MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 1137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	TTTTA	2	10	2601	2610	20 %	80 %	0 %	0 %	379713091
2	NC_016931	ATTTA	2	10	2954	2963	40 %	60 %	0 %	0 %	379713091
3	NC_016931	GGTCA	2	10	4201	4210	20 %	20 %	40 %	20 %	379713092
4	NC_016931	TAAAT	2	10	4910	4919	60 %	40 %	0 %	0 %	379713092
5	NC_016931	TATGT	2	10	8572	8581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016931	TAATA	2	10	9486	9495	60 %	40 %	0 %	0 %	379713097
7	NC_016931	ATTTA	2	10	11295	11304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016931	TTTAA	2	10	11367	11376	40 %	60 %	0 %	0 %	379713098
9	NC_016931	GAAAT	2	10	11391	11400	60 %	20 %	20 %	0 %	379713098
10	NC_016931	TAAGC	2	10	12095	12104	40 %	20 %	20 %	20 %	379713098
11	NC_016931	TAAAG	2	10	12283	12292	60 %	20 %	20 %	0 %	379713098
12	NC_016931	TAACA	2	10	12437	12446	60 %	20 %	0 %	20 %	379713098
13	NC_016931	ATTTT	2	10	12556	12565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016931	TTAGT	2	10	13737	13746	20 %	60 %	20 %	0 %	379713100
15	NC_016931	TTTTA	2	10	15101	15110	20 %	80 %	0 %	0 %	379713102
16	NC_016931	AAAGC	2	10	19828	19837	60 %	0 %	20 %	20 %	379713106
17	NC_016931	AACCG	2	10	21242	21251	40 %	0 %	20 %	40 %	379713107
18	NC_016931	TTAGG	2	10	22938	22947	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016931	ATTGC	2	10	26252	26261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016931	CTTTA	2	10	26790	26799	20 %	60 %	0 %	20 %	379713114
21	NC_016931	ATCAA	2	10	27817	27826	60 %	20 %	0 %	20 %	379713114
22	NC_016931	TAATA	2	10	29542	29551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016931	TAATG	2	10	29678	29687	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016931	AGAAA	2	10	30736	30745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016931	GTACT	2	10	32035	32044	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016931	CTCTT	2	10	32495	32504	0 %	60 %	0 %	40 %	379713117
27	NC_016931	GAAAC	2	10	34524	34533	60 %	0 %	20 %	20 %	379713120
28	NC_016931	TTTCT	2	10	34964	34973	0 %	80 %	0 %	20 %	379713120
29	NC_016931	AGTTA	2	10	35343	35352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016931	GGCTC	2	10	35820	35829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016931	AGCAG	2	10	36240	36249	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016931	TAATA	2	10	37474	37483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016931	TAACT	2	10	37835	37844	40 %	40 %	0 %	20 %	379713122
34	NC_016931	ATTTA	2	10	39495	39504	40 %	60 %	0 %	0 %	379713124
35	NC_016931	TTAAA	2	10	39656	39665	60 %	40 %	0 %	0 %	379713124
36	NC_016931	TTTTA	2	10	40263	40272	20 %	80 %	0 %	0 %	379713124
37	NC_016931	TTTAA	2	10	41955	41964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016931	AGAAA	2	10	43329	43338	80 %	0 %	20 %	0 %	379713126
39	NC_016931	AAAGC	2	10	43486	43495	60 %	0 %	20 %	20 %	379713126
40	NC_016931	TAATA	2	10	44397	44406	60 %	40 %	0 %	0 %	379713126
41	NC_016931	CAAAG	2	10	44489	44498	60 %	0 %	20 %	20 %	379713126
42	NC_016931	CAGCT	2	10	44594	44603	20 %	20 %	20 %	40 %	379713126
43	NC_016931	AGCAG	2	10	44815	44824	40 %	0 %	40 %	20 %	379713126
44	NC_016931	TACCT	2	10	45978	45987	20 %	40 %	0 %	40 %	379713126
45	NC_016931	TATAA	2	10	47464	47473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016931	AGTTC	2	10	47561	47570	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016931	ATATT	2	10	49686	49695	40 %	60 %	0 %	0 %	379713128
