MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 2744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	ATTT	2	8	1454	1461	25 %	75 %	0 %	0 %	379713089
2	NC_016931	GAAA	2	8	1869	1876	75 %	0 %	25 %	0 %	379713090
3	NC_016931	TTAT	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	379713091
4	NC_016931	TTAT	2	8	2984	2991	25 %	75 %	0 %	0 %	379713091
5	NC_016931	CAAA	2	8	3413	3420	75 %	0 %	0 %	25 %	379713092
6	NC_016931	TATT	2	8	3680	3687	25 %	75 %	0 %	0 %	379713092
7	NC_016931	TCGC	2	8	3810	3817	0 %	25 %	25 %	50 %	379713092
8	NC_016931	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	379713092
9	NC_016931	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	379713092
10	NC_016931	AATT	2	8	5719	5726	50 %	50 %	0 %	0 %	379713092
11	NC_016931	ATTT	2	8	6291	6298	25 %	75 %	0 %	0 %	379713094
12	NC_016931	CTAT	2	8	8118	8125	25 %	50 %	0 %	25 %	379713095
13	NC_016931	AAAT	2	8	8190	8197	75 %	25 %	0 %	0 %	379713095
14	NC_016931	TAAA	2	8	9020	9027	75 %	25 %	0 %	0 %	379713096
15	NC_016931	CTAA	2	8	9156	9163	50 %	25 %	0 %	25 %	379713096
16	NC_016931	ATTA	2	8	9471	9478	50 %	50 %	0 %	0 %	379713096
17	NC_016931	ATAA	2	8	9566	9573	75 %	25 %	0 %	0 %	379713097
18	NC_016931	TACA	2	8	9808	9815	50 %	25 %	0 %	25 %	379713097
19	NC_016931	CAAG	2	8	10197	10204	50 %	0 %	25 %	25 %	379713097
20	NC_016931	TAAA	2	8	10614	10621	75 %	25 %	0 %	0 %	379713097
21	NC_016931	AAAT	2	8	10678	10685	75 %	25 %	0 %	0 %	379713097
22	NC_016931	ACTA	2	8	10768	10775	50 %	25 %	0 %	25 %	379713097
23	NC_016931	GTGA	2	8	10916	10923	25 %	25 %	50 %	0 %	379713097
24	NC_016931	ATTA	2	8	11134	11141	50 %	50 %	0 %	0 %	379713097
25	NC_016931	GTTT	2	8	12956	12963	0 %	75 %	25 %	0 %	379713099
26	NC_016931	AATT	2	8	13530	13537	50 %	50 %	0 %	0 %	379713100
27	NC_016931	CAAA	2	8	14458	14465	75 %	0 %	0 %	25 %	379713100
28	NC_016931	AATT	2	8	14720	14727	50 %	50 %	0 %	0 %	379713100
29	NC_016931	AGCA	2	8	15328	15335	50 %	0 %	25 %	25 %	379713102
30	NC_016931	ATGC	2	8	15555	15562	25 %	25 %	25 %	25 %	379713102
31	NC_016931	TTCC	2	8	15607	15614	0 %	50 %	0 %	50 %	379713102
32	NC_016931	TTAA	2	8	15663	15670	50 %	50 %	0 %	0 %	379713102
33	NC_016931	ATCT	2	8	15704	15711	25 %	50 %	0 %	25 %	379713102
34	NC_016931	AATT	2	8	17537	17544	50 %	50 %	0 %	0 %	379713105
35	NC_016931	CATA	2	8	17584	17591	50 %	25 %	0 %	25 %	379713105
36	NC_016931	ATCC	2	8	18310	18317	25 %	25 %	0 %	50 %	379713105
37	NC_016931	TAAG	2	8	18592	18599	50 %	25 %	25 %	0 %	379713105
38	NC_016931	CTTG	2	8	18635	18642	0 %	50 %	25 %	25 %	379713105
39	NC_016931	ATTC	2	8	18866	18873	25 %	50 %	0 %	25 %	379713105
40	NC_016931	TAAT	2	8	19694	19701	50 %	50 %	0 %	0 %	379713106
41	NC_016931	GACT	2	8	20183	20190	25 %	25 %	25 %	25 %	379713106
42	NC_016931	TTTA	2	8	21531	21538	25 %	75 %	0 %	0 %	379713108
43	NC_016931	CTTT	2	8	21598	21605	0 %	75 %	0 %	25 %	379713108
44	NC_016931	TTTC	2	8	21977	21984	0 %	75 %	0 %	25 %	379713109
45	NC_016931	ATAA	2	8	23333	23340	75 %	25 %	0 %	0 %	379713111
46	NC_016931	GGAT	2	8	23510	23517	25 %	25 %	50 %	0 %	379713111
