MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 1294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016932	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	379714284
2	NC_016932	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	379714289
3	NC_016932	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	379714289
4	NC_016932	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	379714289
5	NC_016932	TTATC	2	10	14085	14094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016932	CAGTA	2	10	14632	14641	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016932	CAGTG	2	10	15503	15512	20 %	20 %	40 %	20 %	379714299
8	NC_016932	AAAAT	2	10	16763	16772	80 %	20 %	0 %	0 %	379714300
9	NC_016932	TAGCG	2	10	18331	18340	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016932	CTTTT	2	10	19238	19247	0 %	80 %	0 %	20 %	379714304
11	NC_016932	GCTCT	2	10	19275	19284	0 %	40 %	20 %	40 %	379714304
12	NC_016932	CACAC	2	10	21462	21471	40 %	0 %	0 %	60 %	379714310
13	NC_016932	TGGAT	2	10	22056	22065	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016932	TGCGT	2	10	25047	25056	0 %	40 %	40 %	20 %	379714313
15	NC_016932	CTGAT	2	10	29080	29089	20 %	40 %	20 %	20 %	379714317
16	NC_016932	GGAGC	2	10	30029	30038	20 %	0 %	60 %	20 %	379714318
17	NC_016932	TTGCT	2	10	31117	31126	0 %	60 %	20 %	20 %	379714319
18	NC_016932	TGAGG	2	10	37949	37958	20 %	20 %	60 %	0 %	379714323
19	NC_016932	CACAT	2	10	40132	40141	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016932	TGCGG	2	10	41059	41068	0 %	20 %	60 %	20 %	379714327
21	NC_016932	GCCTC	2	10	47103	47112	0 %	20 %	20 %	60 %	379714334
22	NC_016932	GAAGG	2	10	47117	47126	40 %	0 %	60 %	0 %	379714334
23	NC_016932	CAGTG	2	10	49047	49056	20 %	20 %	40 %	20 %	379714336
24	NC_016932	TGAGA	2	10	49389	49398	40 %	20 %	40 %	0 %	379714336
25	NC_016932	AGTGA	2	10	49439	49448	40 %	20 %	40 %	0 %	379714336
26	NC_016932	TTGGA	2	10	52470	52479	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016932	TTGAT	2	10	52505	52514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016932	TGCAC	2	10	52599	52608	20 %	20 %	20 %	40 %	379714341
29	NC_016932	CTGGC	2	10	52858	52867	0 %	20 %	40 %	40 %	379714342
30	NC_016932	GCAGC	2	10	53357	53366	20 %	0 %	40 %	40 %	379714342
31	NC_016932	GACTG	2	10	53373	53382	20 %	20 %	40 %	20 %	379714342
32	NC_016932	AAGGC	2	10	55617	55626	40 %	0 %	40 %	20 %	379714344
33	NC_016932	ATGGC	2	10	59142	59151	20 %	20 %	40 %	20 %	379714349
34	NC_016932	ATGTG	2	10	63308	63317	20 %	40 %	40 %	0 %	379714353
35	NC_016932	GCTGG	2	10	65467	65476	0 %	20 %	60 %	20 %	379714356
36	NC_016932	AGGGA	2	10	68074	68083	40 %	0 %	60 %	0 %	379714358
37	NC_016932	ATTTG	2	10	68648	68657	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016932	AAGAT	2	10	69880	69889	60 %	20 %	20 %	0 %	379714360
39	NC_016932	GGAGC	2	10	69987	69996	20 %	0 %	60 %	20 %	379714360
40	NC_016932	GGTCT	2	10	71701	71710	0 %	40 %	40 %	20 %	379714362
41	NC_016932	AGGGG	2	10	72259	72268	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016932	CATGT	2	10	72282	72291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016932	CAGCG	2	10	73159	73168	20 %	0 %	40 %	40 %	379714363
44	NC_016932	ACTGA	2	10	73336	73345	40 %	20 %	20 %	20 %	379714363
45	NC_016932	CAGGC	2	10	73565	73574	20 %	0 %	40 %	40 %	379714363
46	NC_016932	ATGGC	2	10	74408	74417	20 %	20 %	40 %	20 %	379714364
47	NC_016932	AGGCA	2	10	75729	75738	40 %	0 %	40 %	20 %	379714366
