MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 1034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016931	ATTT	2	8	1465	1472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016931	ATTG	2	8	7204	7211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016931	TAGT	2	8	7451	7458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016931	ATTG	2	8	7489	7496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016931	TTAC	2	8	8798	8805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016931	TTAC	2	8	12689	12696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016931	TTAT	2	8	12737	12744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016931	TAAT	2	8	15057	15064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016931	CATT	2	8	16450	16457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016931	AAAT	2	8	17229	17236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016931	TAAA	2	8	19219	19226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016931	ATTT	2	8	19245	19252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016931	CAAG	2	8	20922	20929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016931	AATA	2	8	22620	22627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016931	CGTT	2	8	22972	22979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016931	ATTA	2	8	23074	23081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016931	AGAT	2	8	24343	24350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016931	ATTT	2	8	25547	25554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016931	ATAA	2	8	29001	29008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016931	TAAT	2	8	29016	29023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016931	TTAA	2	8	29067	29074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016931	ATTT	2	8	30080	30087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016931	GAGT	2	8	30119	30126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016931	ATAA	2	8	30229	30236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016931	AGCA	2	8	30334	30341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016931	AGCA	2	8	30650	30657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016931	AGAT	2	8	30813	30820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016931	GAAA	2	8	31732	31739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016931	TTAA	2	8	31819	31826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016931	ACTT	2	8	31870	31877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016931	AACA	2	8	31907	31914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016931	TACT	2	8	32642	32649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016931	GTAA	2	8	35163	35170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016931	AAAT	2	8	35242	35249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016931	ACAT	2	8	35368	35375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016931	AACG	2	8	36402	36409	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016931	AAAT	2	8	36465	36472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016931	TGTA	2	8	36571	36578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016931	TAAA	2	8	36768	36775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016931	TAAA	2	8	36927	36934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016931	TCAT	2	8	37050	37057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016931	CTTT	2	8	37184	37191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016931	TTAG	2	8	37420	37427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016931	TCTT	2	8	37760	37767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016931	TAAA	2	8	41566	41573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016931	AAAC	2	8	41614	41621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016931	TTAT	2	8	41888	41895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016931	TACA	2	8	48033	48040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016931	TTAT	2	8	48390	48397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016931	TAAA	2	8	48500	48507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016931	AGCA	2	8	48711	48718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016931	AGTA	2	8	49140	49147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016931	AAAG	2	8	49155	49162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016931	TAAT	2	8	49611	49618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016931	ATTA	2	8	49882	49889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016931	AAAT	2	8	50169	50176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016931	GTAC	2	8	50556	50563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016931	TAAA	2	8	50595	50602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016931	GATA	2	8	50684	50691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016931	TAAA	2	8	50930	50937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016931	GCTA	2	8	50940	50947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016931	TAAT	2	8	52184	52191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016931	AATT	2	8	56757	56764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016931	CATA	2	8	59030	59037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016931	AATG	2	8	59458	59465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016931	CTGA	2	8	62301	62308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016931	ATTA	2	8	62982	62989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016931	TGCT	2	8	63105	63112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016931	GCTT	2	8	63233	63240	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016931	AAAT	2	8	64169	64176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016931	TACC	2	8	66257	66264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016931	AAAC	2	8	66265	66272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016931	TAAT	2	8	66341	66348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016931	AGTA	2	8	66434	66441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016931	CAAG	2	8	67304	67311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016931	CAAT	2	8	68060	68067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016931	AAAG	2	8	68818	68825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016931	ATTT	2	8	69393	69400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016931	AATC	2	8	69401	69408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016931	TAAT	2	8	69961	69968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016931	AATA	2	8	70195	70202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016931	TTTC	2	8	70207	70214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016931	ATCA	2	8	70944	70951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016931	TAAA	2	8	72563	72570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016931	AATT	2	8	72611	72618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016931	AATT	2	8	72634	72641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016931	AAAT	2	8	73948	73955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016931	ACGT	2	8	74030	74037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016931	TTAC	2	8	79704	79711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016931	TAAA	2	8	79742	79749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016931	GTAG	2	8	79813	79820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016931	ATTT	2	8	80333	80340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016931	ACTT	2	8	81679	81686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016931	TACC	2	8	84428	84435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016931	TTTG	2	8	85015	85022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016931	GTGA	2	8	85035	85042	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016931	TTTA	2	8	88940	88947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016931	TTTC	2	8	88965	88972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016931	TAAT	2	8	89090	89097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016931	CTTT	2	8	94761	94768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016931	TAAA	2	8	94838	94845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016931	ATAA	2	8	94876	94883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016931	CTTT	2	8	95124	95131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016931	GACA	2	8	96026	96033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016931	ACAT	2	8	99894	99901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016931	GCTT	2	8	101949	101956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016931	TGGA	2	8	102047	102054	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016931	TAAT	2	8	105093	105100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016931	AAAT	2	8	106678	106685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016931	TAAA	2	8	106926	106933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016931	TTTA	2	8	110107	110114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016931	AGCT	2	8	115795	115802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016931	AATA	3	12	116614	116625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016931	TAAT	2	8	117640	117647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016931	TATT	2	8	124383	124390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016931	TAAA	2	8	125741	125748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016931	ATTT	2	8	125771	125778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016931	TAAA	2	8	127413	127420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016931	ATTT	2	8	127457	127464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016931	TCTA	2	8	127479	127486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016931	TAAT	2	8	132571	132578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016931	TTTG	2	8	133395	133402	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016931	AAAT	2	8	135655	135662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016931	TCGC	2	8	149461	149468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016931	GAAG	2	8	153172	153179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016931	ATTA	2	8	153492	153499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016931	CGAT	2	8	153732	153739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016931	TAAT	2	8	153867	153874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016931	ATTT	2	8	154549	154556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016931	AGTG	2	8	154875	154882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016931	TTGC	2	8	155403	155410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016931	GAAG	2	8	155502	155509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016931	TCTA	2	8	167861	167868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016931	TTTA	2	8	167872	167879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016931	AAAT	2	8	177178	177185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016931	ATTA	2	8	178388	178395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016931	TTAA	2	8	180551	180558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016931	TCAA	2	8	181027	181034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016931	ATAA	2	8	181603	181610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016931	TCAG	2	8	181828	181835	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016931	CTAG	2	8	190627	190634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016931	TTAC	2	8	193684	193691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016931	GTTA	2	8	194684	194691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016931	TTTG	2	8	194875	194882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016931	AGTA	2	8	201052	201059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016931	ATTG	2	8	201196	201203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016931	CTTT	2	8	206152	206159	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016931	TTGA	2	8	206489	206496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016931	TTTA	2	8	207230	207237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016931	TATT	2	8	210220	210227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016931	TTAT	2	8	210267	210274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016931	TGAT	2	8	210296	210303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016931	ATTA	2	8	210327	210334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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