MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin plasmid unnamed

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016936	TTAA	2	8	248	255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016936	TAAA	2	8	281	288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016936	GCAA	2	8	5133	5140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016936	GCGG	2	8	5325	5332	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016936	TAAA	2	8	5569	5576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016936	TTAA	2	8	18744	18751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016936	TTAA	2	8	18776	18783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016936	CGGC	2	8	18865	18872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016936	TTTA	2	8	20273	20280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016936	GATA	2	8	20515	20522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016936	ACAA	2	8	26200	26207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016936	TTTA	2	8	28830	28837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016936	TTAA	2	8	28863	28870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016936	TGTT	2	8	30561	30568	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016936	TCAA	2	8	31521	31528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016936	AAAC	2	8	31532	31539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016936	TTTA	2	8	37372	37379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016936	GGAT	2	8	40314	40321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016936	GCTC	2	8	41821	41828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016936	TTAA	2	8	41900	41907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016936	TTAA	2	8	46477	46484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016936	TAAA	2	8	46510	46517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016936	TTGC	2	8	46788	46795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016936	TTAA	2	8	49356	49363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016936	TAAA	2	8	49389	49396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016936	TAAA	2	8	50495	50502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016936	CCCG	2	8	50735	50742	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_016936	GGGC	2	8	52824	52831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016936	GTTT	2	8	52989	52996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.