MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016932	TTTTTG	2	12	67704	67715	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016932	CTCACT	2	12	121753	121764	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016932	TGAGGG	2	12	171813	171824	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016932	TGGGGC	2	12	181823	181834	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016932	TTTGCC	2	12	315415	315426	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016932	GGATTT	2	12	355885	355896	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016932	GCTATA	2	12	373010	373021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016932	ACGTTG	2	12	373540	373551	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016932	CGTACG	2	12	379494	379505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016932	TGAGTA	2	12	386247	386258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016932	CTAAAA	2	12	393334	393345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016932	CGCCCG	2	12	397071	397082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_016932	GTGCCT	2	12	476347	476358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016932	TGGTTC	2	12	479736	479747	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016932	GCGCAA	2	12	520348	520359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016932	ATAAGA	2	12	583844	583855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016932	GTTTTT	2	12	584097	584108	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016932	GTTTTT	2	12	609360	609371	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016932	AGCGAA	2	12	610439	610450	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016932	TGCGCG	2	12	634700	634711	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016932	CTCGGT	2	12	649484	649495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016932	AGCTCA	2	12	650476	650487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016932	TTCATA	2	12	736240	736251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016932	GGCTGC	2	12	758613	758624	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016932	AGGACT	2	12	775804	775815	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016932	GAATGC	2	12	776251	776262	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016932	AGGGGT	2	12	862559	862570	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016932	AATGAT	2	12	913696	913707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016932	CCTTTT	2	12	921570	921581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016932	GTGGTT	2	12	954390	954401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016932	ATTCAT	2	12	969199	969210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016932	GTAAAG	2	12	988518	988529	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016932	GTTTTT	2	12	1023283	1023294	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016932	AGCGAA	2	12	1024361	1024372	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016932	TCAACT	2	12	1069958	1069969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016932	GGTTTG	2	12	1085912	1085923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016932	GCGTCC	2	12	1087294	1087305	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016932	TGGGGG	2	12	1095099	1095110	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016932	AGAAAA	2	12	1135688	1135699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016932	AAGCTC	2	12	1192534	1192545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016932	CAAGAA	2	12	1274464	1274475	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016932	CCCTAT	2	12	1276500	1276511	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016932	AATCTA	2	12	1401786	1401797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016932	TATTTC	2	12	1415932	1415943	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016932	TTTTAC	2	12	1433929	1433940	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016932	GACGGT	2	12	1434810	1434821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016932	GTCTGT	2	12	1462541	1462552	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016932	AATTTC	2	12	1495958	1495969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016932	CTGTGC	2	12	1536337	1536348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016932	CAGCGA	2	12	1569882	1569893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016932	TTGTGT	2	12	1605723	1605734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016932	GGCTTA	2	12	1695874	1695885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016932	ATTTTT	2	12	1718798	1718809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016932	AGCTTT	2	12	1782695	1782706	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016932	ACCTTT	2	12	1804676	1804687	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016932	CCTTCA	2	12	1811284	1811295	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016932	CCTAAC	2	12	1813902	1813913	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016932	AAGTTC	2	12	1814440	1814451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016932	ATCCCT	2	12	1815331	1815342	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016932	CAAAGG	2	12	1815489	1815500	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016932	TTCGCT	2	12	1826469	1826480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016932	AAAAAC	2	12	1827545	1827556	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016932	CAAAAT	2	12	1892665	1892676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016932	AGCGGA	2	12	1893416	1893427	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016932	CCGATA	2	12	1911855	1911866	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016932	ACTGGG	2	12	1911915	1911926	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016932	TTCCAT	2	12	1912679	1912690	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016932	AAACAA	2	12	1923871	1923882	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016932	CATTAT	2	12	1950134	1950145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016932	CTTTCG	2	12	1956816	1956827	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016932	TCCTTG	2	12	2004517	2004528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016932	CGTATA	2	12	2006531	2006542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016932	TACCCC	2	12	2015376	2015387	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016932	GAAAAA	2	12	2015559	2015570	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016932	AGATCG	2	12	2023828	2023839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016932	ATGTTG	2	12	2036834	2036845	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016932	GATGAG	2	12	2037294	2037305	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016932	CAAGGA	2	12	2037383	2037394	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016932	TCCCAC	2	12	2037739	2037750	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016932	TTCAAT	2	12	2042000	2042011	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016932	CTTACT	2	12	2043751	2043762	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016932	CTTTAA	2	12	2057417	2057428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016932	AGGTCA	2	12	2059699	2059710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016932	CTTTAG	2	12	2068496	2068507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016932	CCCCCG	2	12	2095373	2095384	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_016932	TCAAAG	2	12	2143694	2143705	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016932	AGAAAA	2	12	2168571	2168582	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016932	GGCAAG	2	12	2194305	2194316	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016932	TTCGCT	2	12	2203706	2203717	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016932	AAAAAC	2	12	2204785	2204796	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016932	TTACCC	2	12	2212314	2212325	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016932	CACCGG	2	12	2220055	2220066	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016932	TCTTTA	2	12	2252627	2252638	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016932	TTTTCT	2	12	2300069	2300080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.