48	NC_016931	ATATT	2	10	49721	49730	40 %	60 %	0 %	0 %	379713128
49	NC_016931	ATGTT	2	10	50747	50756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016931	TTTGT	2	10	51702	51711	0 %	80 %	20 %	0 %	379713130
51	NC_016931	TCATT	2	10	53354	53363	20 %	60 %	0 %	20 %	379713134
52	NC_016931	TAATA	2	10	53643	53652	60 %	40 %	0 %	0 %	379713134
53	NC_016931	CTATA	2	10	54283	54292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016931	CGCTC	2	10	54958	54967	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_016931	AAGTG	2	10	56842	56851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016931	TGAGT	2	10	58442	58451	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016931	TTAGT	2	10	60716	60725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016931	CTTGA	2	10	61945	61954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016931	CTTTT	2	10	62605	62614	0 %	80 %	0 %	20 %	379713142
60	NC_016931	TTATT	2	10	63035	63044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016931	TTTTA	2	10	63140	63149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016931	GAGAG	2	10	66797	66806	40 %	0 %	60 %	0 %	379713147
63	NC_016931	CAAAC	2	10	66849	66858	60 %	0 %	0 %	40 %	379713147
64	NC_016931	ACGTA	2	10	67019	67028	40 %	20 %	20 %	20 %	379713147
65	NC_016931	AAAAC	2	10	68260	68269	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016931	ATAAA	2	10	69375	69384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016931	AAGCA	2	10	71129	71138	60 %	0 %	20 %	20 %	379713152
68	NC_016931	AAAGA	2	10	71417	71426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016931	TAAAC	2	10	72318	72327	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016931	TAATA	2	10	72765	72774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016931	CAAGC	2	10	72994	73003	40 %	0 %	20 %	40 %	379713154
72	NC_016931	ATCAT	2	10	73331	73340	40 %	40 %	0 %	20 %	379713155
73	NC_016931	ACAAG	2	10	74397	74406	60 %	0 %	20 %	20 %	379713156
74	NC_016931	ATTTA	2	10	74886	74895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016931	CTTGC	2	10	76830	76839	0 %	40 %	20 %	40 %	379713158
76	NC_016931	TTTCA	2	10	77443	77452	20 %	60 %	0 %	20 %	379713159
77	NC_016931	ATTAA	2	10	78892	78901	60 %	40 %	0 %	0 %	379713161
78	NC_016931	GTTTT	2	10	78969	78978	0 %	80 %	20 %	0 %	379713161
79	NC_016931	TTTTA	2	10	79665	79674	20 %	80 %	0 %	0 %	379713161
80	NC_016931	CTTAT	2	10	79900	79909	20 %	60 %	0 %	20 %	379713162
81	NC_016931	CGAAT	2	10	80005	80014	40 %	20 %	20 %	20 %	379713162
82	NC_016931	TTTAC	2	10	81833	81842	20 %	60 %	0 %	20 %	379713165
83	NC_016931	TTTGC	2	10	88358	88367	0 %	60 %	20 %	20 %	379713170
84	NC_016931	CAACA	2	10	89324	89333	60 %	0 %	0 %	40 %	379713171
85	NC_016931	TGAAA	2	10	89775	89784	60 %	20 %	20 %	0 %	379713171
86	NC_016931	TAAAT	2	10	92343	92352	60 %	40 %	0 %	0 %	379713171
87	NC_016931	ATACT	2	10	92873	92882	40 %	40 %	0 %	20 %	379713171
88	NC_016931	GAAAA	2	10	93100	93109	80 %	0 %	20 %	0 %	379713171
89	NC_016931	AAATC	2	10	94375	94384	60 %	20 %	0 %	20 %	379713171
90	NC_016931	ATCCG	2	10	95838	95847	20 %	20 %	20 %	40 %	379713172
91	NC_016931	TTTGG	2	10	96386	96395	0 %	60 %	40 %	0 %	379713173
92	NC_016931	ACTAA	2	10	98823	98832	60 %	20 %	0 %	20 %	379713175
