MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis TI0902 chromosome

Total Repeats: 1488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016937	AAGAA	2	10	1226	1235	80 %	0 %	20 %	0 %	379725074
2	NC_016937	CATCT	2	10	3558	3567	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016937	TTCTT	2	10	3630	3639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016937	AATCA	2	10	4491	4500	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016937	ATGGT	2	10	4525	4534	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016937	ATTAA	2	10	4677	4686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016937	TTTGC	2	10	4784	4793	0 %	60 %	20 %	20 %	379725076
8	NC_016937	CGTAC	2	10	4928	4937	20 %	20 %	20 %	40 %	379725076
9	NC_016937	TTCAA	2	10	5299	5308	40 %	40 %	0 %	20 %	379725076
10	NC_016937	TTGCG	2	10	5387	5396	0 %	40 %	40 %	20 %	379725076
11	NC_016937	TAGCT	2	10	5952	5961	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016937	ATGCA	2	10	7434	7443	40 %	20 %	20 %	20 %	379725077
13	NC_016937	AAAGA	2	10	8714	8723	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016937	TTTCT	2	10	11665	11674	0 %	80 %	0 %	20 %	379725078
15	NC_016937	AAATA	2	10	11753	11762	80 %	20 %	0 %	0 %	379725078
16	NC_016937	ACAGT	2	10	13726	13735	40 %	20 %	20 %	20 %	379725080
17	NC_016937	CTTTT	2	10	14515	14524	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016937	TAATG	2	10	14631	14640	40 %	40 %	20 %	0 %	379725081
19	NC_016937	TAGGT	2	10	16944	16953	20 %	40 %	40 %	0 %	379725083
20	NC_016937	TTTGA	2	10	17942	17951	20 %	60 %	20 %	0 %	379725084
21	NC_016937	TAGAT	2	10	18218	18227	40 %	40 %	20 %	0 %	379725085
22	NC_016937	GATTA	2	10	20058	20067	40 %	40 %	20 %	0 %	379725086
23	NC_016937	GATGT	2	10	20214	20223	20 %	40 %	40 %	0 %	379725086
24	NC_016937	GATTT	2	10	21889	21898	20 %	60 %	20 %	0 %	379725088
25	NC_016937	ATTTT	2	10	22322	22331	20 %	80 %	0 %	0 %	379725088
26	NC_016937	ATTAA	2	10	24609	24618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016937	GTATG	2	10	26138	26147	20 %	40 %	40 %	0 %	379725091
28	NC_016937	GCTAA	2	10	27347	27356	40 %	20 %	20 %	20 %	379725092
29	NC_016937	ATTCT	2	10	30018	30027	20 %	60 %	0 %	20 %	379725093
30	NC_016937	GTTTT	2	10	30263	30272	0 %	80 %	20 %	0 %	379725093
31	NC_016937	CAAGG	2	10	33271	33280	40 %	0 %	40 %	20 %	379725098
32	NC_016937	ACCAA	2	10	35827	35836	60 %	0 %	0 %	40 %	379725101
33	NC_016937	TACAG	2	10	39249	39258	40 %	20 %	20 %	20 %	379725103
34	NC_016937	ATTTT	2	10	39662	39671	20 %	80 %	0 %	0 %	379725104
35	NC_016937	ATTTT	2	10	40086	40095	20 %	80 %	0 %	0 %	379725104
36	NC_016937	TATTC	2	10	43231	43240	20 %	60 %	0 %	20 %	379725107
37	NC_016937	TAGTT	2	10	44586	44595	20 %	60 %	20 %	0 %	379725108
38	NC_016937	AAGCT	2	10	45896	45905	40 %	20 %	20 %	20 %	379725109
39	NC_016937	GATTT	2	10	46157	46166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016937	TTGGT	2	10	46358	46367	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016937	GATAG	2	10	47056	47065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016937	TTAAT	2	10	47459	47468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016937	AAAAT	2	10	49610	49619	80 %	20 %	0 %	0 %	379725112
44	NC_016937	TAATT	2	10	50640	50649	40 %	60 %	0 %	0 %	379725112
45	NC_016937	TGAAA	2	10	52952	52961	60 %	20 %	20 %	0 %	379725113
46	NC_016937	TAAAT	2	10	54452	54461	60 %	40 %	0 %	0 %	379725115
47	NC_016937	CAAAC	2	10	55576	55585	60 %	0 %	0 %	40 %	379725116
