MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 3709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016932	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016932	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016932	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016932	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016932	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016932	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016932	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016932	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016932	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016932	ACG	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016932	TTC	2	6	8265	8270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016932	TTA	2	6	8410	8415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016932	AAC	2	6	12253	12258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016932	AGG	2	6	12299	12304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016932	TGT	2	6	12368	12373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016932	GAA	2	6	13212	13217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016932	GTT	2	6	13238	13243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016932	GGT	2	6	13359	13364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016932	GAC	2	6	13460	13465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016932	AGG	2	6	14327	14332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016932	GAA	2	6	14366	14371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016932	ACC	2	6	14373	14378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016932	GGT	2	6	14393	14398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016932	CTT	2	6	14399	14404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016932	TGC	2	6	14478	14483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016932	GGA	2	6	18974	18979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016932	GAA	2	6	20102	20107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016932	TGG	2	6	20283	20288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016932	GCT	2	6	20369	20374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016932	CGA	2	6	20408	20413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016932	AGT	2	6	20923	20928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016932	GAA	2	6	20951	20956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016932	CCT	2	6	20984	20989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016932	GCC	2	6	21010	21015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016932	GTC	2	6	21016	21021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016932	GAG	2	6	21093	21098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016932	GAT	2	6	21209	21214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016932	CGG	2	6	21250	21255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016932	GCC	2	6	21736	21741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016932	GCT	2	6	21838	21843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016932	GAA	2	6	21846	21851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016932	GCT	2	6	21862	21867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016932	ACT	2	6	21889	21894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016932	ATT	2	6	21917	21922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016932	GAT	2	6	21934	21939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016932	ACC	2	6	21994	21999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016932	TGC	2	6	22089	22094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016932	ATT	2	6	22108	22113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016932	AAC	2	6	22133	22138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016932	GAA	2	6	22180	22185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016932	GGC	2	6	22243	22248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016932	GAA	2	6	22267	22272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016932	CGA	2	6	22407	22412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016932	GTT	2	6	22414	22419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016932	TAT	2	6	23183	23188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016932	AAT	2	6	24254	24259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016932	AGC	2	6	24261	24266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016932	TTG	2	6	24626	24631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016932	GCG	2	6	28482	28487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016932	TAT	2	6	29723	29728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016932	CCT	2	6	35163	35168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016932	AAC	2	6	35173	35178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016932	AGC	2	6	38039	38044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016932	GAG	2	6	38515	38520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016932	CCT	2	6	39555	39560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016932	GCA	2	6	39617	39622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016932	TAG	2	6	39657	39662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016932	ATT	2	6	39876	39881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016932	CAC	2	6	39886	39891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016932	TTC	2	6	41907	41912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016932	ATA	2	6	41932	41937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016932	TGA	2	6	42064	42069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016932	GCC	2	6	42611	42616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016932	GCA	2	6	42709	42714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016932	GTA	2	6	42723	42728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016932	AAT	2	6	43292	43297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016932	GCC	2	6	43398	43403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016932	CAC	2	6	43958	43963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016932	GCG	2	6	44037	44042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016932	CCG	2	6	44194	44199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016932	TGG	2	6	44229	44234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016932	ATT	2	6	45888	45893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016932	TGT	2	6	45952	45957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016932	AGC	2	6	47658	47663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016932	TTG	2	6	47674	47679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016932	GTT	2	6	47696	47701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016932	TTG	2	6	47785	47790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016932	AAT	2	6	47793	47798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016932	ACT	2	6	48163	48168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016932	TGG	2	6	48231	48236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016932	TAT	2	6	48245	48250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016932	AAG	2	6	49665	49670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016932	TGC	2	6	49708	49713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016932	TTC	2	6	49825	49830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016932	TCA	2	6	49840	49845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016932	GTG	2	6	50027	50032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016932	CAT	2	6	50037	50042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016932	TCT	2	6	50114	50119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016932	AAG	2	6	50166	50171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016932	ATC	2	6	50468	50473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016932	TGG	2	6	50647	50652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016932	CCT	2	6	51447	51452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016932	GCT	2	6	52457	52462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016932	AAC	2	6	52488	52493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016932	TGG	2	6	57523	57528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016932	CAT	2	6	57568	57573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016932	AGC	2	6	57600	57605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016932	ACG	2	6	57657	57662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016932	GCC	2	6	57668	57673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016932	TGT	2	6	58297	58302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016932	AAT	2	6	58318	58323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016932	AAG	2	6	58328	58333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016932	CTT	2	6	60117	60122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016932	ACC	2	6	60123	60128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016932	ACG	2	6	60138	60143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016932	GAG	2	6	60182	60187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016932	AAT	2	6	65191	65196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016932	TTG	2	6	66431	66436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016932	GAA	2	6	67725	67730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016932	TGC	2	6	68742	68747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016932	GGA	2	6	68757	68762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016932	TCT	2	6	68765	68770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016932	AGT	2	6	68802	68807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016932	CCT	2	6	69627	69632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016932	ATT	2	6	71938	71943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016932	TTG	2	6	71950	71955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016932	AGC	2	6	71976	71981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016932	GAA	2	6	72046	72051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016932	CTT	2	6	72136	72141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016932	TAA	2	6	72346	72351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016932	ACT	2	6	72393	72398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016932	ATG	2	6	79762	79767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016932	TCC	2	6	80378	80383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016932	TCT	2	6	80437	80442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016932	GAA	2	6	88634	88639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016932	GGT	2	6	89001	89006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016932	GTA	2	6	94063	94068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016932	GTT	2	6	104638	104643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016932	TGC	2	6	104665	104670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016932	GCC	2	6	104682	104687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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274	NC_016932	AGT	2	6	210533	210538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_016932	CAA	2	6	328498	328503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_016932	GAG	2	6	328509	328514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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