93	NC_016931	AGTTT	2	10	99174	99183	20 %	60 %	20 %	0 %	379713176
94	NC_016931	AATTA	2	10	101743	101752	60 %	40 %	0 %	0 %	379713178
95	NC_016931	ATTTG	2	10	102532	102541	20 %	60 %	20 %	0 %	379713179
96	NC_016931	TAATT	2	10	103821	103830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016931	TCTTT	2	10	104975	104984	0 %	80 %	0 %	20 %	379713182
98	NC_016931	TACAA	2	10	105129	105138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016931	ATCAA	2	10	105894	105903	60 %	20 %	0 %	20 %	379713183
100	NC_016931	ATCTT	2	10	110555	110564	20 %	60 %	0 %	20 %	379713186
101	NC_016931	ATGCG	3	15	111322	111336	20 %	20 %	40 %	20 %	379713187
102	NC_016931	TGTAT	2	10	119702	119711	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016931	TAATT	2	10	119907	119916	40 %	60 %	0 %	0 %	379713198
104	NC_016931	TTTTA	2	10	120614	120623	20 %	80 %	0 %	0 %	379713198
105	NC_016931	CATTG	2	10	121078	121087	20 %	40 %	20 %	20 %	379713199
106	NC_016931	ATTTT	2	10	122528	122537	20 %	80 %	0 %	0 %	379713201
107	NC_016931	TCTAC	2	10	123430	123439	20 %	40 %	0 %	40 %	379713201
108	NC_016931	ATATA	2	10	123591	123600	60 %	40 %	0 %	0 %	379713201
109	NC_016931	TATTG	2	10	124360	124369	20 %	60 %	20 %	0 %	379713202
110	NC_016931	TAAGC	2	10	124725	124734	40 %	20 %	20 %	20 %	379713203
111	NC_016931	AAATA	2	10	125961	125970	80 %	20 %	0 %	0 %	379713204
112	NC_016931	CAACC	2	10	126338	126347	40 %	0 %	0 %	60 %	379713204
113	NC_016931	TAAAT	2	10	127325	127334	60 %	40 %	0 %	0 %	379713204
114	NC_016931	AGAAA	2	10	127716	127725	80 %	0 %	20 %	0 %	379713205
115	NC_016931	ACTTT	2	10	128778	128787	20 %	60 %	0 %	20 %	379713207
116	NC_016931	AATAC	2	10	129319	129328	60 %	20 %	0 %	20 %	379713207
117	NC_016931	ATCCA	2	10	129818	129827	40 %	20 %	0 %	40 %	379713208
118	NC_016931	AATTA	2	10	131435	131444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016931	AAATC	2	10	133882	133891	60 %	20 %	0 %	20 %	379713214
120	NC_016931	TTAAC	2	10	135019	135028	40 %	40 %	0 %	20 %	379713215
121	NC_016931	TATAA	2	10	135111	135120	60 %	40 %	0 %	0 %	379713215
122	NC_016931	TTATA	2	10	135485	135494	40 %	60 %	0 %	0 %	379713216
123	NC_016931	TTTTA	2	10	137011	137020	20 %	80 %	0 %	0 %	379713217
124	NC_016931	GCTTT	2	10	138587	138596	0 %	60 %	20 %	20 %	379713218
125	NC_016931	TATGT	2	10	139237	139246	20 %	60 %	20 %	0 %	379713218
126	NC_016931	GTTTT	2	10	141832	141841	0 %	80 %	20 %	0 %	379713219
127	NC_016931	ACAAG	2	10	146363	146372	60 %	0 %	20 %	20 %	379713220
128	NC_016931	AGTTT	2	10	146695	146704	20 %	60 %	20 %	0 %	379713221
129	NC_016931	TTAGT	2	10	147218	147227	20 %	60 %	20 %	0 %	379713221
130	NC_016931	ATATA	2	10	148124	148133	60 %	40 %	0 %	0 %	379713221
131	NC_016931	TGCAG	2	10	148212	148221	20 %	20 %	40 %	20 %	379713221
132	NC_016931	GTTAT	2	10	148628	148637	20 %	60 %	20 %	0 %	379713221
133	NC_016931	ATGGT	2	10	149795	149804	20 %	40 %	40 %	0 %	379713222
134	NC_016931	TATTT	2	10	150729	150738	20 %	80 %	0 %	0 %	379713222
135	NC_016931	AAAGA	2	10	155778	155787	80 %	0 %	20 %	0 %	379713223
136	NC_016931	AATTA	2	10	155817	155826	60 %	40 %	0 %	0 %	379713223
137	NC_016931	AATTT	2	10	157617	157626	40 %	60 %	0 %	0 %	379713227
138	NC_016931	AGGTG	2	10	157723	157732	20 %	20 %	60 %	0 %	379713227
139	NC_016931	GAAGT	2	10	161636	161645	40 %	20 %	40 %	0 %	379713231
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