48	NC_016937	GCAAA	2	10	56624	56633	60 %	0 %	20 %	20 %	379725117
49	NC_016937	TTTAG	2	10	57531	57540	20 %	60 %	20 %	0 %	379725118
50	NC_016937	AAACA	2	10	58194	58203	80 %	0 %	0 %	20 %	379725118
51	NC_016937	TAAGA	2	10	59184	59193	60 %	20 %	20 %	0 %	379725119
52	NC_016937	AATTT	2	10	59593	59602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016937	AATAA	2	10	60120	60129	80 %	20 %	0 %	0 %	379725121
54	NC_016937	TACTG	2	10	62619	62628	20 %	40 %	20 %	20 %	379725125
55	NC_016937	GTGAA	2	10	63298	63307	40 %	20 %	40 %	0 %	379725125
56	NC_016937	GTGCA	2	10	65886	65895	20 %	20 %	40 %	20 %	379725127
57	NC_016937	GCATA	2	10	66309	66318	40 %	20 %	20 %	20 %	379725128
58	NC_016937	ATAAA	2	10	68373	68382	80 %	20 %	0 %	0 %	379725129
59	NC_016937	TATCT	2	10	71994	72003	20 %	60 %	0 %	20 %	379725133
60	NC_016937	AAAAT	2	10	72307	72316	80 %	20 %	0 %	0 %	379725134
61	NC_016937	TCACT	2	10	74236	74245	20 %	40 %	0 %	40 %	379725135
62	NC_016937	TTATC	2	10	74383	74392	20 %	60 %	0 %	20 %	379725136
63	NC_016937	AAGAA	2	10	76066	76075	80 %	0 %	20 %	0 %	379725137
64	NC_016937	ATAGA	2	10	77761	77770	60 %	20 %	20 %	0 %	379725139
65	NC_016937	TAATG	2	10	78008	78017	40 %	40 %	20 %	0 %	379725139
66	NC_016937	ACTCT	2	10	79192	79201	20 %	40 %	0 %	40 %	379725139
67	NC_016937	TAAAT	2	10	80016	80025	60 %	40 %	0 %	0 %	379725139
68	NC_016937	GAACC	2	10	83319	83328	40 %	0 %	20 %	40 %	379725142
69	NC_016937	GTCTT	2	10	84368	84377	0 %	60 %	20 %	20 %	379725144
70	NC_016937	AAACT	2	10	85589	85598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016937	TTTGA	2	10	86265	86274	20 %	60 %	20 %	0 %	379725146
72	NC_016937	GTATT	2	10	87439	87448	20 %	60 %	20 %	0 %	379725147
73	NC_016937	TTTAT	2	10	88703	88712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016937	TAGTA	2	10	89867	89876	40 %	40 %	20 %	0 %	379725149
75	NC_016937	TGATA	2	10	91692	91701	40 %	40 %	20 %	0 %	379725150
76	NC_016937	ATAGA	2	10	91775	91784	60 %	20 %	20 %	0 %	379725150
77	NC_016937	ATTAG	2	10	92329	92338	40 %	40 %	20 %	0 %	379725150
78	NC_016937	GTTTT	2	10	92935	92944	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016937	TATCA	2	10	93784	93793	40 %	40 %	0 %	20 %	379725151
80	NC_016937	AATGT	2	10	96742	96751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016937	AATAT	2	10	96771	96780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016937	TTAAC	2	10	97467	97476	40 %	40 %	0 %	20 %	379725153
83	NC_016937	GTCAA	2	10	97609	97618	40 %	20 %	20 %	20 %	379725153
84	NC_016937	CAGAT	2	10	100510	100519	40 %	20 %	20 %	20 %	379725156
85	NC_016937	CATCT	2	10	102587	102596	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016937	TTCTT	2	10	102659	102668	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016937	TTTCT	2	10	103751	103760	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016937	ATTTA	2	10	104855	104864	40 %	60 %	0 %	0 %	379725158
89	NC_016937	CATAT	2	10	105101	105110	40 %	40 %	0 %	20 %	379725158
90	NC_016937	CATTT	2	10	105257	105266	20 %	60 %	0 %	20 %	379725158
91	NC_016937	ACAAT	2	10	105458	105467	60 %	20 %	0 %	20 %	379725158
92	NC_016937	TTGAT	2	10	105659	105668	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016937	AAACT	2	10	108595	108604	60 %	20 %	0 %	20 %	379725160
94	NC_016937	TTCAT	2	10	110027	110036	20 %	60 %	0 %	20 %	379725161
95	NC_016937	AGCAC	2	10	110927	110936	40 %	0 %	20 %	40 %	379725161
