MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	TTTTA	2	10	2601	2610	20 %	80 %	0 %	0 %	379713091
2	NC_016931	ATTTA	2	10	2954	2963	40 %	60 %	0 %	0 %	379713091
3	NC_016931	GGTCA	2	10	4201	4210	20 %	20 %	40 %	20 %	379713092
4	NC_016931	TAAAT	2	10	4910	4919	60 %	40 %	0 %	0 %	379713092
5	NC_016931	TAATA	2	10	9486	9495	60 %	40 %	0 %	0 %	379713097
6	NC_016931	TTTAA	2	10	11367	11376	40 %	60 %	0 %	0 %	379713098
7	NC_016931	GAAAT	2	10	11391	11400	60 %	20 %	20 %	0 %	379713098
8	NC_016931	TAAGC	2	10	12095	12104	40 %	20 %	20 %	20 %	379713098
9	NC_016931	TAAAG	2	10	12283	12292	60 %	20 %	20 %	0 %	379713098
10	NC_016931	TAACA	2	10	12437	12446	60 %	20 %	0 %	20 %	379713098
11	NC_016931	TTAGT	2	10	13737	13746	20 %	60 %	20 %	0 %	379713100
12	NC_016931	TTTTA	2	10	15101	15110	20 %	80 %	0 %	0 %	379713102
13	NC_016931	AAAGC	2	10	19828	19837	60 %	0 %	20 %	20 %	379713106
14	NC_016931	AACCG	2	10	21242	21251	40 %	0 %	20 %	40 %	379713107
15	NC_016931	CTTTA	2	10	26790	26799	20 %	60 %	0 %	20 %	379713114
16	NC_016931	ATCAA	2	10	27817	27826	60 %	20 %	0 %	20 %	379713114
17	NC_016931	CTCTT	2	10	32495	32504	0 %	60 %	0 %	40 %	379713117
18	NC_016931	GAAAC	2	10	34524	34533	60 %	0 %	20 %	20 %	379713120
19	NC_016931	TTTCT	2	10	34964	34973	0 %	80 %	0 %	20 %	379713120
20	NC_016931	TAACT	2	10	37835	37844	40 %	40 %	0 %	20 %	379713122
21	NC_016931	ATTTA	2	10	39495	39504	40 %	60 %	0 %	0 %	379713124
22	NC_016931	TTAAA	2	10	39656	39665	60 %	40 %	0 %	0 %	379713124
23	NC_016931	TTTTA	2	10	40263	40272	20 %	80 %	0 %	0 %	379713124
24	NC_016931	AGAAA	2	10	43329	43338	80 %	0 %	20 %	0 %	379713126
25	NC_016931	AAAGC	2	10	43486	43495	60 %	0 %	20 %	20 %	379713126
26	NC_016931	TAATA	2	10	44397	44406	60 %	40 %	0 %	0 %	379713126
27	NC_016931	CAAAG	2	10	44489	44498	60 %	0 %	20 %	20 %	379713126
28	NC_016931	CAGCT	2	10	44594	44603	20 %	20 %	20 %	40 %	379713126
29	NC_016931	AGCAG	2	10	44815	44824	40 %	0 %	40 %	20 %	379713126
30	NC_016931	TACCT	2	10	45978	45987	20 %	40 %	0 %	40 %	379713126
31	NC_016931	ATATT	2	10	49686	49695	40 %	60 %	0 %	0 %	379713128
32	NC_016931	ATATT	2	10	49721	49730	40 %	60 %	0 %	0 %	379713128
33	NC_016931	TTTGT	2	10	51702	51711	0 %	80 %	20 %	0 %	379713130
34	NC_016931	TCATT	2	10	53354	53363	20 %	60 %	0 %	20 %	379713134
35	NC_016931	TAATA	2	10	53643	53652	60 %	40 %	0 %	0 %	379713134
36	NC_016931	CTTTT	2	10	62605	62614	0 %	80 %	0 %	20 %	379713142
37	NC_016931	GAGAG	2	10	66797	66806	40 %	0 %	60 %	0 %	379713147
38	NC_016931	CAAAC	2	10	66849	66858	60 %	0 %	0 %	40 %	379713147
39	NC_016931	ACGTA	2	10	67019	67028	40 %	20 %	20 %	20 %	379713147
40	NC_016931	AAGCA	2	10	71129	71138	60 %	0 %	20 %	20 %	379713152
41	NC_016931	CAAGC	2	10	72994	73003	40 %	0 %	20 %	40 %	379713154
42	NC_016931	ATCAT	2	10	73331	73340	40 %	40 %	0 %	20 %	379713155
43	NC_016931	ACAAG	2	10	74397	74406	60 %	0 %	20 %	20 %	379713156
44	NC_016931	CTTGC	2	10	76830	76839	0 %	40 %	20 %	40 %	379713158
45	NC_016931	TTTCA	2	10	77443	77452	20 %	60 %	0 %	20 %	379713159
46	NC_016931	ATTAA	2	10	78892	78901	60 %	40 %	0 %	0 %	379713161