47	NC_016931	TTTA	2	8	23647	23654	25 %	75 %	0 %	0 %	379713111
48	NC_016931	TTTA	2	8	23701	23708	25 %	75 %	0 %	0 %	379713111
49	NC_016931	AAGT	2	8	24192	24199	50 %	25 %	25 %	0 %	379713111
50	NC_016931	AAAG	2	8	24703	24710	75 %	0 %	25 %	0 %	379713112
51	NC_016931	AATA	2	8	25348	25355	75 %	25 %	0 %	0 %	379713112
52	NC_016931	TTAT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	379713112
53	NC_016931	CTTA	2	8	26031	26038	25 %	50 %	0 %	25 %	379713113
54	NC_016931	ATTT	2	8	26463	26470	25 %	75 %	0 %	0 %	379713114
55	NC_016931	CGGT	2	8	27182	27189	0 %	25 %	50 %	25 %	379713114
56	NC_016931	GCGG	2	8	27212	27219	0 %	0 %	75 %	25 %	379713114
57	NC_016931	CTCA	2	8	27978	27985	25 %	25 %	0 %	50 %	379713114
58	NC_016931	AGCA	2	8	28086	28093	50 %	0 %	25 %	25 %	379713114
59	NC_016931	ATAA	2	8	28168	28175	75 %	25 %	0 %	0 %	379713114
60	NC_016931	TTTA	2	8	28791	28798	25 %	75 %	0 %	0 %	379713114
61	NC_016931	GCAA	2	8	32276	32283	50 %	0 %	25 %	25 %	379713116
62	NC_016931	ATGT	2	8	32418	32425	25 %	50 %	25 %	0 %	379713117
63	NC_016931	ATTT	2	8	33405	33412	25 %	75 %	0 %	0 %	379713119
64	NC_016931	AATT	2	8	33793	33800	50 %	50 %	0 %	0 %	379713120
65	NC_016931	GATA	2	8	33818	33825	50 %	25 %	25 %	0 %	379713120
66	NC_016931	AAGA	2	8	34032	34039	75 %	0 %	25 %	0 %	379713120
67	NC_016931	AGGC	2	8	34376	34383	25 %	0 %	50 %	25 %	379713120
68	NC_016931	GCAA	2	8	37682	37689	50 %	0 %	25 %	25 %	379713121
69	NC_016931	AGTA	2	8	38018	38025	50 %	25 %	25 %	0 %	379713122
70	NC_016931	GCTT	2	8	38547	38554	0 %	50 %	25 %	25 %	379713123
71	NC_016931	AATT	2	8	38896	38903	50 %	50 %	0 %	0 %	379713123
72	NC_016931	GCTG	2	8	39513	39520	0 %	25 %	50 %	25 %	379713124
73	NC_016931	TCTA	2	8	39990	39997	25 %	50 %	0 %	25 %	379713124
74	NC_016931	CTTG	2	8	40474	40481	0 %	50 %	25 %	25 %	379713124
75	NC_016931	TAAA	2	8	41148	41155	75 %	25 %	0 %	0 %	379713125
76	NC_016931	GATA	2	8	41229	41236	50 %	25 %	25 %	0 %	379713125
77	NC_016931	AGCA	2	8	41298	41305	50 %	0 %	25 %	25 %	379713125
78	NC_016931	GTAA	2	8	42838	42845	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
79	NC_016931	AGAT	2	8	43098	43105	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
80	NC_016931	AGCA	2	8	43211	43218	50 %	0 %	25 %	25 %	379713126
81	NC_016931	ATTA	2	8	43774	43781	50 %	50 %	0 %	0 %	379713126
82	NC_016931	ATAG	2	8	43834	43841	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
83	NC_016931	GAAT	2	8	44321	44328	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
84	NC_016931	AATG	2	8	45840	45847	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
85	NC_016931	AAGT	2	8	46016	46023	50 %	25 %	25 %	0 %	379713126
86	NC_016931	AAAG	2	8	46132	46139	75 %	0 %	25 %	0 %	379713126
87	NC_016931	TTCA	2	8	46574	46581	25 %	50 %	0 %	25 %	379713126
88	NC_016931	AATA	2	8	47067	47074	75 %	25 %	0 %	0 %	379713126
89	NC_016931	TAAA	2	8	47213	47220	75 %	25 %	0 %	0 %	379713126
90	NC_016931	TTTA	2	8	47821	47828	25 %	75 %	0 %	0 %	379713127
91	NC_016931	AAAT	2	8	49854	49861	75 %	25 %	0 %	0 %	379713128
92	NC_016931	CTAT	2	8	51687	51694	25 %	50 %	0 %	25 %	379713130
