MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 3778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016931	ATTT	2	8	1454	1461	25 %	75 %	0 %	0 %	379713089
3	NC_016931	ATTT	2	8	1465	1472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016931	GAAA	2	8	1869	1876	75 %	0 %	25 %	0 %	379713090
5	NC_016931	TTAT	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	379713091
6	NC_016931	TTAT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	379713091
7	NC_016931	CAAA	2	8	3413	3420	75 %	0 %	0 %	25 %	379713092
8	NC_016931	TATT	2	8	3680	3687	25 %	75 %	0 %	0 %	379713092
9	NC_016931	TCGC	2	8	3810	3817	0 %	25 %	25 %	50 %	379713092
10	NC_016931	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	379713092
11	NC_016931	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	379713092
12	NC_016931	AATT	2	8	5719	5726	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
13	NC_016931	ATTT	2	8	6291	6298	25 %	75 %	0 %	0 %	379713094
14	NC_016931	ATTG	2	8	7204	7211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016931	TAGT	2	8	7451	7458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016931	ATTG	2	8	7489	7496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016931	CTAT	2	8	8118	8125	25 %	50 %	0 %	25 %	379713095
18	NC_016931	AAAT	2	8	8190	8197	75 %	25 %	0 %	0 %	379713095
19	NC_016931	TTAC	2	8	8798	8805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016931	TAAA	2	8	9020	9027	75 %	25 %	0 %	0 %	379713096
21	NC_016931	CTAA	2	8	9156	9163	50 %	25 %	0 %	25 %	379713096
22	NC_016931	ATTA	2	8	9471	9478	50 %	50 %	0 %	0 %	379713096
23	NC_016931	ATAA	2	8	9566	9573	75 %	25 %	0 %	0 %	379713097
24	NC_016931	TACA	2	8	9808	9815	50 %	25 %	0 %	25 %	379713097
25	NC_016931	CAAG	2	8	10197	10204	50 %	0 %	25 %	25 %	379713097
26	NC_016931	TAAA	2	8	10614	10621	75 %	25 %	0 %	0 %	379713097
27	NC_016931	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	379713097
28	NC_016931	ACTA	2	8	10768	10775	50 %	25 %	0 %	25 %	379713097
29	NC_016931	GTGA	2	8	10916	10923	25 %	25 %	50 %	0 %	379713097
30	NC_016931	ATTA	2	8	11134	11141	50 %	50 %	0 %	0 %	379713097
31	NC_016931	TTAC	2	8	12689	12696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016931	TTAT	2	8	12737	12744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016931	GTTT	2	8	12956	12963	0 %	75 %	25 %	0 %	379713099
34	NC_016931	AATT	2	8	13530	13537	50 %	50 %	0 %	0 %	379713100
35	NC_016931	CAAA	2	8	14458	14465	75 %	0 %	0 %	25 %	379713100
36	NC_016931	AATT	2	8	14720	14727	50 %	50 %	0 %	0 %	379713100
37	NC_016931	TAAT	2	8	15057	15064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016931	AGCA	2	8	15328	15335	50 %	0 %	25 %	25 %	379713102
39	NC_016931	ATGC	2	8	15555	15562	25 %	25 %	25 %	25 %	379713102
40	NC_016931	TTCC	2	8	15607	15614	0 %	50 %	0 %	50 %	379713102
41	NC_016931	TTAA	2	8	15663	15670	50 %	50 %	0 %	0 %	379713102
42	NC_016931	ATCT	2	8	15704	15711	25 %	50 %	0 %	25 %	379713102
43	NC_016931	CATT	2	8	16450	16457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016931	AAAT	2	8	17229	17236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016931	AATT	2	8	17537	17544	50 %	50 %	0 %	0 %	379713105
46	NC_016931	CATA	2	8	17584	17591	50 %	25 %	0 %	25 %	379713105
47	NC_016931	ATCC	2	8	18310	18317	25 %	25 %	0 %	50 %	379713105
48	NC_016931	TAAG	2	8	18592	18599	50 %	25 %	25 %	0 %	379713105
49	NC_016931	CTTG	2	8	18635	18642	0 %	50 %	25 %	25 %	379713105
50	NC_016931	ATTC	2	8	18866	18873	25 %	50 %	0 %	25 %	379713105
51	NC_016931	TAAA	2	8	19219	19226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016931	ATTT	2	8	19245	19252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016931	TAAT	2	8	19694	19701	50 %	50 %	0 %	0 %	379713106
54	NC_016931	GACT	2	8	20183	20190	25 %	25 %	25 %	25 %	379713106
55	NC_016931	CAAG	2	8	20922	20929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016931	TTTA	2	8	21531	21538	25 %	75 %	0 %	0 %	379713108
57	NC_016931	CTTT	2	8	21598	21605	0 %	75 %	0 %	25 %	379713108
58	NC_016931	TTTC	2	8	21977	21984	0 %	75 %	0 %	25 %	379713109
59	NC_016931	AATA	2	8	22620	22627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016931	CGTT	2	8	22972	22979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016931	ATTA	2	8	23074	23081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016931	ATAA	2	8	23333	23340	75 %	25 %	0 %	0 %	379713111
63	NC_016931	GGAT	2	8	23510	23517	25 %	25 %	50 %	0 %	379713111
64	NC_016931	TTTA	2	8	23647	23654	25 %	75 %	0 %	0 %	379713111
65	NC_016931	TTTA	2	8	23701	23708	25 %	75 %	0 %	0 %	379713111
66	NC_016931	AAGT	2	8	24192	24199	50 %	25 %	25 %	0 %	379713111
67	NC_016931	AGAT	2	8	24343	24350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016931	AAAG	2	8	24703	24710	75 %	0 %	25 %	0 %	379713112
69	NC_016931	AATA	2	8	25348	25355	75 %	25 %	0 %	0 %	379713112
70	NC_016931	TTAT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	379713112
71	NC_016931	ATTT	2	8	25547	25554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016931	CTTA	2	8	26031	26038	25 %	50 %	0 %	25 %	379713113
73	NC_016931	ATTT	2	8	26463	26470	25 %	75 %	0 %	0 %	379713114
74	NC_016931	CGGT	2	8	27182	27189	0 %	25 %	50 %	25 %	379713114
75	NC_016931	GCGG	2	8	27212	27219	0 %	0 %	75 %	25 %	379713114
76	NC_016931	CTCA	2	8	27978	27985	25 %	25 %	0 %	50 %	379713114