47	NC_016931	GTTTT	2	10	78969	78978	0 %	80 %	20 %	0 %	379713161
48	NC_016931	TTTTA	2	10	79665	79674	20 %	80 %	0 %	0 %	379713161
49	NC_016931	CTTAT	2	10	79900	79909	20 %	60 %	0 %	20 %	379713162
50	NC_016931	CGAAT	2	10	80005	80014	40 %	20 %	20 %	20 %	379713162
51	NC_016931	TTTAC	2	10	81833	81842	20 %	60 %	0 %	20 %	379713165
52	NC_016931	TTTGC	2	10	88358	88367	0 %	60 %	20 %	20 %	379713170
53	NC_016931	CAACA	2	10	89324	89333	60 %	0 %	0 %	40 %	379713171
54	NC_016931	TGAAA	2	10	89775	89784	60 %	20 %	20 %	0 %	379713171
55	NC_016931	TAAAT	2	10	92343	92352	60 %	40 %	0 %	0 %	379713171
56	NC_016931	ATACT	2	10	92873	92882	40 %	40 %	0 %	20 %	379713171
57	NC_016931	GAAAA	2	10	93100	93109	80 %	0 %	20 %	0 %	379713171
58	NC_016931	AAATC	2	10	94375	94384	60 %	20 %	0 %	20 %	379713171
59	NC_016931	ATCCG	2	10	95838	95847	20 %	20 %	20 %	40 %	379713172
60	NC_016931	TTTGG	2	10	96386	96395	0 %	60 %	40 %	0 %	379713173
61	NC_016931	ACTAA	2	10	98823	98832	60 %	20 %	0 %	20 %	379713175
62	NC_016931	AGTTT	2	10	99174	99183	20 %	60 %	20 %	0 %	379713176
63	NC_016931	AATTA	2	10	101743	101752	60 %	40 %	0 %	0 %	379713178
64	NC_016931	ATTTG	2	10	102532	102541	20 %	60 %	20 %	0 %	379713179
65	NC_016931	TCTTT	2	10	104975	104984	0 %	80 %	0 %	20 %	379713182
66	NC_016931	ATCAA	2	10	105894	105903	60 %	20 %	0 %	20 %	379713183
67	NC_016931	ATCTT	2	10	110555	110564	20 %	60 %	0 %	20 %	379713186
68	NC_016931	ATGCG	3	15	111322	111336	20 %	20 %	40 %	20 %	379713187
69	NC_016931	TAATT	2	10	119907	119916	40 %	60 %	0 %	0 %	379713198
70	NC_016931	TTTTA	2	10	120614	120623	20 %	80 %	0 %	0 %	379713198
71	NC_016931	CATTG	2	10	121078	121087	20 %	40 %	20 %	20 %	379713199
72	NC_016931	ATTTT	2	10	122528	122537	20 %	80 %	0 %	0 %	379713201
73	NC_016931	TCTAC	2	10	123430	123439	20 %	40 %	0 %	40 %	379713201
74	NC_016931	ATATA	2	10	123591	123600	60 %	40 %	0 %	0 %	379713201
75	NC_016931	TATTG	2	10	124360	124369	20 %	60 %	20 %	0 %	379713202
76	NC_016931	TAAGC	2	10	124725	124734	40 %	20 %	20 %	20 %	379713203
77	NC_016931	AAATA	2	10	125961	125970	80 %	20 %	0 %	0 %	379713204
78	NC_016931	CAACC	2	10	126338	126347	40 %	0 %	0 %	60 %	379713204
79	NC_016931	TAAAT	2	10	127325	127334	60 %	40 %	0 %	0 %	379713204
80	NC_016931	AGAAA	2	10	127716	127725	80 %	0 %	20 %	0 %	379713205
81	NC_016931	ACTTT	2	10	128778	128787	20 %	60 %	0 %	20 %	379713207
82	NC_016931	AATAC	2	10	129319	129328	60 %	20 %	0 %	20 %	379713207
83	NC_016931	ATCCA	2	10	129818	129827	40 %	20 %	0 %	40 %	379713208
84	NC_016931	AAATC	2	10	133882	133891	60 %	20 %	0 %	20 %	379713214
85	NC_016931	TTAAC	2	10	135019	135028	40 %	40 %	0 %	20 %	379713215
86	NC_016931	TATAA	2	10	135111	135120	60 %	40 %	0 %	0 %	379713215
87	NC_016931	TTATA	2	10	135485	135494	40 %	60 %	0 %	0 %	379713216
88	NC_016931	TTTTA	2	10	137011	137020	20 %	80 %	0 %	0 %	379713217
89	NC_016931	GCTTT	2	10	138587	138596	0 %	60 %	20 %	20 %	379713218
90	NC_016931	TATGT	2	10	139237	139246	20 %	60 %	20 %	0 %	379713218
91	NC_016931	GTTTT	2	10	141832	141841	0 %	80 %	20 %	0 %	379713219
