC_016937	CCAGAT	2	12	20456	20467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379725086
11	NC_016937	GTAAAG	2	12	21000	21011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725086
12	NC_016937	CAAATC	2	12	26615	26626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379725091
13	NC_016937	AGCTAA	2	12	28105	28116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725092
14	NC_016937	TACTCG	2	12	31894	31905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725096
15	NC_016937	TGGTGC	2	12	34964	34975	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379725100
16	NC_016937	TGCAAA	2	12	36024	36035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725101
17	NC_016937	ATATTG	2	12	37485	37496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725101
18	NC_016937	TAACAT	2	12	40119	40130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379725104
19	NC_016937	TCAGTC	2	12	40257	40268	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725105
20	NC_016937	TGCAAA	2	12	42290	42301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725106
21	NC_016937	TTGGTA	2	12	43073	43084	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725107
22	NC_016937	TATTGG	2	12	43761	43772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725107
23	NC_016937	TTTTGA	2	12	49141	49152	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725111
24	NC_016937	TGAAGA	2	12	49407	49418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725112
25	NC_016937	GGCAAA	2	12	59140	59151	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725119
26	NC_016937	ATTATG	2	12	59799	59810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725120
27	NC_016937	ATAAAT	2	12	61273	61284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725122
28	NC_016937	AGGCTA	2	12	61521	61532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379725123
29	NC_016937	AGCAAG	2	12	66496	66507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725128
30	NC_016937	GTTAGA	2	12	76228	76239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725137
31	NC_016937	AAAGCT	2	12	77478	77489	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725139
32	NC_016937	TAAAGC	2	12	77678	77689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725139
33	NC_016937	ATTATA	2	12	78847	78858	50 %	50 %	0 %	0 %	379725139
34	NC_016937	AAATGC	2	12	78925	78936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725139
35	NC_016937	AGATAC	2	12	81150	81161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725140
36	NC_016937	GGAGCA	2	12	84276	84287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379725144
37	NC_016937	TGGTGT	2	12	89444	89455	0 %	50 %	50 %	0 %	379725149
38	NC_016937	ATCCGT	2	12	90969	90980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725149
39	NC_016937	TGATGT	2	12	91409	91420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725149
40	NC_016937	AGCTTG	2	12	94366	94377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379725152
41	NC_016937	GTTGAG	2	12	99953	99964	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379725155
42	NC_016937	AAAAAC	2	12	100170	100181	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379725155
43	NC_016937	GCAAAT	2	12	109760	109771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725161
44	NC_016937	CAAATA	2	12	110271	110282	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379725161
45	NC_016937	CAACAT	2	12	111384	111395	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379725161
46	NC_016937	CAATAG	2	12	113495	113506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725162
47	NC_016937	TAAATA	2	12	114182	114193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725163
48	NC_016937	TGCAGC	2	12	116395	116406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379725165
49	NC_016937	TTATAG	2	12	117860	117871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725166
50	NC_016937	AGATAA	2	12	117882	117893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379725166
51	NC_016937	GAAAGT	2	12	119489	119500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725167
52	NC_016937	CTGGTA	2	12	119677	119688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379725167
53	NC_016937	GCAAAT	2	12	127918	127929	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725174
54	NC_016937	TAGGTG	2	12	130831	130842	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379725176
55	NC_016937	TTAATA	2	12	142561	142572	50 %	50 %	0 %	0 %	379725184
56	NC_016937	ACTTTG	2	12	144860	144871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379725185
57	NC_016937	ATTGTT	2	12	147441	147452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725187
58	NC_016937	AGCAAC	2	12	148434	148445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379725189
59	NC_016937	TAGATC	2	12	149397	149408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725189
60	NC_016937	GCTGTT	2	12	154521	154532	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379725196
61	NC_016937	AGAAAA	2	12	155538	155549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379725197
62	NC_016937	TTGATT	2	12	155806	155817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725197
63	NC_016937	GGTAAA	2	12	156261	156272	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725197
64	NC_016937	TATATG	2	12	158661	158672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725197
65	NC_016937	GTTGAG	2	12	159340	159351	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379725198
66	NC_016937	TGCCTA	2	12	169508	169519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725205
67	NC_016937	TGATTT	2	12	172542	172553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725210
68	NC_016937	ATTAAA	2	12	175517	175528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725211
69	NC_016937	TTTCAT	2	12	177231	177242	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379725214
70	NC_016937	TCCTTG	2	12	191952	191963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379725226
71	NC_016937	AGCTAT	2	12	192879	192890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725227
72	NC_016937	TAAAAG	2	12	196661	196672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379725228
