MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 19479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713088
2	NC_016931	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
3	NC_016931	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
4	NC_016931	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713088
5	NC_016931	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
6	NC_016931	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713088
7	NC_016931	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
8	NC_016931	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713088
9	NC_016931	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
10	NC_016931	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
11	NC_016931	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
12	NC_016931	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016931	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016931	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016931	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016931	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016931	ATA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713089
18	NC_016931	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713089
19	NC_016931	GTA	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713089
20	NC_016931	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713089
21	NC_016931	TAA	2	6	1448	1453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713089
22	NC_016931	TCT	2	6	1568	1573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713090
23	NC_016931	ATA	3	9	1832	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713090
24	NC_016931	GTA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713090
25	NC_016931	TGA	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713090
26	NC_016931	GAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713090
27	NC_016931	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713090
28	NC_016931	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713090
29	NC_016931	TTA	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713090
30	NC_016931	CAA	3	9	2203	2211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713090
31	NC_016931	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379713091
32	NC_016931	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713091
33	NC_016931	ATA	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
34	NC_016931	ATA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
35	NC_016931	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
36	NC_016931	ATG	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713091
37	NC_016931	TAT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713091
38	NC_016931	TTA	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713091
39	NC_016931	CTC	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713092
40	NC_016931	ATT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
41	NC_016931	ATT	2	6	3154	3159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
42	NC_016931	ATT	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
43	NC_016931	AGA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
44	NC_016931	AGA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
45	NC_016931	AGC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
46	NC_016931	TGC	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
47	NC_016931	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
48	NC_016931	GAG	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
49	NC_016931	TGA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
50	NC_016931	TAT	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
51	NC_016931	GCA	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
52	NC_016931	AGA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
53	NC_016931	CTA	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713092
54	NC_016931	TAT	2	6	4188	4193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
55	NC_016931	TTA	2	6	4194	4199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
56	NC_016931	TGT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713092
57	NC_016931	GGA	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
58	NC_016931	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
59	NC_016931	GGT	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713092
60	NC_016931	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
61	NC_016931	GGA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
62	NC_016931	GAA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
63	NC_016931	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
64	NC_016931	AAT	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
65	NC_016931	GAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
66	NC_016931	TAA	2	6	4850	4855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
67	NC_016931	GAG	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
68	NC_016931	GTG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713092
69	NC_016931	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
70	NC_016931	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
71	NC_016931	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
72	NC_016931	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
73	NC_016931	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
74	NC_016931	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
75	NC_016931	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
76	NC_016931	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
77	NC_016931	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713092
78	NC_016931	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
79	NC_016931	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713092
80	NC_016931	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713092
81	NC_016931	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
82	NC_016931	ATA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
83	NC_016931	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
84	NC_016931	ATA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
85	NC_016931	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
86	NC_016931	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
87	NC_016931	ATG	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
88	NC_016931	ATT	2	6	6008	6013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
89	NC_016931	GTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713093
90	NC_016931	CTT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713093
91	NC_016931	TAA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016931	CTT	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016931	GTT	2	6	6226	6231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713094
94	NC_016931	ATC	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713094
95	NC_016931	ACA	2	6	6451	6456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713094
96	NC_016931	AGC	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713094
97	NC_016931	CTA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713094
98	NC_016931	GTT	2	6	6635	6640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713094
99	NC_016931	TCA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713094
100	NC_016931	AGC	3	9	6732	6740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713094
101	NC_016931	ATT	2	6	6922	6927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713094
102	NC_016931	ATC	2	6	7112	7117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016931	AAG	2	6	7150	7155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016931	GCA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016931	TTA	3	9	7520	7528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016931	TAT	2	6	7610	7615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016931	CTT	2	6	7624	7629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016931	GGA	2	6	7647	7652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016931	GGA	2	6	7657	7662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016931	GCA	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016931	AAG	2	6	7756	7761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016931	GCT	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713095
113	NC_016931	GCA	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713095
114	NC_016931	ACA	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713095
115	NC_016931	GAT	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713095
116	NC_016931	GGA	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713095
117	NC_016931	TAA	2	6	8033	8038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713095
118	NC_016931	GAA	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713095
119	NC_016931	CAA	2	6	8097	8102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713095
120	NC_016931	ATA	2	6	8170	8175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713095
121	NC_016931	ATA	2	6	8276	8281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016931	ACA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016931	CTA	2	6	8379	8384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016931	TAT	2	6	8440	8445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016931	TGC	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016931	TCT	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016931	TCT	2	6	8690	8695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016931	AGC	2	6	8848	8853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016931	ATA	2	6	8876	8881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016931	ATT	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713096
131	NC_016931	CTA	2	6	9010	9015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713096
132	NC_016931	TAA	2	6	9182	9187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713096
133	NC_016931	ATA	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713096
134	NC_016931	ATA	2	6	9352	9357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713096
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261	NC_016931	TAT	2	6	18139	18144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713105
262	NC_016931	TCA	2	6	18354	18359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713105
263	NC_016931	ATA	2	6	18420	18425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713105
264	NC_016931	CAA	2	6	18496	18501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713105
265	NC_016931	AAG	2	6	18560	18565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713105
266	NC_016931	GGA	2	6	18582	18587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713105
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268	NC_016931	TTC	2	6	18674	18679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713105
269	NC_016931	ACT	2	6	18888	18893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713105
270	NC_016931	TCA	2	6	19029	19034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713105
271	NC_016931	TAT	2	6	19063	19068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713105
272	NC_016931	TTC	2	6	19069	19074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713105
273	NC_016931	TGC	2	6	19133	19138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713105
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276	NC_016931	ACT	2	6	19232	19237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_016931	ATA	2	6	19350	19355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713106
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283	NC_016931	ATT	2	6	19774	19779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713106
284	NC_016931	TTG	2	6	19909	19914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713106
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291	NC_016931	CTA	2	6	20198	20203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713106
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304	NC_016931	TTG	2	6	20788	20793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_016931	TAA	2	6	22613	22618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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