MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin plasmid unnamed

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016936	GACAA	2	10	1102	1111	60 %	0 %	20 %	20 %	379732331
2	NC_016936	ATTTT	2	10	1536	1545	20 %	80 %	0 %	0 %	379732332
3	NC_016936	CCCGC	2	10	2607	2616	0 %	0 %	20 %	80 %	379732333
4	NC_016936	CTTCT	2	10	2726	2735	0 %	60 %	0 %	40 %	379732333
5	NC_016936	CTTTT	2	10	3128	3137	0 %	80 %	0 %	20 %	379732333
6	NC_016936	ATCCC	2	10	3920	3929	20 %	20 %	0 %	60 %	379732334
7	NC_016936	CCCTA	2	10	11375	11384	20 %	20 %	0 %	60 %	379732339
8	NC_016936	CAACC	2	10	12348	12357	40 %	0 %	0 %	60 %	379732339
9	NC_016936	ATCGC	2	10	14274	14283	20 %	20 %	20 %	40 %	379732342
10	NC_016936	GCCCA	2	10	17543	17552	20 %	0 %	20 %	60 %	379732346
11	NC_016936	AATTT	2	10	19206	19215	40 %	60 %	0 %	0 %	379732348
12	NC_016936	AATTT	2	10	20180	20189	40 %	60 %	0 %	0 %	379732348
13	NC_016936	AGCCC	2	10	21279	21288	20 %	0 %	20 %	60 %	379732350
14	NC_016936	TTTTC	2	10	21529	21538	0 %	80 %	0 %	20 %	379732350
15	NC_016936	CAAAA	2	10	22344	22353	80 %	0 %	0 %	20 %	379732351
16	NC_016936	AACTC	2	10	23993	24002	40 %	20 %	0 %	40 %	379732352
17	NC_016936	GCCCC	2	10	27368	27377	0 %	0 %	20 %	80 %	379732356
18	NC_016936	TATGG	2	10	33276	33285	20 %	40 %	40 %	0 %	379732361
19	NC_016936	GCAGA	2	10	35042	35051	40 %	0 %	40 %	20 %	379732363
20	NC_016936	TCGCT	2	10	37199	37208	0 %	40 %	20 %	40 %	379732366
21	NC_016936	GCTAC	2	10	37216	37225	20 %	20 %	20 %	40 %	379732366
22	NC_016936	AGGCC	2	10	37306	37315	20 %	0 %	40 %	40 %	379732366
23	NC_016936	TTGGT	2	10	38309	38318	0 %	60 %	40 %	0 %	379732368
24	NC_016936	TCTAG	2	10	41156	41165	20 %	40 %	20 %	20 %	379732371
25	NC_016936	CTGTT	2	10	42741	42750	0 %	60 %	20 %	20 %	379732372
26	NC_016936	ATATG	2	10	49027	49036	40 %	40 %	20 %	0 %	379732380

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.