MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis UT205

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016934	GCCCTT	2	12	31086	31097	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016934	ACCGCG	2	12	31188	31199	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016934	CGTCGG	2	12	66838	66849	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016934	CAACGG	2	12	76360	76371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016934	TCACCT	2	12	80526	80537	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016934	GCGGTG	2	12	104843	104854	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016934	CTCGGT	2	12	149475	149486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016934	GCCGCG	2	12	181031	181042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016934	ACAGCC	2	12	218579	218590	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016934	CCCCGA	2	12	293731	293742	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016934	AGATTC	2	12	330463	330474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016934	TGCCGC	2	12	336359	336370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016934	TGCCGC	2	12	337279	337290	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016934	TGCCGC	2	12	340043	340054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016934	GGTCGC	2	12	343075	343086	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016934	TGCCGA	2	12	401810	401821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016934	CCGATA	2	12	477720	477731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016934	GGCATC	2	12	484670	484681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016934	ATAGTC	2	12	544286	544297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016934	ACCAGT	2	12	592289	592300	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016934	CGGGTG	2	12	624351	624362	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016934	CGGCAG	2	12	625431	625442	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016934	ACGGCG	2	12	625604	625615	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016934	CCGCGC	2	12	675150	675161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016934	GCCCCG	2	12	676727	676738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016934	CGCCGT	2	12	721337	721348	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016934	CGCGGG	2	12	831766	831777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016934	CGCGGG	2	12	835167	835178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016934	CTCCGG	2	12	842491	842502	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016934	CCGGCG	2	12	865220	865231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016934	ACCGGG	2	12	871941	871952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016934	GCGGCC	2	12	910189	910200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016934	ACAGCA	2	12	911562	911573	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016934	CTGGGT	2	12	926402	926413	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016934	GGCCGC	2	12	927132	927143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016934	GATGCC	2	12	930297	930308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016934	CGCCAC	2	12	930332	930343	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016934	GCGCCG	2	12	930439	930450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016934	ATGGCG	2	12	930622	930633	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016934	CAGTCG	2	12	934238	934249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016934	TCGGGT	2	12	967992	968003	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016934	CGCGGC	2	12	1013225	1013236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016934	TCACGT	2	12	1014034	1014045	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016934	CAACGG	2	12	1031779	1031790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016934	GATCGA	2	12	1031830	1031841	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016934	GACTGC	2	12	1036234	1036245	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016934	CGCCGG	2	12	1055098	1055109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016934	CTACAA	2	12	1094950	1094961	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016934	GCTCAC	2	12	1097015	1097026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016934	GGTGTT	2	12	1097775	1097786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016934	CAATGC	2	12	1126171	1126182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016934	TTGGTG	2	12	1154294	1154305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016934	TTCCGT	2	12	1164983	1164994	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016934	CGGCCG	2	12	1194567	1194578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016934	TAGCCA	2	12	1198770	1198781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016934	CCGGTG	2	12	1216275	1216286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016934	GGTCGC	2	12	1219067	1219078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016934	TGGGCG	2	12	1220968	1220979	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016934	AGTTAC	2	12	1224609	1224620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016934	CGAAGT	2	12	1283349	1283360	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016934	AGGACG	2	12	1285601	1285612	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016934	TCGACA	2	12	1371410	1371421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016934	GCGGCC	2	12	1389296	1389307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016934	CCGAGT	2	12	1422487	1422498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016934	TCGCGC	2	12	1484282	1484293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016934	CACGCG	2	12	1529326	1529337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016934	GGGCGC	2	12	1533002	1533013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016934	GCGGCC	2	12	1534015	1534026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016934	ATATTC	2	12	1564354	1564365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016934	GCCACC	2	12	1621545	1621556	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016934	CGCCGG	2	12	1628020	1628031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016934	GCCCCT	2	12	1637609	1637620	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016934	GCCCCT	2	12	1641310	1641321	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016934	GCGGTG	2	12	1792541	1792552	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016934	CGAGTG	2	12	1793269	1793280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016934	