77	NC_016931	AGCA	2	8	28086	28093	50 %	0 %	25 %	25 %	379713114
78	NC_016931	ATAA	2	8	28168	28175	75 %	25 %	0 %	0 %	379713114
79	NC_016931	TTTA	2	8	28791	28798	25 %	75 %	0 %	0 %	379713114
80	NC_016931	ATAA	2	8	29001	29008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016931	TAAT	2	8	29016	29023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016931	TTAA	2	8	29067	29074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016931	ATTT	2	8	30080	30087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016931	GAGT	2	8	30119	30126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016931	ATAA	2	8	30229	30236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016931	AGCA	2	8	30334	30341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016931	AGCA	2	8	30650	30657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016931	AGAT	2	8	30813	30820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016931	GAAA	2	8	31732	31739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016931	TTAA	2	8	31819	31826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016931	ACTT	2	8	31870	31877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016931	AACA	2	8	31907	31914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016931	GCAA	2	8	32276	32283	50 %	0 %	25 %	25 %	379713116
94	NC_016931	ATGT	2	8	32418	32425	25 %	50 %	25 %	0 %	379713117
95	NC_016931	TACT	2	8	32642	32649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016931	ATTT	2	8	33405	33412	25 %	75 %	0 %	0 %	379713119
97	NC_016931	AATT	2	8	33793	33800	50 %	50 %	0 %	0 %	379713120
98	NC_016931	GATA	2	8	33818	33825	50 %	25 %	25 %	0 %	379713120
99	NC_016931	AAGA	2	8	34032	34039	75 %	0 %	25 %	0 %	379713120
100	NC_016931	AGGC	2	8	34376	34383	25 %	0 %	50 %	25 %	379713120
101	NC_016931	GTAA	2	8	35163	35170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016931	AAAT	2	8	35242	35249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016931	ACAT	2	8	35368	35375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016931	AACG	2	8	36402	36409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016931	AAAT	2	8	36465	36472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016931	TGTA	2	8	36571	36578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016931	TAAA	2	8	36768	36775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016931	TAAA	2	8	36927	36934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016931	TCAT	2	8	37050	37057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016931	CTTT	2	8	37184	37191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016931	TTAG	2	8	37420	37427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016931	GCAA	2	8	37682	37689	50 %	0 %	25 %	25 %	379713121
113	NC_016931	TCTT	2	8	37760	37767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016931	AGTA	2	8	38018	38025	50 %	25 %	25 %	0 %	379713122
115	NC_016931	GCTT	2	8	38547	38554	0 %	50 %	25 %	25 %	379713123
116	NC_016931	AATT	2	8	38896	38903	50 %	50 %	0 %	0 %	379713123
117	NC_016931	GCTG	2	8	39513	39520	0 %	25 %	50 %	25 %	379713124
118	NC_016931	TCTA	2	8	39990	39997	25 %	50 %	0 %	25 %	379713124
119	NC_016931	CTTG	2	8	40474	40481	0 %	50 %	25 %	25 %	379713124
120	NC_016931	TAAA	2	8	41148	41155	75 %	25 %	0 %	0 %	379713125
121	NC_016931	GATA	2	8	41229	41236	50 %	25 %	25 %	0 %	379713125
122	NC_016931	AGCA	2	8	41298	41305	50 %	0 %	25 %	25 %	379713125
123	NC_016931	TAAA	2	8	41566	41573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016931	AAAC	2	8	41614	41621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016931	TTAT	2	8	41888	41895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016931	GTAA	2	8	42838	42845	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
127	NC_016931	AGAT	2	8	43098	43105	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
128	NC_016931	AGCA	2	8	43211	43218	50 %	0 %	25 %	25 %	379713126
129	NC_016931	ATTA	2	8	43774	43781	50 %	50 %	0 %	0 %	379713126
130	NC_016931	ATAG	2	8	43834	43841	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
131	NC_016931	GAAT	2	8	44321	44328	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
132	NC_016931	AATG	2	8	45840	45847	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
133	NC_016931	AAGT	2	8	46016	46023	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
134	NC_016931	AAAG	2	8	46132	46139	75 %	0 %	25 %	0 %	379713126
135	NC_016931	TTCA	2	8	46574	46581	25 %	50 %	0 %	25 %	379713126
136	NC_016931	AATA	2	8	47067	47074	75 %	25 %	0 %	0 %	379713126
137	NC_016931	TAAA	2	8	47213	47220	75 %	25 %	0 %	0 %	379713126
138	NC_016931	TTTA	2	8	47821	47828	25 %	75 %	0 %	0 %	379713127
139	NC_016931	TACA	2	8	48033	48040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016931	TTAT	2	8	48390	48397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016931	TAAA	2	8	48500	48507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016931	AGCA	2	8	48711	48718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016931	AGTA	2	8	49140	49147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016931	AAAG	2	8	49155	49162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_016931	AAAT	2	8	49854	49861	75 %	25 %	0 %	0 %	379713128
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