48	NC_016932	TAATT	2	10	76980	76989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016932	GCTTT	2	10	81574	81583	0 %	60 %	20 %	20 %	379714373
50	NC_016932	TGACC	2	10	81830	81839	20 %	20 %	20 %	40 %	379714373
51	NC_016932	CGTTA	2	10	82572	82581	20 %	40 %	20 %	20 %	379714374
52	NC_016932	TGCTG	2	10	83206	83215	0 %	40 %	40 %	20 %	379714374
53	NC_016932	TGGCC	2	10	85197	85206	0 %	20 %	40 %	40 %	379714375
54	NC_016932	GCGAC	2	10	86001	86010	20 %	0 %	40 %	40 %	379714375
55	NC_016932	TGGGA	2	10	89415	89424	20 %	20 %	60 %	0 %	379714381
56	NC_016932	GATCG	2	10	90515	90524	20 %	20 %	40 %	20 %	379714383
57	NC_016932	CAAAA	2	10	91249	91258	80 %	0 %	0 %	20 %	379714384
58	NC_016932	AACAA	2	10	94089	94098	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016932	TGCAA	2	10	97096	97105	40 %	20 %	20 %	20 %	379714389
60	NC_016932	TGCAG	2	10	97316	97325	20 %	20 %	40 %	20 %	379714389
61	NC_016932	AGGTC	2	10	99752	99761	20 %	20 %	40 %	20 %	379714392
62	NC_016932	ACCAA	2	10	101611	101620	60 %	0 %	0 %	40 %	379714392
63	NC_016932	TCATC	2	10	102874	102883	20 %	40 %	0 %	40 %	379714393
64	NC_016932	TGCAC	2	10	104689	104698	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016932	CCTGG	2	10	104905	104914	0 %	20 %	40 %	40 %	379714394
66	NC_016932	CGGTG	2	10	105113	105122	0 %	20 %	60 %	20 %	379714394
67	NC_016932	CGGCG	2	10	107732	107741	0 %	0 %	60 %	40 %	379714397
68	NC_016932	CGCGG	2	10	107792	107801	0 %	0 %	60 %	40 %	379714398
69	NC_016932	CAGCG	2	10	108328	108337	20 %	0 %	40 %	40 %	379714399
70	NC_016932	GGATC	2	10	119143	119152	20 %	20 %	40 %	20 %	379714411
71	NC_016932	TGTTT	2	10	121603	121612	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016932	CGGGA	2	10	126243	126252	20 %	0 %	60 %	20 %	379714416
73	NC_016932	GACTG	2	10	128499	128508	20 %	20 %	40 %	20 %	379714419
74	NC_016932	GGGGC	2	10	134285	134294	0 %	0 %	80 %	20 %	379714423
75	NC_016932	AGACG	2	10	136090	136099	40 %	0 %	40 %	20 %	379714425
76	NC_016932	ACGGT	2	10	137416	137425	20 %	20 %	40 %	20 %	379714427
77	NC_016932	CGATC	2	10	137689	137698	20 %	20 %	20 %	40 %	379714427
78	NC_016932	TGGCC	2	10	137896	137905	0 %	20 %	40 %	40 %	379714427
79	NC_016932	TGGTG	2	10	138274	138283	0 %	40 %	60 %	0 %	379714427
80	NC_016932	GGAGT	2	10	138746	138755	20 %	20 %	60 %	0 %	379714427
81	NC_016932	ATTGC	2	10	142680	142689	20 %	40 %	20 %	20 %	379714430
82	NC_016932	AAAAC	2	10	145506	145515	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016932	TCACT	2	10	146546	146555	20 %	40 %	0 %	40 %	379714435
84	NC_016932	ATTTC	2	10	147163	147172	20 %	60 %	0 %	20 %	379714435
85	NC_016932	AATGG	2	10	150862	150871	40 %	20 %	40 %	0 %	379714438
86	NC_016932	GTGAG	2	10	151844	151853	20 %	20 %	60 %	0 %	379714440
87	NC_016932	CTGAA	2	10	152642	152651	40 %	20 %	20 %	20 %	379714440
88	NC_016932	CCAGC	2	10	153934	153943	20 %	0 %	20 %	60 %	379714441
89	NC_016932	TTGCC	2	10	154443	154452	0 %	40 %	20 %	40 %	379714442
90	NC_016932	GTACC	2	10	156403	156412	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016932	TACGC	2	10	156960	156969	20 %	20 %	20 %	40 %	379714444
92	NC_016932	GGTTG	2	10	161724	161733	0 %	40 %	60 %	0 %	379714450
93	NC_016932	CCTTG	2	10	162100	162109	0 %	40 %	20 %	40 %	379714451
94	NC_016932	GCATA	2	10	163823	163832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016932	TGTGC	2	10	165046	165055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016932	CGGTG	2	10	166067	166076	0 %	20 %	60 %	20 %	379714454
97	NC_016932	CATGG	2	10	168200	168209	20 %	20 %	40 %	20 %	379714456
98	NC_016932	CAGAT	2	10	168556	168565	40 %	20 %	20 %	20 %	379714456
