MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Saprospira grandis str. Lewin plasmid unnamed

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016936	TTAA	2	8	248	255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016936	TAAA	2	8	281	288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016936	CAAT	2	8	885	892	50 %	25 %	0 %	25 %	379732331
4	NC_016936	TTTG	2	8	1470	1477	0 %	75 %	25 %	0 %	379732331
5	NC_016936	TATC	2	8	1726	1733	25 %	50 %	0 %	25 %	379732332
6	NC_016936	GAAA	2	8	1859	1866	75 %	0 %	25 %	0 %	379732332
7	NC_016936	TTGT	2	8	1975	1982	0 %	75 %	25 %	0 %	379732332
8	NC_016936	TATT	2	8	2072	2079	25 %	75 %	0 %	0 %	379732333
9	NC_016936	GCCA	2	8	2747	2754	25 %	0 %	25 %	50 %	379732333
10	NC_016936	CTTT	2	8	3676	3683	0 %	75 %	0 %	25 %	379732334
11	NC_016936	CCCA	2	8	4506	4513	25 %	0 %	0 %	75 %	379732334
12	NC_016936	GCAA	2	8	5133	5140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016936	GCGG	2	8	5325	5332	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016936	TAAA	2	8	5569	5576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016936	GCAG	2	8	5758	5765	25 %	0 %	50 %	25 %	379732335
16	NC_016936	AAAG	2	8	5836	5843	75 %	0 %	25 %	0 %	379732336
17	NC_016936	GCTT	2	8	6627	6634	0 %	50 %	25 %	25 %	379732336
18	NC_016936	ATCA	2	8	7187	7194	50 %	25 %	0 %	25 %	379732337
19	NC_016936	ATCT	2	8	7346	7353	25 %	50 %	0 %	25 %	379732337
20	NC_016936	TGAT	2	8	7518	7525	25 %	50 %	25 %	0 %	379732337
21	NC_016936	GCCC	2	8	7663	7670	0 %	0 %	25 %	75 %	379732337
22	NC_016936	ACCG	2	8	7672	7679	25 %	0 %	25 %	50 %	379732337
23	NC_016936	CATT	2	8	7786	7793	25 %	50 %	0 %	25 %	379732337
24	NC_016936	CCCA	2	8	8077	8084	25 %	0 %	0 %	75 %	379732337
25	NC_016936	CCCA	2	8	9412	9419	25 %	0 %	0 %	75 %	379732337
26	NC_016936	GGCG	2	8	10083	10090	0 %	0 %	75 %	25 %	379732338
27	NC_016936	TTTC	2	8	11233	11240	0 %	75 %	0 %	25 %	379732339
28	NC_016936	TCGA	2	8	11263	11270	25 %	25 %	25 %	25 %	379732339
29	NC_016936	TCAA	2	8	11941	11948	50 %	25 %	0 %	25 %	379732339
30	NC_016936	GCCC	2	8	12204	12211	0 %	0 %	25 %	75 %	379732339
31	NC_016936	TGAT	2	8	13422	13429	25 %	50 %	25 %	0 %	379732341
32	NC_016936	TCAG	2	8	14040	14047	25 %	25 %	25 %	25 %	379732342
33	NC_016936	TGGC	2	8	16039	16046	0 %	25 %	50 %	25 %	379732343
34	NC_016936	TTAT	2	8	16078	16085	25 %	75 %	0 %	0 %	379732343
35	NC_016936	GGCG	2	8	17180	17187	0 %	0 %	75 %	25 %	379732345
36	NC_016936	AATA	2	8	17287	17294	75 %	25 %	0 %	0 %	379732345
37	NC_016936	GTTT	2	8	17921	17928	0 %	75 %	25 %	0 %	379732346
38	NC_016936	GCCA	2	8	18469	18476	25 %	0 %	25 %	50 %	379732346
39	NC_016936	TTAA	2	8	18744	18751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016936	TTAA	2	8	18776	18783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016936	CGGC	2	8	18865	18872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016936	CTTT	2	8	19310	19317	0 %	75 %	0 %	25 %	379732348