73	NC_016937	AAATAA	2	12	197248	197259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379725229
74	NC_016937	TTATGA	2	12	201387	201398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725233
75	NC_016937	ATCAAA	2	12	203912	203923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379725236
76	NC_016937	GTACAG	2	12	204085	204096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379725236
77	NC_016937	TATTGA	2	12	208287	208298	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725239
78	NC_016937	CAAAGT	2	12	208417	208428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725239
79	NC_016937	AAATGC	2	12	211770	211781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725242
80	NC_016937	ATAGCT	2	12	212916	212927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725243
81	NC_016937	CAGATA	2	12	222470	222481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379725247
82	NC_016937	ATCGTA	2	12	222692	222703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725248
83	NC_016937	AAGGTA	2	12	222723	222734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725248
84	NC_016937	TTGTGT	2	12	226437	226448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379725251
85	NC_016937	GTTGCT	2	12	230102	230113	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379725254
86	NC_016937	TAGTAT	2	12	230182	230193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725254
87	NC_016937	TCATTA	2	12	230929	230940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379725255
88	NC_016937	GACAAG	2	12	233892	233903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379725256
89	NC_016937	GCCATT	2	12	236080	236091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725257
90	NC_016937	ACTGTT	2	12	237483	237494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379725258
91	NC_016937	AATTAT	2	12	239106	239117	50 %	50 %	0 %	0 %	379725259
92	NC_016937	ATCAAT	2	12	240744	240755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379725261
93	NC_016937	TTTGTC	2	12	246885	246896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379725268
94	NC_016937	AGCTGG	2	12	247416	247427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379725269
95	NC_016937	AGCCAA	2	12	250760	250771	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379725273
96	NC_016937	ATAATT	2	12	255003	255014	50 %	50 %	0 %	0 %	379725278
97	NC_016937	ATTGAT	2	12	255266	255277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725278
98	NC_016937	TATCAG	2	12	261190	261201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725282
99	NC_016937	GGTATT	2	12	261456	261467	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379725282
100	NC_016937	TTGAGA	2	12	273279	273290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725289
101	NC_016937	TTAGGC	2	12	274136	274147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379725289
102	NC_016937	TATTTT	2	12	277375	277386	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379725293
103	NC_016937	TAAGTA	2	12	278299	278310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379725295
104	NC_016937	AAATAT	2	12	284761	284772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379725300
105	NC_016937	ACAGGT	2	12	286929	286940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379725303
106	NC_016937	ACTTTT	2	12	287272	287283	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379725304
107	NC_016937	CAAATT	2	12	293277	293288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379725306
108	NC_016937	TTTTAT	2	12	293962	293973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379725307
109	NC_016937	TTAAGT	2	12	294703	294714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725307
110	NC_016937	ATTATA	2	12	299975	299986	50 %	50 %	0 %	0 %	379725312
111	NC_016937	GCTTTA	2	12	300122	300133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379725312
112	NC_016937	CACCAA	2	12	301742	301753	50 %	0 %	0 %	50 %	379725314
113	NC_016937	ACTAGT	2	12	309103	309114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725321
114	NC_016937	AAGATG	2	12	313640	313651	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379725325
115	NC_016937	TACTGC	2	12	314256	314267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379725325
116	NC_016937	TTTAGC	2	12	314454	314465	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379725325
117	NC_016937	ATTAGT	2	12	315057	315068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379725325
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230	NC_016937	AGCTAC	2	12	574613	574624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379725544
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232	NC_016937	TACGAT	2	12	576479	576490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725547
233	NC_016937	CAACGT	2	12	580000	580011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379725549
234	NC_016937	GCATTA	2	12	580989	581000	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379725550
235	NC_016937	TACATT	2	12	582174	582185	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379725551
236	NC_016937	TTTTGA	2	12	585906	585917	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725553
237	NC_016937	TTGATT	2	12	595148	595159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725561
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239	NC_016937	AGTTAG	2	12	598463	598474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379725564
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260	NC_016937	GATTTT	2	12	665426	665437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379725620
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343	NC_016937	TAAAAC	2	12	881674	881685	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379725821
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453	NC_016937	CTTTTA	2	12	1144803	1144814	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379726050
454	NC_016937	ATAAAA	2	12	1147032	1147043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379726052
455	NC_016937	CATTCA	2	12	1155166	1155177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379726057
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