99	NC_016932	GGATG	2	10	169454	169463	20 %	20 %	60 %	0 %	379714456
100	NC_016932	TAACA	2	10	170459	170468	60 %	20 %	0 %	20 %	379714457
101	NC_016932	GGGAC	2	10	172080	172089	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016932	CACTT	2	10	172261	172270	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016932	AAACT	2	10	173138	173147	60 %	20 %	0 %	20 %	379714458
104	NC_016932	ACCGG	2	10	173533	173542	20 %	0 %	40 %	40 %	379714458
105	NC_016932	GAAAC	2	10	179928	179937	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016932	GGAGA	2	10	180013	180022	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016932	TTAAG	2	10	183685	183694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016932	TGACC	2	10	184603	184612	20 %	20 %	20 %	40 %	379714465
109	NC_016932	TAATA	2	10	185409	185418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016932	TTGCA	2	10	185887	185896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016932	GTTTG	2	10	187796	187805	0 %	60 %	40 %	0 %	379714468
112	NC_016932	CGGAT	2	10	188735	188744	20 %	20 %	40 %	20 %	379714469
113	NC_016932	AGCGC	2	10	189893	189902	20 %	0 %	40 %	40 %	379714470
114	NC_016932	GCAGT	2	10	191380	191389	20 %	20 %	40 %	20 %	379714471
115	NC_016932	CAATG	2	10	191651	191660	40 %	20 %	20 %	20 %	379714471
116	NC_016932	TAACG	2	10	192603	192612	40 %	20 %	20 %	20 %	379714472
117	NC_016932	AAGCC	2	10	193929	193938	40 %	0 %	20 %	40 %	379714473
118	NC_016932	GGCCC	2	10	196002	196011	0 %	0 %	40 %	60 %	379714476
119	NC_016932	GAATT	2	10	199567	199576	40 %	40 %	20 %	0 %	379714481
120	NC_016932	CAAGG	2	10	200456	200465	40 %	0 %	40 %	20 %	379714481
121	NC_016932	GATGG	2	10	202896	202905	20 %	20 %	60 %	0 %	379714482
122	NC_016932	TGGCG	2	10	203630	203639	0 %	20 %	60 %	20 %	379714483
123	NC_016932	TGCCG	2	10	205214	205223	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016932	CAGGC	2	10	206750	206759	20 %	0 %	40 %	40 %	379714485
125	NC_016932	TTGTA	2	10	207160	207169	20 %	60 %	20 %	0 %	379714486
126	NC_016932	GCGAC	2	10	211686	211695	20 %	0 %	40 %	40 %	379714491
127	NC_016932	AGATC	2	10	211711	211720	40 %	20 %	20 %	20 %	379714491
128	NC_016932	CAAGG	2	10	212625	212634	40 %	0 %	40 %	20 %	379714492
129	NC_016932	AGAAA	2	10	213354	213363	80 %	0 %	20 %	0 %	379714493
130	NC_016932	AGTGC	2	10	218387	218396	20 %	20 %	40 %	20 %	379714499
131	NC_016932	CGGGG	2	10	219389	219398	0 %	0 %	80 %	20 %	379714500
132	NC_016932	GAAAA	2	10	219528	219537	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016932	CGAGA	2	10	220165	220174	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016932	TGCGC	2	10	221826	221835	0 %	20 %	40 %	40 %	379714502
135	NC_016932	CATTG	2	10	223677	223686	20 %	40 %	20 %	20 %	379714504
136	NC_016932	CGCAA	2	10	224490	224499	40 %	0 %	20 %	40 %	379714507
137	NC_016932	CAAGA	2	10	226720	226729	60 %	0 %	20 %	20 %	379714508
138	NC_016932	TGGCT	2	10	226916	226925	0 %	40 %	40 %	20 %	379714508
139	NC_016932	CTGTG	2	10	228233	228242	0 %	40 %	40 %	20 %	379714510
140	NC_016932	GCCGT	2	10	229634	229643	0 %	20 %	40 %	40 %	379714510
141	NC_016932	AGAAA	2	10	230541	230550	80 %	0 %	20 %	0 %	379714510
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143	NC_016932	AGTGG	2	10	236246	236255	20 %	20 %	60 %	0 %	379714514
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147	NC_016932	CGCAG	2	10	242678	242687	20 %	0 %	40 %	40 %	379714521
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150	NC_016932	CCCCG	2	10	249506	249515	0 %	0 %	20 %	80 %	379714527