GGCGCC	2	12	1839494	1839505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016934	CCGCGG	2	12	1903276	1903287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016934	TAGCGG	2	12	1930381	1930392	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016934	ACCGCA	2	12	1932318	1932329	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016934	CGCCGA	2	12	1985624	1985635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016934	CCGATG	2	12	1987033	1987044	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016934	CTGCGG	2	12	1987352	1987363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016934	GCTGCC	2	12	1987729	1987740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016934	GCTGGG	2	12	1989225	1989236	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016934	GGTGAT	2	12	2045004	2045015	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016934	GCCGTC	2	12	2056667	2056678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016934	TTCGGC	2	12	2058913	2058924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016934	GCGCCG	2	12	2064781	2064792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016934	AGAGGG	2	12	2079094	2079105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016934	GCCGCA	2	12	2092662	2092673	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016934	ACCGTG	2	12	2145546	2145557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016934	GCTGGG	2	12	2148177	2148188	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016934	CGCGAG	2	12	2179760	2179771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016934	GCCGAA	2	12	2199529	2199540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016934	GACCGC	2	12	2199591	2199602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016934	TGCTTG	2	12	2203149	2203160	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016934	CGGTTG	2	12	2234305	2234316	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016934	GCCGCA	2	12	2237210	2237221	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016934	CGGCTC	2	12	2262873	2262884	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016934	GGTTTC	2	12	2299344	2299355	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016934	CGATTT	2	12	2299761	2299772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016934	GTCGGG	2	12	2304755	2304766	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016934	CGATCG	2	12	2304898	2304909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016934	GTGAAA	2	12	2305030	2305041	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016934	CACCGC	2	12	2305322	2305333	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016934	CGATCG	2	12	2310964	2310975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016934	CCCTGA	2	12	2325468	2325479	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016934	TGCACT	2	12	2342679	2342690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016934	ATAGAA	2	12	2371099	2371110	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016934	CTCAAC	2	12	2413807	2413818	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016934	CCGCTG	2	12	2435768	2435779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016934	CACCGC	2	12	2444225	2444236	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016934	GCGTCG	2	12	2498057	2498068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016934	CACGAC	2	12	2516227	2516238	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016934	GCAACC	2	12	2636532	2636543	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016934	CATCGG	2	12	2637466	2637477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016934	TACCGG	2	12	2639352	2639363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016934	GCCGGC	2	12	2639632	2639643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016934	TGCCGG	2	12	2639751	2639762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016934	CCGAAA	2	12	2639894	2639905	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016934	AGGTTG	2	12	2640113	2640124	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016934	CCGAAA	2	12	2643042	2643053	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016934	CACGTG	2	12	2720113	2720124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016934	GAGGTC	2	12	2723725	2723736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016934	CCGGCA	2	12	2737755	2737766	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016934	CGCCAC	2	12	2795944	2795955	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016934	TCAAAC	2	12	2797697	2797708	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016934	TGCCGT	2	12	2804973	2804984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016934	GGCCCC	2	12	2807776	2807787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016934	CGAGGG	2	12	2807946	2807957	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016934	GGCGCC	2	12	2808994	2809005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016934	GCACCC	2	12	2827125	2827136	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016934	CGACGG	2	12	2875406	2875417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016934	GCCCGA	2	12	2882501	2882512	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016934	CCGCTG	2	12	2894861	2894872	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016934	GTATTG	2	12	2921036	2921047	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_016934	CGGAAG	2	12	2958327	2958338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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143	NC_016934	ACGGCG	2	12	3060262	3060273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_016934	CGTTGC	2	12	3105197	3105208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_016934	GGCCGC	2	12	3167521	3167532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016934	CATCAC	2	12	3189964	3189975	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_016934	TCGCCG	2	12	3296614	3296625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016934	CGCCAC	2	12	3312635	3312646	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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155	NC_016934	AATGGG	2	12	3382972	3382983	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_016934	CGTGAC	2	12	3398276	3398287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_016934	CGATGC	2	12	3420464	3420475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_016934	TGTACA	2	12	3435777	3435788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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162	NC_016934	GCTCCT	2	12	3496008	3496019	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.