93	NC_016931	ATTT	2	8	51730	51737	25 %	75 %	0 %	0 %	379713130
94	NC_016931	TGTC	2	8	51794	51801	0 %	50 %	25 %	25 %	379713130
95	NC_016931	ATAC	2	8	52266	52273	50 %	25 %	0 %	25 %	379713132
96	NC_016931	ATAA	2	8	52690	52697	75 %	25 %	0 %	0 %	379713132
97	NC_016931	CACT	2	8	52784	52791	25 %	25 %	0 %	50 %	379713132
98	NC_016931	TATT	2	8	53608	53615	25 %	75 %	0 %	0 %	379713134
99	NC_016931	TACC	2	8	55354	55361	25 %	25 %	0 %	50 %	379713136
100	NC_016931	GTTA	2	8	55736	55743	25 %	50 %	25 %	0 %	379713136
101	NC_016931	TTAG	2	8	57249	57256	25 %	50 %	25 %	0 %	379713138
102	NC_016931	TTGC	2	8	57544	57551	0 %	50 %	25 %	25 %	379713138
103	NC_016931	ACTA	2	8	57698	57705	50 %	25 %	0 %	25 %	379713138
104	NC_016931	TTCC	2	8	57784	57791	0 %	50 %	0 %	50 %	379713138
105	NC_016931	ATAA	2	8	60419	60426	75 %	25 %	0 %	0 %	379713139
106	NC_016931	AACA	2	8	60514	60521	75 %	0 %	0 %	25 %	379713139
107	NC_016931	AGCA	2	8	61252	61259	50 %	0 %	25 %	25 %	379713140
108	NC_016931	ATTG	2	8	62476	62483	25 %	50 %	25 %	0 %	379713142
109	NC_016931	TAAA	2	8	62637	62644	75 %	25 %	0 %	0 %	379713142
110	NC_016931	ATTT	2	8	62742	62749	25 %	75 %	0 %	0 %	379713142
111	NC_016931	ATTA	2	8	63738	63745	50 %	50 %	0 %	0 %	379713143
112	NC_016931	AAAT	2	8	63948	63955	75 %	25 %	0 %	0 %	379713143
113	NC_016931	TAAT	2	8	64049	64056	50 %	50 %	0 %	0 %	379713143
114	NC_016931	GAAA	2	8	64374	64381	75 %	0 %	25 %	0 %	379713144
115	NC_016931	ATTT	2	8	64418	64425	25 %	75 %	0 %	0 %	379713144
116	NC_016931	ACAA	2	8	64688	64695	75 %	0 %	0 %	25 %	379713144
117	NC_016931	AAAT	2	8	64892	64899	75 %	25 %	0 %	0 %	379713145
118	NC_016931	ATAA	2	8	65368	65375	75 %	25 %	0 %	0 %	379713145
119	NC_016931	ATGA	2	8	66522	66529	50 %	25 %	25 %	0 %	379713147
120	NC_016931	ATTC	2	8	66912	66919	25 %	50 %	0 %	25 %	379713147
121	NC_016931	CGCA	2	8	66957	66964	25 %	0 %	25 %	50 %	379713147
122	NC_016931	AACA	2	8	72092	72099	75 %	0 %	0 %	25 %	379713153
123	NC_016931	TAAT	2	8	73386	73393	50 %	50 %	0 %	0 %	379713155
124	NC_016931	AATC	2	8	73768	73775	50 %	25 %	0 %	25 %	379713155
125	NC_016931	CTAC	2	8	74808	74815	25 %	25 %	0 %	50 %	379713156
126	NC_016931	CTTT	2	8	75041	75048	0 %	75 %	0 %	25 %	379713157
127	NC_016931	GTTA	2	8	75065	75072	25 %	50 %	25 %	0 %	379713157
128	NC_016931	GCTT	2	8	75515	75522	0 %	50 %	25 %	25 %	379713157
129	NC_016931	ATTA	2	8	75659	75666	50 %	50 %	0 %	0 %	379713157
130	NC_016931	TAGA	2	8	76063	76070	50 %	25 %	25 %	0 %	379713157
131	NC_016931	TATT	2	8	76101	76108	25 %	75 %	0 %	0 %	379713158
132	NC_016931	CTAT	2	8	76463	76470	25 %	50 %	0 %	25 %	379713158
133	NC_016931	CTTT	2	8	76550	76557	0 %	75 %	0 %	25 %	379713158
134	NC_016931	CTGC	2	8	77093	77100	0 %	25 %	25 %	50 %	379713158
135	NC_016931	GGCA	2	8	77824	77831	25 %	0 %	50 %	25 %	379713159
136	NC_016931	ATCG	2	8	78058	78065	25 %	25 %	25 %	25 %	379713160
137	NC_016931	TAAT	2	8	78658	78665	50 %	50 %	0 %	0 %	379713160
138	NC_016931	ACAA	2	8	78693	78700	75 %	0 %	0 %	25 %	379713160
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