43	NC_016936	TTTA	2	8	20273	20280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016936	GATA	2	8	20515	20522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016936	AAGA	2	8	20650	20657	75 %	0 %	25 %	0 %	379732349
46	NC_016936	ATAA	2	8	21351	21358	75 %	25 %	0 %	0 %	379732350
47	NC_016936	TGGC	2	8	21667	21674	0 %	25 %	50 %	25 %	379732350
48	NC_016936	AGGT	2	8	23185	23192	25 %	25 %	50 %	0 %	379732352
49	NC_016936	ATAA	2	8	23413	23420	75 %	25 %	0 %	0 %	379732352
50	NC_016936	AAAT	2	8	23536	23543	75 %	25 %	0 %	0 %	379732352
51	NC_016936	CCAA	2	8	23642	23649	50 %	0 %	0 %	50 %	379732352
52	NC_016936	AAAG	2	8	23668	23675	75 %	0 %	25 %	0 %	379732352
53	NC_016936	ACAA	2	8	26200	26207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016936	CTTC	2	8	26957	26964	0 %	50 %	0 %	50 %	379732356
55	NC_016936	TCCT	2	8	27070	27077	0 %	50 %	0 %	50 %	379732356
56	NC_016936	TTTA	2	8	28830	28837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016936	TTAA	2	8	28863	28870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016936	CAAA	2	8	29047	29054	75 %	0 %	0 %	25 %	379732357
59	NC_016936	TATT	2	8	29253	29260	25 %	75 %	0 %	0 %	379732358
60	NC_016936	CTGC	2	8	30064	30071	0 %	25 %	25 %	50 %	379732358
61	NC_016936	TGGC	2	8	30373	30380	0 %	25 %	50 %	25 %	379732358
62	NC_016936	GCTT	2	8	30478	30485	0 %	50 %	25 %	25 %	379732358
63	NC_016936	TGTT	2	8	30561	30568	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016936	CGAG	2	8	30969	30976	25 %	0 %	50 %	25 %	379732360
65	NC_016936	TAGC	2	8	31283	31290	25 %	25 %	25 %	25 %	379732360
66	NC_016936	AAAT	2	8	31441	31448	75 %	25 %	0 %	0 %	379732360
67	NC_016936	TCAA	2	8	31521	31528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016936	AAAC	2	8	31532	31539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016936	TCTT	2	8	31593	31600	0 %	75 %	0 %	25 %	379732361
70	NC_016936	GCCA	2	8	31605	31612	25 %	0 %	25 %	50 %	379732361
71	NC_016936	TCAA	2	8	32875	32882	50 %	25 %	0 %	25 %	379732361
72	NC_016936	ACCA	2	8	34558	34565	50 %	0 %	0 %	50 %	379732362
73	NC_016936	TCAA	2	8	34994	35001	50 %	25 %	0 %	25 %	379732363
74	NC_016936	CCCA	2	8	35336	35343	25 %	0 %	0 %	75 %	379732363
75	NC_016936	TGGT	2	8	35372	35379	0 %	50 %	50 %	0 %	379732363
76	NC_016936	TTTA	2	8	37372	37379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016936	GACC	2	8	38106	38113	25 %	0 %	25 %	50 %	379732368
78	NC_016936	AAGG	2	8	38626	38633	50 %	0 %	50 %	0 %	379732368
79	NC_016936	ACTG	2	8	39214	39221	25 %	25 %	25 %	25 %	379732369
80	NC_016936	GCCC	2	8	39263	39270	0 %	0 %	25 %	75 %	379732369
81	NC_016936	GGAT	2	8	40314	40321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016936	GGCG	2	8	40783	40790	0 %	0 %	75 %	25 %	379732371
83	NC_016936	TGGC	2	8	40806	40813	0 %	25 %	50 %	25 %	379732371