92	NC_016931	ACAAG	2	10	146363	146372	60 %	0 %	20 %	20 %	379713220
93	NC_016931	AGTTT	2	10	146695	146704	20 %	60 %	20 %	0 %	379713221
94	NC_016931	TTAGT	2	10	147218	147227	20 %	60 %	20 %	0 %	379713221
95	NC_016931	ATATA	2	10	148124	148133	60 %	40 %	0 %	0 %	379713221
96	NC_016931	TGCAG	2	10	148212	148221	20 %	20 %	40 %	20 %	379713221
97	NC_016931	GTTAT	2	10	148628	148637	20 %	60 %	20 %	0 %	379713221
98	NC_016931	ATGGT	2	10	149795	149804	20 %	40 %	40 %	0 %	379713222
99	NC_016931	TATTT	2	10	150729	150738	20 %	80 %	0 %	0 %	379713222
100	NC_016931	AAAGA	2	10	155778	155787	80 %	0 %	20 %	0 %	379713223
101	NC_016931	AATTA	2	10	155817	155826	60 %	40 %	0 %	0 %	379713223
102	NC_016931	AATTT	2	10	157617	157626	40 %	60 %	0 %	0 %	379713227
103	NC_016931	AGGTG	2	10	157723	157732	20 %	20 %	60 %	0 %	379713227
104	NC_016931	GAAGT	2	10	161636	161645	40 %	20 %	40 %	0 %	379713231
105	NC_016931	AAATT	2	10	164207	164216	60 %	40 %	0 %	0 %	379713234
106	NC_016931	TATCA	2	10	164584	164593	40 %	40 %	0 %	20 %	379713234
107	NC_016931	TAGCT	2	10	164671	164680	20 %	40 %	20 %	20 %	379713234
108	NC_016931	TATAT	2	10	164898	164907	40 %	60 %	0 %	0 %	379713235
109	NC_016931	TTATT	2	10	165533	165542	20 %	80 %	0 %	0 %	379713235
110	NC_016931	AATTT	2	10	165954	165963	40 %	60 %	0 %	0 %	379713236
111	NC_016931	ATTTT	2	10	166341	166350	20 %	80 %	0 %	0 %	379713236
112	NC_016931	AGCCG	2	10	166546	166555	20 %	0 %	40 %	40 %	379713236
113	NC_016931	TGGTG	2	10	170537	170546	0 %	40 %	60 %	0 %	379713240
114	NC_016931	AAGAA	2	10	173048	173057	80 %	0 %	20 %	0 %	379713242
115	NC_016931	CAGGG	2	10	173660	173669	20 %	0 %	60 %	20 %	379713243
116	NC_016931	ATATC	2	10	174434	174443	40 %	40 %	0 %	20 %	379713244
117	NC_016931	TGGAT	2	10	175213	175222	20 %	40 %	40 %	0 %	379713246
118	NC_016931	GTGCC	2	10	176668	176677	0 %	20 %	40 %	40 %	379713246
119	NC_016931	ACATA	2	10	177733	177742	60 %	20 %	0 %	20 %	379713247
120	NC_016931	ACAGA	2	10	177791	177800	60 %	0 %	20 %	20 %	379713248
121	NC_016931	TAAAA	2	10	178848	178857	80 %	20 %	0 %	0 %	379713249
122	NC_016931	TATAC	2	10	189273	189282	40 %	40 %	0 %	20 %	379713254
123	NC_016931	GTAGA	2	10	189682	189691	40 %	20 %	40 %	0 %	379713254
124	NC_016931	TAAAA	2	10	198591	198600	80 %	20 %	0 %	0 %	379713259
125	NC_016931	TAGCA	2	10	198702	198711	40 %	20 %	20 %	20 %	379713259
126	NC_016931	TAAAG	2	10	199581	199590	60 %	20 %	20 %	0 %	379713260
127	NC_016931	GAATT	2	10	203448	203457	40 %	40 %	20 %	0 %	379713264
128	NC_016931	ATATA	2	10	208546	208555	60 %	40 %	0 %	0 %	379713270
129	NC_016931	AATTT	2	10	208556	208565	40 %	60 %	0 %	0 %	379713270
130	NC_016931	ATTTA	2	10	208691	208700	40 %	60 %	0 %	0 %	379713271
131	NC_016931	AAAAC	2	10	208976	208985	80 %	0 %	0 %	20 %	379713271
132	NC_016931	AAAGT	2	10	209298	209307	60 %	20 %	20 %	0 %	379713271
133	NC_016931	AATAA	2	10	209864	209873	80 %	20 %	0 %	0 %	379713271
134	NC_016931	TTAAA	2	10	212739	212748	60 %	40 %	0 %	0 %	379713275
135	NC_016931	GTGCG	2	10	213385	213394	0 %	20 %	60 %	20 %	379713275
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