151	NC_016932	GAAGT	2	10	250047	250056	40 %	20 %	40 %	0 %	379714527
152	NC_016932	CCGTG	2	10	250233	250242	0 %	20 %	40 %	40 %	379714527
153	NC_016932	GCGCA	2	10	254613	254622	20 %	0 %	40 %	40 %	379714530
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158	NC_016932	CCATG	2	10	260227	260236	20 %	20 %	20 %	40 %	379714538
159	NC_016932	TTGCC	2	10	260314	260323	0 %	40 %	20 %	40 %	379714538
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161	NC_016932	GGTGT	2	10	264412	264421	0 %	40 %	60 %	0 %	379714541
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166	NC_016932	ACGCA	2	10	267961	267970	40 %	0 %	20 %	40 %	379714543
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171	NC_016932	CGGGT	2	10	277180	277189	0 %	20 %	60 %	20 %	379714554
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176	NC_016932	ATCAG	2	10	295987	295996	40 %	20 %	20 %	20 %	379714570
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179	NC_016932	ATTAG	2	10	299900	299909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_016932	GCTCT	2	10	300588	300597	0 %	40 %	20 %	40 %	379714575
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182	NC_016932	TGTCA	2	10	304454	304463	20 %	40 %	20 %	20 %	379714580
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214	NC_016932	GAACA	2	10	361632	361641	60 %	0 %	20 %	20 %	379714633
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231	NC_016932	GATGC	2	10	395779	395788	20 %	20 %	40 %	20 %	379714674
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233	NC_016932	TGGCT	2	10	398385	398394	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
234	NC_016932	AGCGC	2	10	398594	398603	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
235	NC_016932	GCGGA	2	10	399036	399045	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
236	NC_016932	GGTGC	2	10	399643	399652	0 %	20 %	60 %	20 %	379714675
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238	NC_016932	CAGCT	2	10	401183	401192	20 %	20 %	20 %	40 %	379714678
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240	NC_016932	GATGC	2	10	404410	404419	20 %	20 %	40 %	20 %	379714682
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242	NC_016932	TGGCT	2	10	406867	406876	0 %	40 %	40 %	20 %	379714684
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256	NC_016932	CGAGC	2	10	428946	428955	20 %	0 %	40 %	40 %	379714707
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259	NC_016932	CTACG	2	10	436618	436627	20 %	20 %	20 %	40 %	379714716
260	NC_016932	GATGT	2	10	443306	443315	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016932	GTCGC	2	10	443940	443949	0 %	20 %	40 %	40 %	379714723
262	NC_016932	GGTGG	2	10	447192	447201	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016932	CGCAA	2	10	448655	448664	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
264	NC_016932	GCTGT	2	10	449422	449431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
265	NC_016932	CGATC	2	10	449549	449558	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_016932	TGCGC	2	10	449692	449701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
267	NC_016932	CTGTG	2	10	449870	449879	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_016932	GACCT	2	10	451648	451657	20 %	20 %	20 %	40 %	379714731
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284	NC_016932	TGCCT	2	10	464396	464405	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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