84	NC_016936	CAAG	2	8	41107	41114	50 %	0 %	25 %	25 %	379732371
85	NC_016936	GCGG	2	8	41182	41189	0 %	0 %	75 %	25 %	379732371
86	NC_016936	GCTC	2	8	41821	41828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016936	TTAA	2	8	41900	41907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016936	GCAA	2	8	42998	43005	50 %	0 %	25 %	25 %	379732372
89	NC_016936	AGCC	2	8	43134	43141	25 %	0 %	25 %	50 %	379732372
90	NC_016936	CCAG	2	8	43168	43175	25 %	0 %	25 %	50 %	379732372
91	NC_016936	AAAG	2	8	43345	43352	75 %	0 %	25 %	0 %	379732372
92	NC_016936	AGCT	2	8	44410	44417	25 %	25 %	25 %	25 %	379732373
93	NC_016936	GATG	2	8	44782	44789	25 %	25 %	50 %	0 %	379732373
94	NC_016936	AGCG	2	8	44901	44908	25 %	0 %	50 %	25 %	379732373
95	NC_016936	GATG	2	8	45301	45308	25 %	25 %	50 %	0 %	379732374
96	NC_016936	AAAT	2	8	45593	45600	75 %	25 %	0 %	0 %	379732374
97	NC_016936	GCTT	2	8	45754	45761	0 %	50 %	25 %	25 %	379732375
98	NC_016936	CTGC	2	8	45801	45808	0 %	25 %	25 %	50 %	379732375
99	NC_016936	TCAT	2	8	45884	45891	25 %	50 %	0 %	25 %	379732375
100	NC_016936	AGCT	2	8	46154	46161	25 %	25 %	25 %	25 %	379732376
101	NC_016936	TTAA	2	8	46477	46484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016936	TAAA	2	8	46510	46517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016936	CCCG	2	8	46711	46718	0 %	0 %	25 %	75 %	379732377
104	NC_016936	TTGC	2	8	46788	46795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016936	TTAA	2	8	49356	49363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016936	TAAA	2	8	49389	49396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016936	TTTG	2	8	49455	49462	0 %	75 %	25 %	0 %	379732381
108	NC_016936	AGGC	2	8	49603	49610	25 %	0 %	50 %	25 %	379732381
109	NC_016936	TGCG	2	8	49620	49627	0 %	25 %	50 %	25 %	379732381
110	NC_016936	CAGC	2	8	49879	49886	25 %	0 %	25 %	50 %	379732381
111	NC_016936	TAAA	2	8	50495	50502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016936	CCCG	2	8	50735	50742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_016936	TCGA	2	8	50923	50930	25 %	25 %	25 %	25 %	379732383
114	NC_016936	GGGC	2	8	51179	51186	0 %	0 %	75 %	25 %	379732383
115	NC_016936	CAAC	2	8	51189	51196	50 %	0 %	0 %	50 %	379732383
116	NC_016936	CCTT	2	8	51519	51526	0 %	50 %	0 %	50 %	379732383
117	NC_016936	TTTG	2	8	51907	51914	0 %	75 %	25 %	0 %	379732384
118	NC_016936	TTGA	2	8	51923	51930	25 %	50 %	25 %	0 %	379732384
119	NC_016936	GGGC	2	8	52824	52831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016936	GTTT	2	8	52989	52996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016936	GGGC	2	8	53601	53608	0 %	0 %	75 %	25 %	379732386
122	NC_016936	GTTT	2	8	53766	53773	0 %	75 %	25 %	0 %	379732386
123	NC_016936	GCCA	2	8	53941	53948	25 %	0 %	25 %	50 %	379732386
124	NC_016936	GGTT	2	8	54222	54229	0 %	50 %	50 %	0 %	379732386

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.