MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis TIGB03 chromosome

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016933	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016933	GTTTTA	2	12	8679	8690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016933	ATGATA	2	12	24619	24630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016933	ATGATA	2	12	30309	30320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016933	TCCATG	2	12	46956	46967	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016933	TTTATA	2	12	85264	85275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016933	TAGTGC	2	12	135518	135529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016933	ATTTTT	2	12	136176	136187	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016933	TCCACA	2	12	164744	164755	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016933	ATAAAC	2	12	173971	173982	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016933	TGTTTT	2	12	182287	182298	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016933	GTTTTA	2	12	186322	186333	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016933	ATTTCC	2	12	200182	200193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016933	TAAAGA	2	12	210897	210908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016933	TTTCAT	2	12	220395	220406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016933	ATCGCT	2	12	225088	225099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016933	TATAAA	2	12	225288	225299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016933	GTTTTA	2	12	234588	234599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016933	ACCTTA	2	12	235414	235425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016933	TTTAAA	2	12	254791	254802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016933	GTTTTA	2	12	259899	259910	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016933	TTATAA	2	12	271797	271808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016933	ATAAAT	2	12	278713	278724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016933	GTTTTA	2	12	287897	287908	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016933	ATTTTT	2	12	319314	319325	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016933	TTTTGT	2	12	319831	319842	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016933	GTTTTA	2	12	351428	351439	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016933	CGGTGC	2	12	358194	358205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016933	TGGGCT	2	12	359307	359318	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016933	GTTTTA	2	12	363804	363815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016933	ATTTTT	2	12	395221	395232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016933	TTTTGT	2	12	395738	395749	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016933	GTTTTA	2	12	427335	427346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016933	CGGTGC	2	12	434101	434112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016933	TGGGCT	2	12	435214	435225	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016933	GTTTTA	2	12	439711	439722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016933	TAAGTT	2	12	440883	440894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016933	GTTTTA	2	12	455103	455114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016933	TAAAAT	2	12	460878	460889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016933	ATTTTT	2	12	461457	461468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016933	AAGTTA	2	12	480409	480420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016933	AAATAT	2	12	516980	516991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016933	AAAAGT	2	12	523624	523635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016933	TAGAAT	2	12	536623	536634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016933	TTTAAT	2	12	536682	536693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016933	AAAATC	2	12	577067	577078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016933	ACAAGC	2	12	592830	592841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016933	AAAAAT	2	12	594869	594880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016933	ATTAGA	2	12	612722	612733	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016933	TAGCTA	2	12	616826	616837	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016933	ACAGCC	2	12	625128	625139	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016933	ATTTAG	2	12	627801	627812	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016933	GATATT	2	12	628349	628360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016933	TATAAT	2	12	633702	633713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016933	GTTTTA	2	12	654619	654630	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016933	AGTTAT	2	12	655360	655371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016933	TATTTT	2	12	668206	668217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016933	GATTTA	2	12	668933	668944	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016933	TTTGAT	2	12	676936	676947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016933	TAAATA	2	12	687085	687096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016933	CTTATA	2	12	687105	687116	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016933	GATGTT	2	12	738195	738206	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016933	ATATTT	2	12	738846	738857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016933	GATATA	2	12	746788	746799	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016933	ATTTTT	2	12	746915	746926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016933	TTATAT	2	12	755567	755578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016933	CATTAG	2	12	756608	756619	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016933	TTTACT	2	12	763192	763203	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016933	TTAGTT	2	12	778266	778277	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016933	TTTAAA	2	12	786324	786335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016933	AAATAA	2	12	800533	800544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016933	GCTTTA	2	12	809873	809884	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016933	CATAAA	2	12	814013	814024	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016933	GTTTTA	2	12	861222	861233	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016933	TTTGAT	2	12	875065	875076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016933	GTTTTA	2	12	875455	875466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016933	TGTATA	2	12	898774	898785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016933	GTTTTA	2	12	915437	915448	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016933	ATTAAT	2	12	940529	940540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016933	TAGTTT	2	12	941847	941858	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016933	TTAGAT	2	12	949762	949773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016933	TATAGC	2	12	952010	952021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016933	ATATTT	2	12	952398	952409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016933	ATTGAT	2	12	967565	967576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016933	TTATAG	2	12	972304	972315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016933	GTCTTG	2	12	972603	972614	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016933	AGTAAC	2	12	1006753	1006764	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016933	GTTTTA	2	12	1007155	1007166	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016933	AGTAAT	2	12	1018622	1018633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016933	TTAAAT	2	12	1027803	1027814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016933	TAATTA	2	12	1054069	1054080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016933	TATTAA	2	12	1054871	1054882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016933	AGATTT	2	12	1072462	1072473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016933	TAATCT	2	12	1074808	1074819	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016933	ATTTTT	2	12	1082588	1082599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016933	TATTTA	3	18	1086316	1086333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016933	AAATGG	2	12	1086569	1086580	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016933	ATTTGG	2	12	1117521	1117532	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016933	TAATAC	2	12	1118663	1118674	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016933	AATTTT	2	12	1133728	1133739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016933	AATCAA	2	12	1138228	1138239	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016933	TTTAAC	2	12	1148920	1148931	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016933	CTCTCA	2	12	1150715	1150726	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016933	CAAAGT	2	12	1151874	1151885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016933	AAATTA	2	12	1160586	1160597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016933	GTTTTA	2	12	1161656	1161667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016933	TGATAT	2	12	1174889	1174900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016933	AATTTG	2	12	1184916	1184927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016933	TCTAAA	2	12	1185100	1185111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016933	AAAAAT	2	12	1186913	1186924	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016933	ACAAGT	2	12	1190105	1190116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016933	TAATGT	2	12	1190373	1190384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016933	ATTAAT	2	12	1190551	1190562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016933	TATCAA	2	12	1191339	1191350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016933	AACTAA	2	12	1207654	1207665	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016933	AAATTA	2	12	1226119	1226130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016933	AAATAT	2	12	1242086	1242097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016933	TTTTTG	2	12	1251635	1251646	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016933	CTGCAA	2	12	1265851	1265862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016933	TACCTG	2	12	1267638	1267649	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016933	ATTTTA	2	12	1280172	1280183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016933	CAAAAT	2	12	1281548	1281559	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016933	GTTTTA	2	12	1326533	1326544	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016933	GTTTTA	2	12	1359815	1359826	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016933	ATTTCA	2	12	1384385	1384396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016933	CTTATT	2	12	1386689	1386700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016933	TTTAAA	2	12	1399740	1399751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016933	ATACAA	2	12	1407775	1407786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016933	ATCAAA	2	12	1410881	1410892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.