96	NC_016937	CTCTA	2	10	111553	111562	20 %	40 %	0 %	40 %	379725161
97	NC_016937	AAACT	2	10	111699	111708	60 %	20 %	0 %	20 %	379725161
98	NC_016937	TTTTC	2	10	115139	115148	0 %	80 %	0 %	20 %	379725164
99	NC_016937	GTTTG	2	10	115172	115181	0 %	60 %	40 %	0 %	379725164
100	NC_016937	TAAAA	2	10	117372	117381	80 %	20 %	0 %	0 %	379725166
101	NC_016937	CAAGC	2	10	119203	119212	40 %	0 %	20 %	40 %	379725167
102	NC_016937	GCTTT	2	10	119302	119311	0 %	60 %	20 %	20 %	379725167
103	NC_016937	CAAAA	2	10	122712	122721	80 %	0 %	0 %	20 %	379725169
104	NC_016937	TTTTA	2	10	124980	124989	20 %	80 %	0 %	0 %	379725171
105	NC_016937	TGTAT	2	10	125511	125520	20 %	60 %	20 %	0 %	379725172
106	NC_016937	TGCAA	2	10	125979	125988	40 %	20 %	20 %	20 %	379725172
107	NC_016937	GTATT	2	10	130783	130792	20 %	60 %	20 %	0 %	379725176
108	NC_016937	GTATG	2	10	135004	135013	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016937	GGTGT	2	10	136246	136255	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016937	ATTAC	2	10	140022	140031	40 %	40 %	0 %	20 %	379725182
111	NC_016937	CTGGT	2	10	142369	142378	0 %	40 %	40 %	20 %	379725184
112	NC_016937	CATCT	2	10	143939	143948	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016937	TTCTT	2	10	144011	144020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016937	ATCTT	2	10	144942	144951	20 %	60 %	0 %	20 %	379725185
115	NC_016937	CTTAT	2	10	146269	146278	20 %	60 %	0 %	20 %	379725186
116	NC_016937	CTAGT	2	10	147840	147849	20 %	40 %	20 %	20 %	379725188
117	NC_016937	AAATC	2	10	148272	148281	60 %	20 %	0 %	20 %	379725189
118	NC_016937	GGTAA	2	10	153489	153498	40 %	20 %	40 %	0 %	379725194
119	NC_016937	AATGA	2	10	153934	153943	60 %	20 %	20 %	0 %	379725195
120	NC_016937	TTCCT	2	10	156952	156961	0 %	60 %	0 %	40 %	379725197
121	NC_016937	CTAAG	2	10	160220	160229	40 %	20 %	20 %	20 %	379725198
122	NC_016937	TACAT	2	10	160353	160362	40 %	40 %	0 %	20 %	379725198
123	NC_016937	CTATA	2	10	160600	160609	40 %	40 %	0 %	20 %	379725198
124	NC_016937	GTGAT	2	10	162107	162116	20 %	40 %	40 %	0 %	379725198
125	NC_016937	ATGGT	2	10	162518	162527	20 %	40 %	40 %	0 %	379725198
126	NC_016937	TTTAT	2	10	168746	168755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016937	ACTAC	2	10	168948	168957	40 %	20 %	0 %	40 %	379725205
128	NC_016937	TGCTA	2	10	169261	169270	20 %	40 %	20 %	20 %	379725205
129	NC_016937	AGAGA	2	10	169848	169857	60 %	0 %	40 %	0 %	379725206
130	NC_016937	AGCTA	2	10	170376	170385	40 %	20 %	20 %	20 %	379725207
131	NC_016937	TAAAA	2	10	173764	173773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016937	AGCTA	2	10	174600	174609	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016937	AGTAA	2	10	174790	174799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016937	GCATG	2	10	176671	176680	20 %	20 %	40 %	20 %	379725213
135	NC_016937	TACCT	2	10	177187	177196	20 %	40 %	0 %	40 %	379725214
136	NC_016937	GATGA	2	10	178756	178765	40 %	20 %	40 %	0 %	379725214
137	NC_016937	CAAAA	2	10	179487	179496	80 %	0 %	0 %	20 %	379725215
138	NC_016937	GTAAT	2	10	180955	180964	40 %	40 %	20 %	0 %	379725216
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262	NC_016937	ATCCT	2	10	350241	350250	20 %	40 %	0 %	40 %	379725374
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264	NC_016937	AAAGA	2	10	351463	351472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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